More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1387 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_1387  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  100 
 
 
699 aa  1422    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000012136  hitchhiker  2.22711e-21 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1211  penicillin-binding protein, transpeptidase  45.09 
 
 
692 aa  584  1.0000000000000001e-165  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000710719  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0328  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  38.31 
 
 
680 aa  475  1e-132  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0596019  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0183  penicillin-binding protein transpeptidase  39.79 
 
 
704 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2390  penicillin-binding protein transpeptidase  36.73 
 
 
709 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000174014  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4293  penicillin-binding protein  36.6 
 
 
706 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000011336 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4175  penicillin-binding protein  36.6 
 
 
706 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0925986  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2802  penicillin-binding protein 2  35.14 
 
 
717 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4497  penicillin-binding protein  36.6 
 
 
706 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1244  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  37.88 
 
 
688 aa  408  1.0000000000000001e-112  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3112  penicillin-binding protein  35.14 
 
 
717 aa  405  1e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.332065  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3113  penicillin-binding protein Pbp2b  34.99 
 
 
717 aa  404  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.593941  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3093  penicillin-binding protein  35.14 
 
 
717 aa  405  1e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2704  penicillin-binding protein  36.07 
 
 
697 aa  402  1e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2872  penicillin binding protein transpeptidase domain-containing protein  35.14 
 
 
717 aa  404  1e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.649717  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4389  penicillin-binding protein  36.08 
 
 
709 aa  405  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2842  penicillin-binding protein  35.14 
 
 
717 aa  404  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00031959  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4023  penicillin-binding protein  36.46 
 
 
706 aa  405  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2663  penicillin-binding protein  36.07 
 
 
708 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.272747  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4353  penicillin-binding protein  36.02 
 
 
706 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.600551  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2654  penicillin-binding protein  36.35 
 
 
708 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000363197 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0847  penicillin-binding protein  35.84 
 
 
708 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.393728 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4013  penicillin-binding protein  35.97 
 
 
708 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2664  penicillin-binding Protein dimerisation domain family  36.34 
 
 
708 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.633662  hitchhiker  0.0039278 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2660  penicillin-binding Protein dimerisation domain family  36.34 
 
 
708 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0891523  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4126  penicillin-binding protein transpeptidase  35.56 
 
 
710 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.141298  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4406  penicillin-binding protein  36.17 
 
 
706 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.796468  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2155  penicillin-binding protein  35.14 
 
 
717 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0385  penicillin-binding protein 2B  36.24 
 
 
720 aa  400  9.999999999999999e-111  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0192899  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2504  peptidoglycan glycosyltransferase  36.07 
 
 
708 aa  396  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0781063  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2864  penicillin-binding protein transpeptidase  35.14 
 
 
712 aa  397  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.928937  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3001  penicillin-binding protein transpeptidase  34.78 
 
 
705 aa  398  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3080  penicillin-binding protein  35.14 
 
 
717 aa  399  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2457  penicillin-binding protein  35.93 
 
 
708 aa  395  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2420  penicillin-binding protein transpeptidase domain-containing protein  35.93 
 
 
708 aa  395  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.164816  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2381  penicillin-binding protein transpeptidase domain-containing protein  35.79 
 
 
708 aa  395  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.170491  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2821  penicillin-binding protein  35.43 
 
 
710 aa  392  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000333362 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2637  penicillin-binding protein  35.93 
 
 
708 aa  395  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.722819  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2330  penicillin-binding protein transpeptidase  35.64 
 
 
711 aa  395  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0681332  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2538  penicillin-binding protein Pbp2b  35.29 
 
 
707 aa  392  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00452146  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2290  penicillin-binding protein  35.15 
 
 
710 aa  392  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0186276  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2246  penicillin-binding protein 2  35.01 
 
 
708 aa  390  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.216847  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2521  penicillin-binding protein  35.15 
 
 
710 aa  390  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000182518 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2594  penicillin-binding protein  35.29 
 
 
710 aa  390  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.754581  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2502  penicillin-binding protein  35.42 
 
 
710 aa  388  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0765  penicillin-binding protein 2b  34.25 
 
 
681 aa  369  1e-101  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.108531  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1610  penicillin-binding protein 3  34.55 
 
 
691 aa  365  2e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.257106  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1644  penicillin-binding protein 3  34.55 
 
 
691 aa  365  2e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.2124  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0662  penicillin-binding protein 2B  34.79 
 
 
704 aa  352  1e-95  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.352092  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1117  penicillin-binding protein 3  34.78 
 
 
696 aa  342  2e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.117713  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2327  penicillin-binding protein, C-terminal  36.79 
 
 
583 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0222692  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0091  peptidoglycan glycosyltransferase  23.06 
 
 
709 aa  153  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371789  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14210  Peptidoglycan glycosyltransferase  25.11 
 
 
671 aa  151  4e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000118475  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2430  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.14 
 
 
695 aa  150  5e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1463  peptidoglycan glycosyltransferase  23.51 
 
 
655 aa  142  1.9999999999999998e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37559  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1304  penicillin-binding protein 2  22.97 
 
 
701 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000662569  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1974  penicillin-binding protein 2  26.85 
 
 
626 aa  140  1e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0294  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.01 
 
 
694 aa  137  6.0000000000000005e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.560921  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  28.26 
 
 
646 aa  132  3e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2332  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.44 
 
 
705 aa  132  3e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.957616  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  25.34 
 
 
645 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2560  penicillin-binding protein 2  25.97 
 
 
700 aa  124  7e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000981349  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0864  penicillin-binding protein 2  25.91 
 
 
641 aa  121  4.9999999999999996e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  24.62 
 
 
646 aa  120  7.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  24.42 
 
 
633 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0172  peptidoglycan glycosyltransferase  26.8 
 
 
630 aa  119  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.82525  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1372  penicillin-binding protein 2  23.16 
 
 
596 aa  117  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0820  peptidoglycan glycosyltransferase  28.42 
 
 
705 aa  116  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0540  peptidoglycan glycosyltransferase  26.69 
 
 
689 aa  115  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.725377 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2706  Peptidoglycan glycosyltransferase  23.53 
 
 
689 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0219846  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  27.62 
 
 
634 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5104  peptidoglycan glycosyltransferase  30.61 
 
 
839 aa  114  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0680145  normal  0.0778516 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2195  penicillin-binding protein 2  22.84 
 
 
602 aa  113  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000139348 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2565  penicillin-binding protein 2  22.84 
 
 
602 aa  113  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0518  penicillin-binding protein 2  22.48 
 
 
625 aa  113  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000002903 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0769  penicillin-binding protein 2  26.58 
 
 
644 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.116672  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0571  peptidoglycan glycosyltransferase  27.55 
 
 
634 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.784328  normal  0.541139 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1164  penicillin-binding protein 2  23.91 
 
 
647 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2711  Peptidoglycan glycosyltransferase  25.76 
 
 
618 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1106  penicillin-binding protein 2  25.83 
 
 
646 aa  111  5e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0664  penicillin-binding protein  25.35 
 
 
612 aa  111  5e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164685  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0817  peptidoglycan glycosyltransferase  25.61 
 
 
643 aa  111  6e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171924  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  26.18 
 
 
643 aa  110  6e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1513  cell elongation specific D,D-transpeptidase  25.55 
 
 
615 aa  111  6e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0564593  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2661  penicillin-binding protein 2  23.17 
 
 
667 aa  110  7.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.148339 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1112  peptidoglycan glycosyltransferase  24.95 
 
 
553 aa  110  8.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0521932  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0837  stage V sporulation protein D  24.02 
 
 
711 aa  109  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.677302 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1008  peptidoglycan glycosyltransferase  24.71 
 
 
640 aa  108  3e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1638  peptidoglycan glycosyltransferase  23.05 
 
 
703 aa  108  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0646938  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3687  penicillin-binding protein 2  26.24 
 
 
801 aa  108  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.955324  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1280  peptidoglycan glycosyltransferase  26.71 
 
 
888 aa  108  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.547903  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  25.65 
 
 
657 aa  108  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3364  penicillin-binding protein 2  26.24 
 
 
801 aa  107  8e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0167  putative penicillin-binding protein  25.2 
 
 
803 aa  106  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.900799  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1271  penicillin-binding protein 2  23.82 
 
 
627 aa  105  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1633  peptidoglycan glycosyltransferase  26.57 
 
 
607 aa  105  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113287  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2165  penicillin-binding protein 2  25.56 
 
 
655 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.574544 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12060  penicillin-binding protein 2  25.1 
 
 
646 aa  106  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  24.39 
 
 
640 aa  106  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0263  peptidoglycan glycosyltransferase  25.64 
 
 
630 aa  105  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>