More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2390 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011725  BCB4264_A2660  penicillin-binding Protein dimerisation domain family  53.8 
 
 
708 aa  746    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0891523  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0847  penicillin-binding protein  56.25 
 
 
708 aa  781    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.393728 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3080  penicillin-binding protein  52.09 
 
 
717 aa  729    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2538  penicillin-binding protein Pbp2b  51.98 
 
 
707 aa  731    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00452146  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2663  penicillin-binding protein  54.01 
 
 
708 aa  736    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.272747  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2821  penicillin-binding protein  52.48 
 
 
710 aa  734    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000333362 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3113  penicillin-binding protein Pbp2b  52.37 
 
 
717 aa  735    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.593941  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4353  penicillin-binding protein  57.04 
 
 
706 aa  783    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.600551  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3093  penicillin-binding protein  52.52 
 
 
717 aa  738    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2664  penicillin-binding Protein dimerisation domain family  53.94 
 
 
708 aa  746    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.633662  hitchhiker  0.0039278 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2457  penicillin-binding protein  53.4 
 
 
708 aa  734    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2872  penicillin binding protein transpeptidase domain-containing protein  52.37 
 
 
717 aa  736    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.649717  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4175  penicillin-binding protein  56.45 
 
 
706 aa  774    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0925986  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4389  penicillin-binding protein  56.6 
 
 
709 aa  786    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2290  penicillin-binding protein  52.19 
 
 
710 aa  731    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0186276  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2420  penicillin-binding protein transpeptidase domain-containing protein  53.4 
 
 
708 aa  733    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.164816  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2842  penicillin-binding protein  52.52 
 
 
717 aa  738    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00031959  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4013  penicillin-binding protein  56.14 
 
 
708 aa  770    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2246  penicillin-binding protein 2  51.77 
 
 
708 aa  726    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.216847  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2381  penicillin-binding protein transpeptidase domain-containing protein  54.15 
 
 
708 aa  736    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.170491  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2802  penicillin-binding protein 2  52.66 
 
 
717 aa  739    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4023  penicillin-binding protein  56.6 
 
 
706 aa  775    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4406  penicillin-binding protein  56.3 
 
 
706 aa  777    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.796468  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2654  penicillin-binding protein  53.4 
 
 
708 aa  732    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000363197 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2521  penicillin-binding protein  52.48 
 
 
710 aa  730    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000182518 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4126  penicillin-binding protein transpeptidase  57.47 
 
 
710 aa  783    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.141298  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4293  penicillin-binding protein  56.6 
 
 
706 aa  775    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000011336 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0183  penicillin-binding protein transpeptidase  82.32 
 
 
704 aa  1132    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2330  penicillin-binding protein transpeptidase  52.48 
 
 
711 aa  740    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0681332  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2637  penicillin-binding protein  53.4 
 
 
708 aa  734    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.722819  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2502  penicillin-binding protein  52.5 
 
 
710 aa  729    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4497  penicillin-binding protein  56.45 
 
 
706 aa  774    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2594  penicillin-binding protein  52.48 
 
 
710 aa  731    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.754581  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3112  penicillin-binding protein  52.52 
 
 
717 aa  738    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.332065  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2390  penicillin-binding protein transpeptidase  100 
 
 
709 aa  1451    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000174014  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3001  penicillin-binding protein transpeptidase  57.27 
 
 
705 aa  789    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2704  penicillin-binding protein  53.72 
 
 
697 aa  734    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2504  peptidoglycan glycosyltransferase  54.79 
 
 
708 aa  747    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0781063  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2864  penicillin-binding protein transpeptidase  52.67 
 
 
712 aa  729    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.928937  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2155  penicillin-binding protein  51.94 
 
 
717 aa  729    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2327  penicillin-binding protein, C-terminal  54.73 
 
 
583 aa  625  1e-177  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0222692  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1644  penicillin-binding protein 3  43.15 
 
 
691 aa  541  9.999999999999999e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.2124  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1610  penicillin-binding protein 3  43.15 
 
 
691 aa  541  9.999999999999999e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.257106  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1117  penicillin-binding protein 3  43.02 
 
 
696 aa  514  1e-144  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.117713  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1387  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  36.73 
 
 
699 aa  440  9.999999999999999e-123  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000012136  hitchhiker  2.22711e-21 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1211  penicillin-binding protein, transpeptidase  34.9 
 
 
692 aa  377  1e-103  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000710719  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0328  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  33.67 
 
 
680 aa  358  1.9999999999999998e-97  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0596019  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0385  penicillin-binding protein 2B  29.49 
 
 
720 aa  311  2e-83  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0192899  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0765  penicillin-binding protein 2b  31.29 
 
 
681 aa  303  1e-80  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.108531  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0662  penicillin-binding protein 2B  31.46 
 
 
704 aa  301  4e-80  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.352092  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1244  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  31.2 
 
 
688 aa  268  2.9999999999999995e-70  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0091  peptidoglycan glycosyltransferase  29.51 
 
 
709 aa  211  3e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371789  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1304  penicillin-binding protein 2  26.58 
 
 
701 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000662569  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2430  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.37 
 
 
695 aa  185  3e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0294  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.08 
 
 
694 aa  179  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.560921  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2332  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.9 
 
 
705 aa  168  2.9999999999999998e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.957616  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14210  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.49 
 
 
671 aa  159  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000118475  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2560  penicillin-binding protein 2  26.65 
 
 
700 aa  157  5.0000000000000005e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000981349  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1092  penicillin-binding protein 2  27.39 
 
 
634 aa  154  7e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2313  peptidoglycan glycosyltransferase  25.31 
 
 
629 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.124317  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  24.97 
 
 
629 aa  153  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2509  penicillin-binding protein  25.17 
 
 
629 aa  152  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.741152  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3453  peptidoglycan glycosyltransferase  24.82 
 
 
618 aa  150  7e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00243084  hitchhiker  0.00384932 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1092  penicillin-binding protein 2  24.82 
 
 
618 aa  150  7e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000952492  hitchhiker  0.000000109983 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3275  peptidoglycan glycosyltransferase  24.82 
 
 
618 aa  150  7e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000207443  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3317  peptidoglycan glycosyltransferase  24.82 
 
 
618 aa  150  7e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000142864  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  24.31 
 
 
629 aa  148  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0682  penicillin-binding protein 2  26.93 
 
 
633 aa  147  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000220235  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0756  penicillin-binding protein 2  26.93 
 
 
633 aa  147  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151758  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0742  penicillin-binding protein 2  26.93 
 
 
633 aa  147  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.302066  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0696  penicillin-binding protein 2  26.93 
 
 
633 aa  147  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.982712  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0800  penicillin-binding protein 2  26.93 
 
 
633 aa  147  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.590609  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  24.28 
 
 
629 aa  147  6e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  26.41 
 
 
636 aa  147  6e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  24.9 
 
 
631 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  24.28 
 
 
629 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0263  peptidoglycan glycosyltransferase  26.38 
 
 
630 aa  146  1e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1106  penicillin-binding protein 2  24.5 
 
 
646 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0104  penicillin-binding protein 2  25.22 
 
 
599 aa  144  4e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.14442  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1560  peptidoglycan glycosyltransferase  24.29 
 
 
643 aa  143  9e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12060  penicillin-binding protein 2  24.39 
 
 
646 aa  143  9e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0616  penicillin-binding protein 2  26.57 
 
 
633 aa  143  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054384  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00604  transpeptidase involved in peptidoglycan synthesis (penicillin-binding protein 2)  26.57 
 
 
633 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0219544  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2991  penicillin-binding protein 2  26.57 
 
 
633 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000298209  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3010  penicillin-binding protein 2  26.57 
 
 
633 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000210034  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0655  penicillin-binding protein 2  26.57 
 
 
633 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000471681  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00593  hypothetical protein  26.57 
 
 
633 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0186683  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3903  peptidoglycan glycosyltransferase  24.44 
 
 
630 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0661  penicillin-binding protein 2  26.57 
 
 
633 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000749016  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0724  penicillin-binding protein 2  26.57 
 
 
633 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000167121  normal  0.141878 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0687  penicillin-binding protein 2  26.57 
 
 
633 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000614363  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  26.32 
 
 
643 aa  142  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1201  penicillin-binding protein 2  24.12 
 
 
631 aa  141  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.621118  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  26.7 
 
 
647 aa  142  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1138  peptidoglycan glycosyltransferase  26.36 
 
 
687 aa  141  4.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2356  peptidoglycan glycosyltransferase  25.34 
 
 
641 aa  141  4.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0995  peptidoglycan glycosyltransferase  24.37 
 
 
618 aa  141  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000900115  normal  0.206093 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  26.9 
 
 
645 aa  140  6e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0991  peptidoglycan glycosyltransferase  24.51 
 
 
618 aa  140  7.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000594498  normal  0.0491088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  24.51 
 
 
618 aa  140  7.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0906078  hitchhiker  0.0072323 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>