More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_3113 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_4126  penicillin-binding protein transpeptidase  61.25 
 
 
710 aa  896    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.141298  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2864  penicillin-binding protein transpeptidase  91.43 
 
 
712 aa  1336    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.928937  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2538  penicillin-binding protein Pbp2b  67.29 
 
 
707 aa  1003    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00452146  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2663  penicillin-binding protein  69.46 
 
 
708 aa  1043    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.272747  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4293  penicillin-binding protein  60.52 
 
 
706 aa  875    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000011336 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3113  penicillin-binding protein Pbp2b  100 
 
 
717 aa  1476    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.593941  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4353  penicillin-binding protein  60.81 
 
 
706 aa  881    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.600551  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2327  penicillin-binding protein, C-terminal  69.76 
 
 
583 aa  838    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0222692  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2457  penicillin-binding protein  69.77 
 
 
708 aa  1035    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2872  penicillin binding protein transpeptidase domain-containing protein  98.47 
 
 
717 aa  1457    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.649717  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4175  penicillin-binding protein  60.38 
 
 
706 aa  874    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0925986  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2290  penicillin-binding protein  67.29 
 
 
710 aa  994    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0186276  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2420  penicillin-binding protein transpeptidase domain-containing protein  69.77 
 
 
708 aa  1034    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.164816  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2842  penicillin-binding protein  98.74 
 
 
717 aa  1460    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00031959  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4013  penicillin-binding protein  60 
 
 
708 aa  870    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2246  penicillin-binding protein 2  67 
 
 
708 aa  990    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.216847  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2381  penicillin-binding protein transpeptidase domain-containing protein  69.18 
 
 
708 aa  1037    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.170491  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4406  penicillin-binding protein  60.67 
 
 
706 aa  881    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.796468  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2802  penicillin-binding protein 2  98.74 
 
 
717 aa  1460    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4023  penicillin-binding protein  60.67 
 
 
706 aa  879    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2660  penicillin-binding Protein dimerisation domain family  71.49 
 
 
708 aa  1055    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0891523  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0847  penicillin-binding protein  61.3 
 
 
708 aa  892    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.393728 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2521  penicillin-binding protein  67.43 
 
 
710 aa  997    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000182518 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2637  penicillin-binding protein  69.77 
 
 
708 aa  1035    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.722819  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4497  penicillin-binding protein  60.38 
 
 
706 aa  874    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2664  penicillin-binding Protein dimerisation domain family  71.49 
 
 
708 aa  1053    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.633662  hitchhiker  0.0039278 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3080  penicillin-binding protein  94.28 
 
 
717 aa  1375    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2504  peptidoglycan glycosyltransferase  71.06 
 
 
708 aa  1051    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0781063  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3112  penicillin-binding protein  98.61 
 
 
717 aa  1461    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.332065  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4389  penicillin-binding protein  60.77 
 
 
709 aa  889    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2821  penicillin-binding protein  66.71 
 
 
710 aa  997    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000333362 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2502  penicillin-binding protein  66.62 
 
 
710 aa  986    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2704  penicillin-binding protein  69.63 
 
 
697 aa  1037    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2155  penicillin-binding protein  94.56 
 
 
717 aa  1379    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3093  penicillin-binding protein  98.74 
 
 
717 aa  1461    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2330  penicillin-binding protein transpeptidase  66.48 
 
 
711 aa  1009    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0681332  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2654  penicillin-binding protein  69.63 
 
 
708 aa  1032    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000363197 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3001  penicillin-binding protein transpeptidase  61.84 
 
 
705 aa  881    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0183  penicillin-binding protein transpeptidase  54.38 
 
 
704 aa  721    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2390  penicillin-binding protein transpeptidase  52.43 
 
 
709 aa  741    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000174014  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2594  penicillin-binding protein  67 
 
 
710 aa  999    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.754581  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1610  penicillin-binding protein 3  42.54 
 
 
691 aa  534  1e-150  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.257106  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1644  penicillin-binding protein 3  42.54 
 
 
691 aa  534  1e-150  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.2124  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1117  penicillin-binding protein 3  43.72 
 
 
696 aa  515  1e-144  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.117713  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1387  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  34.92 
 
 
699 aa  396  1e-109  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000012136  hitchhiker  2.22711e-21 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1211  penicillin-binding protein, transpeptidase  34.46 
 
 
692 aa  362  2e-98  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000710719  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0765  penicillin-binding protein 2b  31.02 
 
 
681 aa  317  6e-85  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.108531  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0328  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  30.88 
 
 
680 aa  311  2.9999999999999997e-83  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0596019  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0385  penicillin-binding protein 2B  30.24 
 
 
720 aa  297  4e-79  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0192899  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0662  penicillin-binding protein 2B  32.15 
 
 
704 aa  290  9e-77  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.352092  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1244  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  30.92 
 
 
688 aa  264  4e-69  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0091  peptidoglycan glycosyltransferase  27.96 
 
 
709 aa  196  1e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371789  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1304  penicillin-binding protein 2  26.2 
 
 
701 aa  189  2e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000662569  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0518  penicillin-binding protein 2  26.39 
 
 
625 aa  172  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000002903 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2430  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.9 
 
 
695 aa  167  6.9999999999999995e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  26.16 
 
 
633 aa  166  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2313  peptidoglycan glycosyltransferase  25.7 
 
 
629 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.124317  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2509  penicillin-binding protein  25.56 
 
 
629 aa  161  4e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.741152  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0294  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.96 
 
 
694 aa  160  5e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.560921  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  28.6 
 
 
639 aa  160  7e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3341  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase / peptidoglycan glycosyltransferase  25.46 
 
 
619 aa  159  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.198786  normal  0.0253146 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  25.28 
 
 
629 aa  157  7e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  29.14 
 
 
636 aa  157  7e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14210  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.91 
 
 
671 aa  157  8e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000118475  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  25.18 
 
 
629 aa  156  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2326  penicillin-binding protein, N-terminal  55.91 
 
 
129 aa  156  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.620628  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1271  penicillin-binding protein 2  27.96 
 
 
627 aa  155  2e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  28.93 
 
 
645 aa  155  2.9999999999999998e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  24.89 
 
 
629 aa  154  4e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2332  Peptidoglycan glycosyltransferase  25.91 
 
 
705 aa  154  4e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.957616  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  24.36 
 
 
631 aa  154  8e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004222  penicillin-binding protein 2 (PBP-2)  23.94 
 
 
638 aa  153  8.999999999999999e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000026113  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1008  peptidoglycan glycosyltransferase  24.14 
 
 
640 aa  152  2e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  24.89 
 
 
629 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2935  peptidoglycan glycosyltransferase  28.42 
 
 
627 aa  152  3e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0357968  normal  0.0108979 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2560  penicillin-binding protein 2  26.29 
 
 
700 aa  151  4e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000981349  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  28.89 
 
 
643 aa  151  4e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  29.75 
 
 
647 aa  150  6e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01217  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  24.18 
 
 
641 aa  150  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3708  penicillin-binding protein 2  23.97 
 
 
610 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000241854  decreased coverage  0.000000426063 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1560  peptidoglycan glycosyltransferase  24.76 
 
 
643 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2661  penicillin-binding protein 2  24.47 
 
 
667 aa  148  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.148339 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  23.97 
 
 
645 aa  148  3e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3903  peptidoglycan glycosyltransferase  24.86 
 
 
630 aa  147  6e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1092  penicillin-binding protein 2  25.83 
 
 
634 aa  146  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3798  peptidoglycan glycosyltransferase  24.06 
 
 
630 aa  146  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.624413  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4365  peptidoglycan glycosyltransferase  24.09 
 
 
631 aa  146  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.710659  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  29.09 
 
 
640 aa  145  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2949  penicillin-binding protein 2  25.1 
 
 
631 aa  144  7e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.151032  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2165  penicillin-binding protein 2  25.27 
 
 
655 aa  144  7e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.574544 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1607  peptidoglycan glycosyltransferase  22.94 
 
 
650 aa  143  9e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.188503  normal  0.818335 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0297  peptidoglycan glycosyltransferase  24.26 
 
 
648 aa  143  9e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4825  penicillin-binding protein  23.78 
 
 
631 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.436079  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1106  penicillin-binding protein 2  25.04 
 
 
646 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1849  penicillin-binding protein 2  25.24 
 
 
631 aa  143  9.999999999999999e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3060  penicillin-binding protein 2  25.34 
 
 
630 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.569181  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3741  penicillin-binding protein 2  25.2 
 
 
631 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3021  penicillin-binding protein 2  25.1 
 
 
631 aa  142  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00366199  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1633  peptidoglycan glycosyltransferase  28.41 
 
 
607 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113287  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0699  peptidoglycan glycosyltransferase  23.73 
 
 
618 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00364586  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>