More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1211 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1211  penicillin-binding protein, transpeptidase  100 
 
 
692 aa  1421    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000710719  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1387  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  45.09 
 
 
699 aa  572  1e-161  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000012136  hitchhiker  2.22711e-21 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0328  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  44.28 
 
 
680 aa  529  1e-149  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0596019  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1244  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  40.06 
 
 
688 aa  432  1e-120  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0385  penicillin-binding protein 2B  35.4 
 
 
720 aa  382  1e-104  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0192899  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2390  penicillin-binding protein transpeptidase  34.9 
 
 
709 aa  377  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000174014  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2663  penicillin-binding protein  34.72 
 
 
708 aa  370  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.272747  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4175  penicillin-binding protein  34.96 
 
 
706 aa  372  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0925986  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4497  penicillin-binding protein  34.96 
 
 
706 aa  372  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4293  penicillin-binding protein  34.96 
 
 
706 aa  372  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000011336 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0183  penicillin-binding protein transpeptidase  35.54 
 
 
704 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2704  penicillin-binding protein  34.15 
 
 
697 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4406  penicillin-binding protein  35.24 
 
 
706 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.796468  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4353  penicillin-binding protein  34.81 
 
 
706 aa  369  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.600551  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4023  penicillin-binding protein  34.62 
 
 
706 aa  368  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2381  penicillin-binding protein transpeptidase domain-containing protein  34.15 
 
 
708 aa  366  1e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.170491  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2457  penicillin-binding protein  34 
 
 
708 aa  364  3e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2637  penicillin-binding protein  34 
 
 
708 aa  364  3e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.722819  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2654  penicillin-binding protein  34 
 
 
708 aa  364  3e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000363197 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2420  penicillin-binding protein transpeptidase domain-containing protein  34 
 
 
708 aa  363  4e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.164816  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3001  penicillin-binding protein transpeptidase  34.87 
 
 
705 aa  363  7.0000000000000005e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4126  penicillin-binding protein transpeptidase  34.24 
 
 
710 aa  363  8e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.141298  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2664  penicillin-binding Protein dimerisation domain family  34.76 
 
 
708 aa  359  7e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.633662  hitchhiker  0.0039278 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0847  penicillin-binding protein  34.24 
 
 
708 aa  359  8e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.393728 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2504  peptidoglycan glycosyltransferase  35.03 
 
 
708 aa  359  9e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0781063  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2246  penicillin-binding protein 2  33.85 
 
 
708 aa  359  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.216847  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3093  penicillin-binding protein  34.58 
 
 
717 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3113  penicillin-binding protein Pbp2b  34.39 
 
 
717 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.593941  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2872  penicillin binding protein transpeptidase domain-containing protein  34.58 
 
 
717 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.649717  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2290  penicillin-binding protein  33.85 
 
 
710 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0186276  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2842  penicillin-binding protein  34.58 
 
 
717 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00031959  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3112  penicillin-binding protein  34.58 
 
 
717 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.332065  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2660  penicillin-binding Protein dimerisation domain family  34.48 
 
 
708 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0891523  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2802  penicillin-binding protein 2  34.1 
 
 
717 aa  357  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2821  penicillin-binding protein  33.85 
 
 
710 aa  357  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000333362 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4389  penicillin-binding protein  34.19 
 
 
709 aa  357  5e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2594  penicillin-binding protein  34 
 
 
710 aa  355  2e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.754581  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4013  penicillin-binding protein  33.91 
 
 
708 aa  354  2e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2538  penicillin-binding protein Pbp2b  33.57 
 
 
707 aa  354  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00452146  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2330  penicillin-binding protein transpeptidase  33.9 
 
 
711 aa  354  2.9999999999999997e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0681332  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2155  penicillin-binding protein  34.01 
 
 
717 aa  353  4e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2502  penicillin-binding protein  33.91 
 
 
710 aa  353  5e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3080  penicillin-binding protein  34.01 
 
 
717 aa  352  1e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2521  penicillin-binding protein  34 
 
 
710 aa  352  2e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000182518 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2864  penicillin-binding protein transpeptidase  34.44 
 
 
712 aa  350  5e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.928937  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0662  penicillin-binding protein 2B  34.24 
 
 
704 aa  317  5e-85  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.352092  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1610  penicillin-binding protein 3  33.43 
 
 
691 aa  315  1.9999999999999998e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.257106  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1644  penicillin-binding protein 3  33.43 
 
 
691 aa  315  1.9999999999999998e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.2124  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0765  penicillin-binding protein 2b  31.12 
 
 
681 aa  309  1.0000000000000001e-82  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.108531  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2327  penicillin-binding protein, C-terminal  36.56 
 
 
583 aa  293  6e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0222692  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1117  penicillin-binding protein 3  32.6 
 
 
696 aa  283  6.000000000000001e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.117713  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0091  peptidoglycan glycosyltransferase  25.42 
 
 
709 aa  151  5e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371789  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0571  peptidoglycan glycosyltransferase  27.95 
 
 
634 aa  148  3e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.784328  normal  0.541139 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2332  Peptidoglycan glycosyltransferase  25.39 
 
 
705 aa  143  9.999999999999999e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.957616  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2560  penicillin-binding protein 2  24.65 
 
 
700 aa  142  3e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000981349  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  28.01 
 
 
646 aa  142  3e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0294  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.36 
 
 
694 aa  141  4.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.560921  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2430  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.26 
 
 
695 aa  140  6e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0769  penicillin-binding protein 2  27.75 
 
 
644 aa  137  6.0000000000000005e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.116672  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1304  penicillin-binding protein 2  24.12 
 
 
701 aa  130  8.000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000662569  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1106  penicillin-binding protein 2  26.77 
 
 
646 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14210  Peptidoglycan glycosyltransferase  24.38 
 
 
671 aa  125  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000118475  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  24.46 
 
 
643 aa  124  4e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1164  penicillin-binding protein 2  25.08 
 
 
647 aa  124  5e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0817  peptidoglycan glycosyltransferase  27.74 
 
 
643 aa  124  6e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171924  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1112  peptidoglycan glycosyltransferase  28.93 
 
 
553 aa  124  7e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0521932  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12060  penicillin-binding protein 2  26.18 
 
 
646 aa  124  8e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2477  peptidoglycan glycosyltransferase  27.46 
 
 
651 aa  123  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.686042  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1372  penicillin-binding protein 2  27.47 
 
 
596 aa  121  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2313  peptidoglycan glycosyltransferase  23.36 
 
 
629 aa  120  6e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.124317  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  22.95 
 
 
631 aa  120  6e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3903  peptidoglycan glycosyltransferase  23.98 
 
 
630 aa  120  9e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4365  peptidoglycan glycosyltransferase  23.45 
 
 
631 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.710659  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  24.95 
 
 
640 aa  120  9.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4825  penicillin-binding protein  23.3 
 
 
631 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.436079  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  27.69 
 
 
646 aa  119  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3798  peptidoglycan glycosyltransferase  22.63 
 
 
630 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.624413  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6464  peptidoglycan glycosyltransferase  23.61 
 
 
761 aa  119  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1607  peptidoglycan glycosyltransferase  23.84 
 
 
650 aa  118  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.188503  normal  0.818335 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1624  penicillin-binding protein 2  25.21 
 
 
738 aa  118  3.9999999999999997e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0864  penicillin-binding protein 2  27.13 
 
 
641 aa  118  5e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  26.07 
 
 
610 aa  117  6e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  23.78 
 
 
639 aa  117  7.999999999999999e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2509  penicillin-binding protein  23.19 
 
 
629 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.741152  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3168  peptidoglycan glycosyltransferase  23.74 
 
 
764 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00456215  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3110  penicillin-binding protein 2  23.83 
 
 
775 aa  115  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2499  peptidoglycan glycosyltransferase  23.7 
 
 
765 aa  115  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3129  penicillin-binding protein 2  23.7 
 
 
760 aa  115  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3113  peptidoglycan glycosyltransferase  23.7 
 
 
765 aa  115  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.527872  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3051  penicillin-binding protein 2  23.84 
 
 
756 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0136763  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0143  penicillin-binding protein 2  23.78 
 
 
802 aa  114  5e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0145949  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0363  penicillin-binding protein 2  23.78 
 
 
803 aa  114  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0178  putative penicillin-binding protein  23.78 
 
 
809 aa  114  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2566  peptidoglycan glycosyltransferase  28.91 
 
 
717 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2291  penicillin-binding protein 2  23.68 
 
 
802 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396249  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0167  putative penicillin-binding protein  23.65 
 
 
803 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.900799  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0159  penicillin-binding protein 2  23.68 
 
 
802 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.799571  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2371  penicillin-binding protein 2  23.68 
 
 
802 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.4187  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0297  peptidoglycan glycosyltransferase  25.7 
 
 
648 aa  113  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2788  penicillin-binding protein 2  23.68 
 
 
802 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>