More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0183 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_2330  penicillin-binding protein transpeptidase  52.48 
 
 		 711 aa  738    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0681332  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3093  penicillin-binding protein  54.69 
 
 		 717 aa  754    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0183  penicillin-binding protein transpeptidase  100 
 
 		 704 aa  1440    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2538  penicillin-binding protein Pbp2b  52.55 
 
 		 707 aa  734    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00452146  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2663  penicillin-binding protein  54.76 
 
 		 708 aa  746    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.272747  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3113  penicillin-binding protein Pbp2b  54.4 
 
 		 717 aa  750    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.593941  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4353  penicillin-binding protein  58.57 
 
 		 706 aa  802    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.600551  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2457  penicillin-binding protein  54.61 
 
 		 708 aa  744    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2872  penicillin binding protein transpeptidase domain-containing protein  54.4 
 
 		 717 aa  749    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.649717  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4175  penicillin-binding protein  58.63 
 
 		 706 aa  799    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0925986  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3112  penicillin-binding protein  54.69 
 
 		 717 aa  754    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.332065  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2290  penicillin-binding protein  52.06 
 
 		 710 aa  732    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0186276  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2420  penicillin-binding protein transpeptidase domain-containing protein  54.61 
 
 		 708 aa  745    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.164816  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2842  penicillin-binding protein  54.55 
 
 		 717 aa  751    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00031959  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4013  penicillin-binding protein  58.25 
 
 		 708 aa  794    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2246  penicillin-binding protein 2  51.91 
 
 		 708 aa  727    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.216847  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2381  penicillin-binding protein transpeptidase domain-containing protein  54.08 
 
 		 708 aa  747    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.170491  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2802  penicillin-binding protein 2  54.55 
 
 		 717 aa  749    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4023  penicillin-binding protein  58.86 
 
 		 706 aa  801    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3080  penicillin-binding protein  53.47 
 
 		 717 aa  735    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0847  penicillin-binding protein  57.87 
 
 		 708 aa  803    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.393728 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2664  penicillin-binding Protein dimerisation domain family  54.66 
 
 		 708 aa  749    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.633662  hitchhiker  0.0039278 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2660  penicillin-binding Protein dimerisation domain family  55.17 
 
 		 708 aa  750    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0891523  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2821  penicillin-binding protein  52.55 
 
 		 710 aa  732    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000333362 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3001  penicillin-binding protein transpeptidase  58.71 
 
 		 705 aa  811    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2504  peptidoglycan glycosyltransferase  54.24 
 
 		 708 aa  741    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0781063  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2704  penicillin-binding protein  54.18 
 
 		 697 aa  743    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2637  penicillin-binding protein  54.61 
 
 		 708 aa  744    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.722819  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4497  penicillin-binding protein  58.63 
 
 		 706 aa  799    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2390  penicillin-binding protein transpeptidase  82.32 
 
 		 709 aa  1167    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000174014  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2521  penicillin-binding protein  52.34 
 
 		 710 aa  736    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000182518 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4389  penicillin-binding protein  58.08 
 
 		 709 aa  802    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2864  penicillin-binding protein transpeptidase  54.4 
 
 		 712 aa  743    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.928937  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2155  penicillin-binding protein  53.47 
 
 		 717 aa  735    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4293  penicillin-binding protein  58.63 
 
 		 706 aa  799    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000011336 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4126  penicillin-binding protein transpeptidase  58.92 
 
 		 710 aa  798    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.141298  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2502  penicillin-binding protein  52.71 
 
 		 710 aa  727    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4406  penicillin-binding protein  58.27 
 
 		 706 aa  803    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.796468  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2654  penicillin-binding protein  54.76 
 
 		 708 aa  744    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000363197 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2594  penicillin-binding protein  52.27 
 
 		 710 aa  734    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.754581  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2327  penicillin-binding protein, C-terminal  54.25 
 
 		 583 aa  618  1e-175  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0222692  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1610  penicillin-binding protein 3  43.13 
 
 		 691 aa  545  1e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.257106  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1644  penicillin-binding protein 3  43.13 
 
 		 691 aa  545  1e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.2124  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1117  penicillin-binding protein 3  43.91 
 
 		 696 aa  523  1e-147  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.117713  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1387  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  39.23 
 
 		 699 aa  464  1e-129  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000012136  hitchhiker  2.22711e-21 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1211  penicillin-binding protein, transpeptidase  35.54 
 
 		 692 aa  392  1e-107  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000710719  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0328  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  33.67 
 
 		 680 aa  361  2e-98  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0596019  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0385  penicillin-binding protein 2B  30.64 
 
 		 720 aa  320  3.9999999999999996e-86  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0192899  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0765  penicillin-binding protein 2b  32.89 
 
 		 681 aa  312  2e-83  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.108531  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0662  penicillin-binding protein 2B  31.96 
 
 		 704 aa  298  2e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.352092  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1244  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  31.84 
 
 		 688 aa  280  8e-74  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0294  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.2 
 
 		 694 aa  201  6e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.560921  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2430  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.87 
 
 		 695 aa  197  6e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0091  peptidoglycan glycosyltransferase  28.46 
 
 		 709 aa  194  5e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371789  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2332  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.14 
 
 		 705 aa  191  2.9999999999999997e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.957616  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1304  penicillin-binding protein 2  26.67 
 
 		 701 aa  188  4e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000662569  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0518  penicillin-binding protein 2  27.55 
 
 		 625 aa  161  4e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000002903 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  27.4 
 
 		 639 aa  156  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  28.36 
 
 		 643 aa  154  5.9999999999999996e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  28.68 
 
 		 647 aa  152  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  28.49 
 
 		 640 aa  152  3e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  29.09 
 
 		 636 aa  151  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0263  peptidoglycan glycosyltransferase  29.14 
 
 		 630 aa  151  4e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2560  penicillin-binding protein 2  26.13 
 
 		 700 aa  151  4e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000981349  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  28.21 
 
 		 645 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3317  peptidoglycan glycosyltransferase  27.27 
 
 		 618 aa  148  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000142864  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1092  penicillin-binding protein 2  27.27 
 
 		 618 aa  148  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000952492  hitchhiker  0.000000109983 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3453  peptidoglycan glycosyltransferase  27.27 
 
 		 618 aa  148  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00243084  hitchhiker  0.00384932 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3275  peptidoglycan glycosyltransferase  27.27 
 
 		 618 aa  148  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000207443  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1212  penicillin-binding protein 2  25.39 
 
 		 623 aa  146  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1715  penicillin-binding protein  26.31 
 
 		 652 aa  146  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0995  peptidoglycan glycosyltransferase  27.35 
 
 		 618 aa  146  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000900115  normal  0.206093 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14210  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.03 
 
 		 671 aa  146  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000118475  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2065  penicillin-binding protein 2  25.39 
 
 		 623 aa  145  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.180725  normal  0.157728 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0991  peptidoglycan glycosyltransferase  26.92 
 
 		 618 aa  145  3e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000594498  normal  0.0491088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  26.92 
 
 		 618 aa  145  3e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0906078  hitchhiker  0.0072323 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1168  penicillin-binding protein 2  26.92 
 
 		 618 aa  144  7e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1092  penicillin-binding protein 2  27.2 
 
 		 634 aa  143  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2869  peptidoglycan glycosyltransferase  26.87 
 
 		 618 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000124923  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2070  penicillin-binding protein 2  25.22 
 
 		 623 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000525085 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2125  penicillin-binding protein 2  25.22 
 
 		 623 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000381771 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0616  penicillin-binding protein 2  27.16 
 
 		 633 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054384  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00604  transpeptidase involved in peptidoglycan synthesis (penicillin-binding protein 2)  27.16 
 
 		 633 aa  142  3e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0219544  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2991  penicillin-binding protein 2  27.16 
 
 		 633 aa  142  3e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000298209  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0687  penicillin-binding protein 2  27.16 
 
 		 633 aa  142  3e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000614363  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0655  penicillin-binding protein 2  27.16 
 
 		 633 aa  142  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000471681  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00593  hypothetical protein  27.16 
 
 		 633 aa  142  3e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0186683  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0661  penicillin-binding protein 2  27.16 
 
 		 633 aa  142  3e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000749016  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0724  penicillin-binding protein 2  27.16 
 
 		 633 aa  142  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000167121  normal  0.141878 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3010  penicillin-binding protein 2  27.16 
 
 		 633 aa  142  3e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000210034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1336  penicillin-binding protein 2  25.22 
 
 		 623 aa  141  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.692108  hitchhiker  0.0000020031 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2356  peptidoglycan glycosyltransferase  26.18 
 
 		 641 aa  140  6e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1046  cell division protein FtsI  24.85 
 
 		 619 aa  140  7e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.276341  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  27.17 
 
 		 645 aa  140  7e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0769  penicillin-binding protein 2  24.35 
 
 		 644 aa  139  2e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.116672  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2711  Peptidoglycan glycosyltransferase  25.38 
 
 		 618 aa  139  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3341  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase / peptidoglycan glycosyltransferase  25.25 
 
 		 619 aa  139  3.0000000000000003e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.198786  normal  0.0253146 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2935  peptidoglycan glycosyltransferase  27.26 
 
 		 627 aa  139  3.0000000000000003e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0357968  normal  0.0108979 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0049  penicillin-binding protein 2  24.93 
 
 		 800 aa  138  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0800  penicillin-binding protein 2  26.28 
 
 		 633 aa  137  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.590609  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>