More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A1364 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A1364  ABC nickel/di-oligopepetide transporter, ATP binding subunit  100 
 
 
265 aa  542  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.596585  hitchhiker  0.00637351 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1922  ABC nickel/di-oligopepetide transporter, ATP binding subunit  99.25 
 
 
265 aa  538  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000973722  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2103  Adipeptide/di-oligopeptide/nickel ABC transporter ATP binding subunit  99.25 
 
 
265 aa  538  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000115075 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1379  ABC nickel/di-oligopepetide transporter, ATP binding subunit  98.11 
 
 
265 aa  532  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.413827 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1348  nickel/di-oligopepetide ABC transporter ATP binding subunit  97.74 
 
 
265 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0129177  normal  0.479872 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1074  nickel ABC transporter, ATP-binding protein  51.39 
 
 
268 aa  242  3.9999999999999997e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1128  ABC transporter related  51.39 
 
 
268 aa  242  3.9999999999999997e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.227292  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3550  nickel ABC transporter ATP-binding protein  51.39 
 
 
268 aa  242  3.9999999999999997e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0066786  normal  0.0642256 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1274  ABC transporter related  35.16 
 
 
303 aa  149  4e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1342  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  29.3 
 
 
307 aa  144  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0014  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  30.31 
 
 
309 aa  144  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.709521  normal  0.0140124 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2200  ABC transporter related  33.46 
 
 
373 aa  142  7e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0704641  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1326  ATPase  34.51 
 
 
307 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.406324  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3091  nickel ABC transporter, ATP-binding protein, putative  37.6 
 
 
548 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00987515  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0213  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  28.24 
 
 
309 aa  136  4e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.50166  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2961  ABC transporter  38.03 
 
 
547 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1863  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  34.19 
 
 
310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0190  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  29.46 
 
 
267 aa  133  3e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1468  ABC transporter related protein  26.27 
 
 
265 aa  133  3e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2553  ABC transporter related  32.68 
 
 
291 aa  130  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.499452  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3871  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  34.82 
 
 
617 aa  129  4.0000000000000003e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  36.15 
 
 
612 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5758  ABC transporter related  35.21 
 
 
611 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3220  ABC transporter, ATP-binding protein  36.88 
 
 
539 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94364  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4459  ABC transporter related protein  34.21 
 
 
565 aa  121  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0030  ABC transporter related  34.63 
 
 
558 aa  119  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3752  ABC transporter related  33.2 
 
 
597 aa  119  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2991  ABC transporter related  35.05 
 
 
611 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4177  ABC transporter related  33.58 
 
 
561 aa  119  6e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26180  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  33.19 
 
 
575 aa  119  7e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.204743 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0697  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  35.94 
 
 
340 aa  118  9e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000907822 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2438  ABC transporter related  33.33 
 
 
541 aa  117  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1324  5-methyltetrahydropteroyltriglutamate-- homocysteine methyltransferase  33.33 
 
 
517 aa  118  9.999999999999999e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000609088  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0028  ABC transporter related  36.82 
 
 
546 aa  117  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0987785  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18700  ABC transporter, ATP binding component  33.58 
 
 
542 aa  117  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106187  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0298  ABC transporter related  32 
 
 
565 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0983  ABC transporter related  34.11 
 
 
260 aa  116  3e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0278331  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6665  ABC transporter related  33.33 
 
 
611 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00669103 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2402  ABC transporter related  35.38 
 
 
615 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0788  ABC transporter related  32.07 
 
 
576 aa  115  8.999999999999998e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588139  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1327  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  30.94 
 
 
322 aa  115  8.999999999999998e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0010224  normal  0.375909 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0247  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  35.91 
 
 
542 aa  115  8.999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3154  ABC transporter-related protein  33.33 
 
 
557 aa  115  8.999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2115  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  33.02 
 
 
324 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.188886  normal  0.0439105 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4851  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.82 
 
 
546 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.508729  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0938  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  32.61 
 
 
332 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03328  nickel transporter subunit  32.29 
 
 
254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03281  hypothetical protein  32.29 
 
 
254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0237  nickel transporter ATP-binding protein NikD  32.29 
 
 
254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2537  ABC transporter related  35.71 
 
 
573 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000203549 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3678  nickel transporter ATP-binding protein NikD  32.29 
 
 
254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3963  nickel transporter ATP-binding protein NikD  32.29 
 
 
254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6073  nickel transporter ATP-binding protein NikD  36.94 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4819  ABC transporter related  35.8 
 
 
619 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0993193 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1962  ABC transporter related protein  33.89 
 
 
573 aa  113  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0038  ABC transporter related  28.46 
 
 
270 aa  113  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0193183  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2456  ATPase  32.91 
 
 
546 aa  113  3e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.719968  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0091  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  34.56 
 
 
325 aa  113  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0426  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  29.85 
 
 
321 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3842  nickel transporter ATP-binding protein NikD  32.29 
 
 
254 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1106  ABC transporter related  33.47 
 
 
314 aa  113  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2656  ABC transporter related  31.34 
 
 
552 aa  112  5e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0668  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  33.02 
 
 
325 aa  112  5e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34300  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  33.47 
 
 
661 aa  112  5e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.183589 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15540  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  33.94 
 
 
616 aa  112  6e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5362  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  32.42 
 
 
611 aa  112  6e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4819  nickel transporter ATP-binding protein NikD  31.84 
 
 
254 aa  112  6e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3763  nickel transporter ATP-binding protein NikD  31.84 
 
 
254 aa  112  6e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0690  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  33.02 
 
 
338 aa  112  6e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0222282 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8310  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  33.21 
 
 
620 aa  112  6e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.357305  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1010  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  30.63 
 
 
328 aa  112  7.000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0991  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  30.63 
 
 
328 aa  112  7.000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0236  nickel import ATP-binding protein NikD  31.84 
 
 
254 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1664  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  31.8 
 
 
323 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3002  ABC transporter related  34.27 
 
 
531 aa  112  8.000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2549  ABC transporter related  31.52 
 
 
530 aa  112  9e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.165477 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4835  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.44 
 
 
572 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.671613 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0942  ABC transporter related  33.47 
 
 
551 aa  111  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.337051  normal  0.0501434 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1039  ABC transporter related  33.33 
 
 
304 aa  111  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1353  ABC transporter related  33.19 
 
 
613 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1298  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  32.55 
 
 
327 aa  111  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1319  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  33.46 
 
 
658 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.179908  normal  0.0765459 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0188  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  30.86 
 
 
336 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1093  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  33.49 
 
 
356 aa  110  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0250139  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5076  ABC transporter related  34.44 
 
 
538 aa  110  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.058273  normal  0.492539 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00492  ABC transporter ATPase component  31.6 
 
 
571 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001975  peptide ABC transporter ATP-binding protein  31.13 
 
 
571 aa  110  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.175781  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0540  ABC transporter related  28.57 
 
 
261 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.855027 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3240  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.4 
 
 
308 aa  110  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.367926  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6641  ABC transporter related  31.22 
 
 
542 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28051  ABC transporter ATP-binding protein  32.5 
 
 
561 aa  110  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.779862 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0658  ABC peptide transporter  33.8 
 
 
533 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08350  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component  33.02 
 
 
673 aa  109  4.0000000000000004e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.335742  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02101  ABC transporter, ATP binding component  31.88 
 
 
536 aa  109  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2819  ABC transporter related  32.86 
 
 
571 aa  109  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.810211  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2823  ABC transporter related  28.79 
 
 
619 aa  109  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0582166  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0419  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.07 
 
 
331 aa  109  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0849999 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0985  ABC transporter related protein  33.93 
 
 
607 aa  109  5e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.674675  normal  0.337897 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4579  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATP-binding protein  32.47 
 
 
325 aa  109  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.170967  hitchhiker  0.00444636 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1049  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  29.96 
 
 
330 aa  109  5e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.933184  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>