85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1779 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1779  hypothetical protein  100 
 
 		 474 aa  904    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0763  beta-lactamase domain-containing protein  41.76 
 
 		 455 aa  350  3e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1184  hypothetical protein  43.86 
 
 		 465 aa  320  3e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3530  hypothetical protein  39.39 
 
 		 445 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0499  hypothetical protein  39.22 
 
 		 442 aa  298  2e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2664  hypothetical protein  41.74 
 
 		 466 aa  289  8e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2523  hypothetical protein  41.74 
 
 		 466 aa  289  8e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1636  hypothetical protein  41.74 
 
 		 466 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.117479  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1413  hypothetical protein  41.74 
 
 		 466 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.451407  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2576  hypothetical protein  41.74 
 
 		 466 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3175  hypothetical protein  41.74 
 
 		 466 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.333375  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2506  hypothetical protein  44.25 
 
 		 462 aa  286  4e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1955  hypothetical protein  41.52 
 
 		 470 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0065  hypothetical protein  41.06 
 
 		 473 aa  278  2e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.701081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16190  hypothetical protein  41.14 
 
 		 470 aa  275  1.0000000000000001e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326397  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1687  FAD dependent oxidoreductase  42.67 
 
 		 445 aa  272  1e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434523  normal  0.201156 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3286  hypothetical protein  39.08 
 
 		 466 aa  270  5.9999999999999995e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.694377  normal  0.162486 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1051  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family  38.1 
 
 		 474 aa  266  8e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.169159 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3277  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.6 
 
 		 443 aa  259  5.0000000000000005e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03231  hypothetical protein  38.39 
 
 		 464 aa  259  9e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3948  hypothetical protein  36.44 
 
 		 473 aa  259  1e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3604  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family  40.56 
 
 		 460 aa  256  9e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0606198  normal  0.410787 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3458  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.48 
 
 		 453 aa  255  1.0000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.436975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03362  putative secreted protein  38.19 
 
 		 471 aa  249  7e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0229987  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3848  hypothetical protein  39.53 
 
 		 469 aa  248  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3118  hypothetical protein  39.11 
 
 		 469 aa  248  2e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0412381  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3411  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  40.26 
 
 		 460 aa  247  3e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574536 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3720  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  40.26 
 
 		 460 aa  247  3e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.481201  normal  0.0318368 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3249  hypothetical protein  34.98 
 
 		 467 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2427  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.03 
 
 		 455 aa  246  6e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.232176  normal  0.116693 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3307  hypothetical protein  34.55 
 
 		 471 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3468  hypothetical protein  34.12 
 
 		 467 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.343102  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5118  hypothetical protein  39.07 
 
 		 444 aa  244  3e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.917814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2371  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.29 
 
 		 475 aa  243  6e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.447406  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0759  hypothetical protein  36.2 
 
 		 455 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.786998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4618  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.28 
 
 		 883 aa  231  3e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4518  FAD dependent oxidoreductase  35.32 
 
 		 485 aa  226  6e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.42013 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2050  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  34.61 
 
 		 482 aa  225  1e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.765527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0771  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.93 
 
 		 481 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13756 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2138  hypothetical protein  43.44 
 
 		 1751 aa  220  3e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6633  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  39.64 
 
 		 468 aa  218  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0685536 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2156  FAD dependent oxidoreductase  33.62 
 
 		 480 aa  216  9.999999999999999e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6060  hypothetical protein  33.41 
 
 		 454 aa  214  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1700  StAR  34.13 
 
 		 479 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.91604  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5579  hypothetical protein  33.48 
 
 		 456 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6552  hypothetical protein  34.14 
 
 		 453 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0462223  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0311  putative FAD-dependent oxidoreductase protein  33.41 
 
 		 478 aa  194  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0280  FAD dependent oxidoreductase  33.64 
 
 		 478 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4721  FAD dependent oxidoreductase  29.59 
 
 		 523 aa  183  6e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.450266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5466  hypothetical protein  29.24 
 
 		 499 aa  155  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1846  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5540  hypothetical protein  24.19 
 
 		 506 aa  146  8.000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.621882  normal  0.230055 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4517  hypothetical protein  27.97 
 
 		 466 aa  137  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.198903 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7141  hypothetical protein  28.13 
 
 		 468 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5992  hypothetical protein  27.53 
 
 		 468 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5543  hypothetical protein  28.51 
 
 		 490 aa  114  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3524  hypothetical protein  31.12 
 
 		 633 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.284733  normal  0.8933 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4369  hypothetical protein  25.53 
 
 		 458 aa  107  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.144671 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4122  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.19 
 
 		 608 aa  91.7  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13438  hypothetical protein  25.83 
 
 		 533 aa  83.6  0.000000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.729599 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1824  hypothetical protein  19.15 
 
 		 500 aa  78.6  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1859  hypothetical protein  19.15 
 
 		 500 aa  78.6  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3022  hypothetical protein  24.66 
 
 		 507 aa  77.4  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0268135  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4223  hypothetical protein  43.3 
 
 		 125 aa  71.2  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.284789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0823  hypothetical protein  30.12 
 
 		 651 aa  70.1  0.00000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1329  hypothetical protein  17.62 
 
 		 494 aa  69.7  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.230961  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11200  hypothetical protein  34.36 
 
 		 593 aa  68.2  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2487  hypothetical protein  32.82 
 
 		 477 aa  67  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00182169 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0676  hypothetical protein  30.89 
 
 		 659 aa  60.5  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.758616  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0276  FAD dependent oxidoreductase  27.6 
 
 		 479 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3372  hypothetical protein  45.07 
 
 		 239 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2675  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  44.83 
 
 		 61 aa  50.4  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1458  putative lipoprotein  27.13 
 
 		 624 aa  50.1  0.00009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.342191  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3711  hypothetical protein  29.82 
 
 		 654 aa  48.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1050  hypothetical protein  28.16 
 
 		 618 aa  47.8  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.526264  normal  0.107352 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1749  hypothetical protein  23.01 
 
 		 534 aa  44.7  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000314791  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1963  hypothetical protein  23.01 
 
 		 534 aa  44.7  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000030745 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2381  hypothetical protein  28 
 
 		 584 aa  44.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3018  hypothetical protein  27.38 
 
 		 603 aa  44.3  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0249937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3875  hypothetical protein  26.46 
 
 		 534 aa  44.3  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.408121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2381  hypothetical protein  23.01 
 
 		 534 aa  43.9  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000071971  hitchhiker  0.00180659 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3137  hypothetical protein  26.46 
 
 		 534 aa  43.5  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01627  hypothetical protein  23.01 
 
 		 534 aa  43.5  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.373231  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01637  conserved protein with FAD/NAD(P)-binding domain  23.01 
 
 		 534 aa  43.5  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.395296  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3910  hypothetical protein  34.33 
 
 		 673 aa  43.5  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1974  conserved hypothetical protein  23.01 
 
 		 534 aa  43.5  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000437192  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>