65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4721 on replicon NC_008760
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008760  Pnap_4721  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
523 aa  1058    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.450266  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4518  FAD dependent oxidoreductase  33.26 
 
 
485 aa  231  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.42013 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0311  putative FAD-dependent oxidoreductase protein  33.19 
 
 
478 aa  218  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0280  FAD dependent oxidoreductase  32.53 
 
 
478 aa  216  7e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0771  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.35 
 
 
481 aa  212  1e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13756 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6060  hypothetical protein  31.08 
 
 
454 aa  207  3e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2050  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  29.9 
 
 
482 aa  196  7e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.765527  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3118  hypothetical protein  31.59 
 
 
469 aa  193  6e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0412381  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3848  hypothetical protein  31.39 
 
 
469 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5466  hypothetical protein  29.38 
 
 
499 aa  191  2.9999999999999997e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1846  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1779  hypothetical protein  29.59 
 
 
474 aa  182  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3307  hypothetical protein  29.23 
 
 
471 aa  178  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3286  hypothetical protein  31.53 
 
 
466 aa  177  5e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.694377  normal  0.162486 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3468  hypothetical protein  28.95 
 
 
467 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.343102  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0763  beta-lactamase domain-containing protein  28.33 
 
 
455 aa  171  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0759  hypothetical protein  30.08 
 
 
455 aa  167  4e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.786998  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2371  hydroxyacylglutathione hydrolase  31.91 
 
 
475 aa  166  9e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.447406  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0499  hypothetical protein  29.07 
 
 
442 aa  163  7e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3249  hypothetical protein  28.42 
 
 
467 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2506  hypothetical protein  30.53 
 
 
462 aa  161  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03231  hypothetical protein  28.95 
 
 
464 aa  158  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5118  hypothetical protein  30.93 
 
 
444 aa  157  4e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.917814  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3530  hypothetical protein  26.51 
 
 
445 aa  157  5.0000000000000005e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1184  hypothetical protein  28.27 
 
 
465 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1051  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family  29.13 
 
 
474 aa  154  4e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.169159 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3458  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.31 
 
 
453 aa  150  4e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.436975  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0065  hypothetical protein  28.97 
 
 
473 aa  148  3e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.701081  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2156  FAD dependent oxidoreductase  29.41 
 
 
480 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16190  hypothetical protein  28.57 
 
 
470 aa  147  5e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326397  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1687  FAD dependent oxidoreductase  28.88 
 
 
445 aa  145  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434523  normal  0.201156 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03362  putative secreted protein  27.72 
 
 
471 aa  145  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0229987  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3948  hypothetical protein  27.29 
 
 
473 aa  144  4e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1955  hypothetical protein  27.47 
 
 
470 aa  141  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4618  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.41 
 
 
883 aa  139  8.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1700  StAR  25.97 
 
 
479 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.91604  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3604  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family  29.44 
 
 
460 aa  139  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0606198  normal  0.410787 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2664  hypothetical protein  27.72 
 
 
466 aa  131  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2576  hypothetical protein  27.72 
 
 
466 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1636  hypothetical protein  27.72 
 
 
466 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.117479  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3175  hypothetical protein  27.72 
 
 
466 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.333375  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1413  hypothetical protein  27.72 
 
 
466 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.451407  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2523  hypothetical protein  27.72 
 
 
466 aa  130  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6552  hypothetical protein  24.34 
 
 
453 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0462223  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3411  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  27.97 
 
 
460 aa  127  7e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.574536 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3720  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  27.97 
 
 
460 aa  127  7e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.481201  normal  0.0318368 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3277  hydroxyacylglutathione hydrolase  27.08 
 
 
443 aa  125  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5579  hypothetical protein  24.4 
 
 
456 aa  123  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2427  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.14 
 
 
455 aa  121  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.232176  normal  0.116693 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7141  hypothetical protein  26.23 
 
 
468 aa  109  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5540  hypothetical protein  23.59 
 
 
506 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.621882  normal  0.230055 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2138  hypothetical protein  27.08 
 
 
1751 aa  103  6e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4517  hypothetical protein  27.81 
 
 
466 aa  102  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.198903 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5992  hypothetical protein  26.07 
 
 
468 aa  100  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4369  hypothetical protein  24.47 
 
 
458 aa  84.7  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.144671 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6633  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  32.93 
 
 
468 aa  82  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0685536 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4122  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.55 
 
 
608 aa  80.5  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5543  hypothetical protein  25.88 
 
 
490 aa  79.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0276  FAD dependent oxidoreductase  27.76 
 
 
479 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2487  hypothetical protein  26.94 
 
 
477 aa  63.9  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00182169 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3130  hypothetical protein  26.47 
 
 
572 aa  62  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3524  hypothetical protein  22.5 
 
 
633 aa  60.8  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.284733  normal  0.8933 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0617  hypothetical protein  31.45 
 
 
624 aa  55.5  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.108776  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3022  hypothetical protein  23.48 
 
 
507 aa  50.8  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0268135  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1329  hypothetical protein  23.04 
 
 
494 aa  50.4  0.00009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.230961  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0647  flavin-containing monooxygenase FMO  25.41 
 
 
460 aa  47  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.406396 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>