76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3286 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3286  hypothetical protein  100 
 
 		 466 aa  934    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.694377  normal  0.162486 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3848  hypothetical protein  47.54 
 
 		 469 aa  375  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0759  hypothetical protein  47.4 
 
 		 455 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.786998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3118  hypothetical protein  47.77 
 
 		 469 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0412381  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0499  hypothetical protein  44.04 
 
 		 442 aa  336  5e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3530  hypothetical protein  42.22 
 
 		 445 aa  333  4e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5118  hypothetical protein  44.54 
 
 		 444 aa  330  5.0000000000000004e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.917814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2506  hypothetical protein  42.7 
 
 		 462 aa  289  7e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0763  beta-lactamase domain-containing protein  35.68 
 
 		 455 aa  276  7e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1779  hypothetical protein  39.08 
 
 		 474 aa  270  5.9999999999999995e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3458  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.6 
 
 		 453 aa  266  5e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.436975  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1184  hypothetical protein  38.01 
 
 		 465 aa  259  9e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2371  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.2 
 
 		 475 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.447406  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0771  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.36 
 
 		 481 aa  242  1e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13756 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3249  hypothetical protein  36.66 
 
 		 467 aa  238  2e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3604  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family  38.04 
 
 		 460 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0606198  normal  0.410787 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3468  hypothetical protein  36.36 
 
 		 467 aa  236  7e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.343102  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3307  hypothetical protein  36.72 
 
 		 471 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1955  hypothetical protein  35.29 
 
 		 470 aa  231  2e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1636  hypothetical protein  34.14 
 
 		 466 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.117479  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3175  hypothetical protein  34.14 
 
 		 466 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.333375  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2664  hypothetical protein  34.06 
 
 		 466 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2576  hypothetical protein  34.14 
 
 		 466 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1413  hypothetical protein  34.14 
 
 		 466 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.451407  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5579  hypothetical protein  34.64 
 
 		 456 aa  228  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3720  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  38.27 
 
 		 460 aa  227  3e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.481201  normal  0.0318368 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3411  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  38.27 
 
 		 460 aa  227  3e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574536 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2523  hypothetical protein  33.92 
 
 		 466 aa  227  4e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6552  hypothetical protein  34.65 
 
 		 453 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0462223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3277  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.51 
 
 		 443 aa  226  6e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16190  hypothetical protein  33.7 
 
 		 470 aa  223  8e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326397  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2427  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.17 
 
 		 455 aa  222  9e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.232176  normal  0.116693 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1687  FAD dependent oxidoreductase  36.7 
 
 		 445 aa  221  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434523  normal  0.201156 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0065  hypothetical protein  36.03 
 
 		 473 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.701081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6633  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  35.62 
 
 		 468 aa  219  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0685536 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03362  putative secreted protein  36.4 
 
 		 471 aa  218  2e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0229987  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03231  hypothetical protein  34.44 
 
 		 464 aa  213  3.9999999999999995e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1051  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family  35.5 
 
 		 474 aa  212  1e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.169159 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3948  hypothetical protein  32 
 
 		 473 aa  204  2e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6060  hypothetical protein  33.92 
 
 		 454 aa  203  5e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4518  FAD dependent oxidoreductase  31.61 
 
 		 485 aa  202  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.42013 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4618  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.23 
 
 		 883 aa  193  6e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0280  FAD dependent oxidoreductase  33.26 
 
 		 478 aa  192  8e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5466  hypothetical protein  30.56 
 
 		 499 aa  192  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1846  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0311  putative FAD-dependent oxidoreductase protein  32.41 
 
 		 478 aa  186  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4721  FAD dependent oxidoreductase  31.53 
 
 		 523 aa  175  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.450266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1700  StAR  29.31 
 
 		 479 aa  169  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.91604  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2156  FAD dependent oxidoreductase  30.26 
 
 		 480 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2138  hypothetical protein  33.04 
 
 		 1751 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2050  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  29.05 
 
 		 482 aa  164  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.765527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4517  hypothetical protein  26.89 
 
 		 466 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.198903 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5992  hypothetical protein  27.49 
 
 		 468 aa  136  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7141  hypothetical protein  26.71 
 
 		 468 aa  132  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5540  hypothetical protein  23.72 
 
 		 506 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.621882  normal  0.230055 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4369  hypothetical protein  27.27 
 
 		 458 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.144671 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5543  hypothetical protein  27.35 
 
 		 490 aa  106  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3524  hypothetical protein  27.1 
 
 		 633 aa  85.9  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.284733  normal  0.8933 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4223  hypothetical protein  31.03 
 
 		 125 aa  59.7  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.284789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1824  hypothetical protein  19.76 
 
 		 500 aa  58.5  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1859  hypothetical protein  19.76 
 
 		 500 aa  58.5  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4122  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.88 
 
 		 608 aa  57.8  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3022  hypothetical protein  26.22 
 
 		 507 aa  57.8  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0268135  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2487  hypothetical protein  28.5 
 
 		 477 aa  57.4  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00182169 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3372  hypothetical protein  40.48 
 
 		 239 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1329  hypothetical protein  24.19 
 
 		 494 aa  54.7  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.230961  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3130  hypothetical protein  24.07 
 
 		 572 aa  54.7  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1749  hypothetical protein  25.59 
 
 		 534 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000314791  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1963  hypothetical protein  25.59 
 
 		 534 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000030745 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1782  hypothetical protein  24.05 
 
 		 536 aa  48.9  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432759 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2381  hypothetical protein  25.82 
 
 		 534 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000071971  hitchhiker  0.00180659 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01627  hypothetical protein  25.82 
 
 		 534 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.373231  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1974  conserved hypothetical protein  25.82 
 
 		 534 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000437192  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01637  conserved protein with FAD/NAD(P)-binding domain  25.82 
 
 		 534 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.395296  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5301  hypothetical protein  30.53 
 
 		 303 aa  46.6  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.730903  normal  0.0168693 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2673  hypothetical protein  21.58 
 
 		 314 aa  45.8  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0276  FAD dependent oxidoreductase  27.39 
 
 		 479 aa  44.7  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>