65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03362 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_03362  putative secreted protein  100 
 
 
471 aa  919    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0229987  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1184  hypothetical protein  37.39 
 
 
465 aa  249  7e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1779  hypothetical protein  38.19 
 
 
474 aa  249  7e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0763  beta-lactamase domain-containing protein  33.19 
 
 
455 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1051  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family  36.13 
 
 
474 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.169159 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1687  FAD dependent oxidoreductase  38.24 
 
 
445 aa  232  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434523  normal  0.201156 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0499  hypothetical protein  34.79 
 
 
442 aa  231  2e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6552  hypothetical protein  36.01 
 
 
453 aa  226  9e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0462223  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16190  hypothetical protein  36.01 
 
 
470 aa  225  1e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326397  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5579  hypothetical protein  36.09 
 
 
456 aa  225  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2506  hypothetical protein  37.97 
 
 
462 aa  223  4.9999999999999996e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2664  hypothetical protein  36.68 
 
 
466 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3286  hypothetical protein  36.4 
 
 
466 aa  218  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.694377  normal  0.162486 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2523  hypothetical protein  36.46 
 
 
466 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1636  hypothetical protein  36.46 
 
 
466 aa  217  4e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.117479  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1413  hypothetical protein  36.46 
 
 
466 aa  217  4e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.451407  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2576  hypothetical protein  36.46 
 
 
466 aa  217  4e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3175  hypothetical protein  36.46 
 
 
466 aa  217  4e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.333375  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3458  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.99 
 
 
453 aa  216  5e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.436975  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3530  hypothetical protein  33.19 
 
 
445 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3118  hypothetical protein  33.41 
 
 
469 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0412381  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1955  hypothetical protein  35.13 
 
 
470 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3848  hypothetical protein  32.96 
 
 
469 aa  212  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3604  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family  36.83 
 
 
460 aa  212  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0606198  normal  0.410787 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3720  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  38.5 
 
 
460 aa  209  9e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.481201  normal  0.0318368 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3411  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  38.5 
 
 
460 aa  209  9e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.574536 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5118  hypothetical protein  34.71 
 
 
444 aa  203  6e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.917814  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0759  hypothetical protein  34.06 
 
 
455 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.786998  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0065  hypothetical protein  37.13 
 
 
473 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.701081  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6060  hypothetical protein  31.9 
 
 
454 aa  197  4.0000000000000005e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2371  hydroxyacylglutathione hydrolase  35.13 
 
 
475 aa  197  5.000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.447406  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3249  hypothetical protein  33.4 
 
 
467 aa  193  5e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1700  StAR  32.67 
 
 
479 aa  192  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.91604  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2050  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  31.41 
 
 
482 aa  191  2.9999999999999997e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.765527  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3468  hypothetical protein  32.63 
 
 
467 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.343102  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2427  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.18 
 
 
455 aa  188  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.232176  normal  0.116693 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3948  hypothetical protein  33.62 
 
 
473 aa  187  3e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0771  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.51 
 
 
481 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13756 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5466  hypothetical protein  30.66 
 
 
499 aa  182  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1846  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4518  FAD dependent oxidoreductase  31.5 
 
 
485 aa  182  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.42013 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3307  hypothetical protein  32.47 
 
 
471 aa  180  4e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03231  hypothetical protein  33.41 
 
 
464 aa  179  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6633  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  34.51 
 
 
468 aa  177  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0685536 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2156  FAD dependent oxidoreductase  31.21 
 
 
480 aa  176  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4618  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.79 
 
 
883 aa  175  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3277  hydroxyacylglutathione hydrolase  31.36 
 
 
443 aa  174  3.9999999999999995e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0311  putative FAD-dependent oxidoreductase protein  31.14 
 
 
478 aa  167  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2138  hypothetical protein  37.13 
 
 
1751 aa  162  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0280  FAD dependent oxidoreductase  30.48 
 
 
478 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4721  FAD dependent oxidoreductase  26.87 
 
 
523 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.450266  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5540  hypothetical protein  25.25 
 
 
506 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.621882  normal  0.230055 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4517  hypothetical protein  27.14 
 
 
466 aa  122  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.198903 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5992  hypothetical protein  26.37 
 
 
468 aa  117  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7141  hypothetical protein  25.49 
 
 
468 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3022  hypothetical protein  25.35 
 
 
507 aa  90.5  6e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0268135  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4369  hypothetical protein  24.63 
 
 
458 aa  86.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.144671 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5543  hypothetical protein  27.27 
 
 
490 aa  79.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2487  hypothetical protein  30.27 
 
 
477 aa  70.9  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00182169 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13438  hypothetical protein  25.93 
 
 
533 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.729599 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0617  hypothetical protein  32.56 
 
 
624 aa  55.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.108776  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4223  hypothetical protein  32.22 
 
 
125 aa  55.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.284789  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1329  hypothetical protein  19.34 
 
 
494 aa  53.9  0.000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.230961  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3372  hypothetical protein  40.48 
 
 
239 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3875  hypothetical protein  28.05 
 
 
534 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.408121  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3137  hypothetical protein  25.89 
 
 
534 aa  44.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>