67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3307 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3468  hypothetical protein  73.14 
 
 		 467 aa  672    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.343102  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3249  hypothetical protein  72.05 
 
 		 467 aa  663    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3307  hypothetical protein  100 
 
 		 471 aa  934    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0763  beta-lactamase domain-containing protein  34.06 
 
 		 455 aa  255  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1779  hypothetical protein  34.55 
 
 		 474 aa  245  9.999999999999999e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3286  hypothetical protein  36.72 
 
 		 466 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.694377  normal  0.162486 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1051  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family  35.21 
 
 		 474 aa  231  2e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.169159 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0759  hypothetical protein  36.66 
 
 		 455 aa  229  7e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.786998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3848  hypothetical protein  34.62 
 
 		 469 aa  228  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3118  hypothetical protein  34.41 
 
 		 469 aa  226  7e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0412381  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2371  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.42 
 
 		 475 aa  225  1e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.447406  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1184  hypothetical protein  35.59 
 
 		 465 aa  223  6e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0065  hypothetical protein  35.56 
 
 		 473 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.701081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1955  hypothetical protein  34.39 
 
 		 470 aa  212  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3175  hypothetical protein  34.47 
 
 		 466 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.333375  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2664  hypothetical protein  34.47 
 
 		 466 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1636  hypothetical protein  34.47 
 
 		 466 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.117479  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2576  hypothetical protein  34.47 
 
 		 466 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1413  hypothetical protein  34.47 
 
 		 466 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.451407  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2523  hypothetical protein  34.26 
 
 		 466 aa  209  6e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3277  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.46 
 
 		 443 aa  207  5e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3948  hypothetical protein  34.94 
 
 		 473 aa  203  5e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0499  hypothetical protein  32.49 
 
 		 442 aa  203  5e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03231  hypothetical protein  35.06 
 
 		 464 aa  203  7e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2506  hypothetical protein  35.47 
 
 		 462 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5118  hypothetical protein  34.34 
 
 		 444 aa  201  1.9999999999999998e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.917814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0771  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.9 
 
 		 481 aa  201  3e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13756 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4518  FAD dependent oxidoreductase  33.12 
 
 		 485 aa  195  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.42013 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6633  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  35.09 
 
 		 468 aa  194  4e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0685536 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3604  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family  34.5 
 
 		 460 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0606198  normal  0.410787 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3720  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  34.34 
 
 		 460 aa  188  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.481201  normal  0.0318368 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3411  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  34.34 
 
 		 460 aa  188  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574536 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3530  hypothetical protein  30.37 
 
 		 445 aa  187  4e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1700  StAR  30.96 
 
 		 479 aa  186  6e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.91604  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6552  hypothetical protein  32.2 
 
 		 453 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0462223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6060  hypothetical protein  32.88 
 
 		 454 aa  183  5.0000000000000004e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5579  hypothetical protein  31.78 
 
 		 456 aa  183  7e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3458  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.17 
 
 		 453 aa  182  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.436975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03362  putative secreted protein  32.47 
 
 		 471 aa  180  4e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0229987  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2050  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  30.84 
 
 		 482 aa  179  7e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.765527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4721  FAD dependent oxidoreductase  29.25 
 
 		 523 aa  176  8e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.450266  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16190  hypothetical protein  30.26 
 
 		 470 aa  167  5e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326397  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2138  hypothetical protein  36.06 
 
 		 1751 aa  166  8e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0311  putative FAD-dependent oxidoreductase protein  31.44 
 
 		 478 aa  166  9e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1687  FAD dependent oxidoreductase  30.08 
 
 		 445 aa  165  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434523  normal  0.201156 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2156  FAD dependent oxidoreductase  31.66 
 
 		 480 aa  164  3e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0280  FAD dependent oxidoreductase  31.35 
 
 		 478 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2427  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.11 
 
 		 455 aa  160  4e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.232176  normal  0.116693 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5466  hypothetical protein  29.09 
 
 		 499 aa  157  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1846  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4618  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.41 
 
 		 883 aa  149  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7141  hypothetical protein  28.14 
 
 		 468 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4517  hypothetical protein  28.39 
 
 		 466 aa  140  4.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.198903 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5992  hypothetical protein  27.98 
 
 		 468 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5540  hypothetical protein  23.16 
 
 		 506 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.621882  normal  0.230055 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4369  hypothetical protein  26.79 
 
 		 458 aa  92.4  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.144671 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3524  hypothetical protein  26.37 
 
 		 633 aa  79.7  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.284733  normal  0.8933 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5543  hypothetical protein  26.34 
 
 		 490 aa  78.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3022  hypothetical protein  29.38 
 
 		 507 aa  63.5  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0268135  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2487  hypothetical protein  29.78 
 
 		 477 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00182169 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0276  FAD dependent oxidoreductase  26.8 
 
 		 479 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4223  hypothetical protein  34.48 
 
 		 125 aa  53.5  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.284789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1824  hypothetical protein  26.8 
 
 		 582 aa  47.8  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000311233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4122  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.41 
 
 		 608 aa  47.4  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1514  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.64 
 
 		 543 aa  46.2  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17770  hypothetical protein  29.84 
 
 		 644 aa  45.8  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.413089  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13438  hypothetical protein  22.56 
 
 		 533 aa  45.1  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.729599 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3372  hypothetical protein  44.44 
 
 		 239 aa  44.7  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>