54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0276 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0276  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
479 aa  966    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5118  hypothetical protein  30.12 
 
 
444 aa  89.7  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.917814  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5540  hypothetical protein  23.08 
 
 
506 aa  82.8  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.621882  normal  0.230055 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5543  hypothetical protein  28 
 
 
490 aa  83.2  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1329  hypothetical protein  26.29 
 
 
494 aa  76.6  0.0000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.230961  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3468  hypothetical protein  27.87 
 
 
467 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.343102  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4721  FAD dependent oxidoreductase  29.55 
 
 
523 aa  69.7  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.450266  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4618  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.8 
 
 
883 aa  67  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3948  hypothetical protein  28.67 
 
 
473 aa  66.2  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1859  hypothetical protein  24.68 
 
 
500 aa  66.6  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1824  hypothetical protein  24.68 
 
 
500 aa  66.6  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3307  hypothetical protein  27.34 
 
 
471 aa  64.7  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3118  hypothetical protein  29.43 
 
 
469 aa  63.5  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0412381  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2156  FAD dependent oxidoreductase  27.78 
 
 
480 aa  63.2  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0763  beta-lactamase domain-containing protein  23.93 
 
 
455 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3848  hypothetical protein  29.11 
 
 
469 aa  62.4  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3277  hydroxyacylglutathione hydrolase  26.41 
 
 
443 aa  61.2  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1779  hypothetical protein  27.6 
 
 
474 aa  61.2  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2371  hydroxyacylglutathione hydrolase  27.1 
 
 
475 aa  60.1  0.00000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.447406  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2050  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  27 
 
 
482 aa  60.1  0.00000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.765527  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2427  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.08 
 
 
455 aa  58.9  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.232176  normal  0.116693 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3530  hypothetical protein  26.52 
 
 
445 aa  58.2  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3249  hypothetical protein  27.2 
 
 
467 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0065  hypothetical protein  29.08 
 
 
473 aa  57  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.701081  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2664  hypothetical protein  27.6 
 
 
466 aa  56.2  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3175  hypothetical protein  27.6 
 
 
466 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.333375  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1636  hypothetical protein  27.6 
 
 
466 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.117479  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03231  hypothetical protein  28.94 
 
 
464 aa  55.8  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2576  hypothetical protein  27.6 
 
 
466 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1413  hypothetical protein  27.6 
 
 
466 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.451407  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2138  hypothetical protein  28.38 
 
 
1751 aa  55.1  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1687  FAD dependent oxidoreductase  27.1 
 
 
445 aa  54.7  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434523  normal  0.201156 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1955  hypothetical protein  28.64 
 
 
470 aa  53.9  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2523  hypothetical protein  27.15 
 
 
466 aa  53.9  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0759  hypothetical protein  26.37 
 
 
455 aa  53.5  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.786998  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1700  StAR  25.69 
 
 
479 aa  53.5  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.91604  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6060  hypothetical protein  30.85 
 
 
454 aa  53.5  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0311  putative FAD-dependent oxidoreductase protein  28.57 
 
 
478 aa  53.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3458  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.18 
 
 
453 aa  52.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.436975  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0280  FAD dependent oxidoreductase  25.46 
 
 
478 aa  50.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5579  hypothetical protein  24.29 
 
 
456 aa  50.1  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0499  hypothetical protein  23.87 
 
 
442 aa  49.7  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1051  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family  26.71 
 
 
474 aa  48.9  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.169159 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5466  hypothetical protein  26.61 
 
 
499 aa  48.5  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1846  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0771  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.05 
 
 
481 aa  49.3  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13756 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4518  FAD dependent oxidoreductase  24.36 
 
 
485 aa  48.5  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.42013 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4517  hypothetical protein  24.9 
 
 
466 aa  48.5  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.198903 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16190  hypothetical protein  27.44 
 
 
470 aa  47.8  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326397  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2487  hypothetical protein  27.32 
 
 
477 aa  47.8  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00182169 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6552  hypothetical protein  23.36 
 
 
453 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0462223  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2506  hypothetical protein  32.29 
 
 
462 aa  45.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3286  hypothetical protein  27.39 
 
 
466 aa  45.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.694377  normal  0.162486 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2883  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.78 
 
 
372 aa  43.5  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0278  siderophore biosynthesis protein IucD  24.88 
 
 
437 aa  43.5  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>