67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2156 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2156  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
480 aa  981    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1779  hypothetical protein  33.62 
 
 
474 aa  216  9.999999999999999e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0763  beta-lactamase domain-containing protein  30.28 
 
 
455 aa  200  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1184  hypothetical protein  33.48 
 
 
465 aa  193  5e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0065  hypothetical protein  33.12 
 
 
473 aa  192  1e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.701081  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2664  hypothetical protein  30.84 
 
 
466 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1413  hypothetical protein  30.84 
 
 
466 aa  188  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.451407  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3118  hypothetical protein  33.92 
 
 
469 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0412381  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2576  hypothetical protein  30.84 
 
 
466 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1636  hypothetical protein  30.84 
 
 
466 aa  188  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.117479  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3175  hypothetical protein  30.84 
 
 
466 aa  188  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.333375  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2523  hypothetical protein  30.84 
 
 
466 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3848  hypothetical protein  33.85 
 
 
469 aa  187  4e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3948  hypothetical protein  31.89 
 
 
473 aa  181  2.9999999999999997e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2506  hypothetical protein  33.78 
 
 
462 aa  180  7e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5118  hypothetical protein  33.04 
 
 
444 aa  178  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.917814  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1687  FAD dependent oxidoreductase  30.72 
 
 
445 aa  178  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434523  normal  0.201156 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1955  hypothetical protein  30.43 
 
 
470 aa  178  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16190  hypothetical protein  32.91 
 
 
470 aa  177  5e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326397  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6633  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  32.52 
 
 
468 aa  176  7e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0685536 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03362  putative secreted protein  31.21 
 
 
471 aa  176  9.999999999999999e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0229987  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2371  hydroxyacylglutathione hydrolase  31.77 
 
 
475 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.447406  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0499  hypothetical protein  30.42 
 
 
442 aa  169  1e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1051  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family  30.67 
 
 
474 aa  167  4e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.169159 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3286  hypothetical protein  30.26 
 
 
466 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.694377  normal  0.162486 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3307  hypothetical protein  31.66 
 
 
471 aa  164  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3530  hypothetical protein  30.25 
 
 
445 aa  163  6e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3249  hypothetical protein  31.42 
 
 
467 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3277  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.07 
 
 
443 aa  159  7e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3468  hypothetical protein  31.4 
 
 
467 aa  159  8e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.343102  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3458  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.81 
 
 
453 aa  159  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.436975  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1700  StAR  30.15 
 
 
479 aa  158  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.91604  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0759  hypothetical protein  30.84 
 
 
455 aa  158  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.786998  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3604  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family  31 
 
 
460 aa  156  6e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0606198  normal  0.410787 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6552  hypothetical protein  27.27 
 
 
453 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0462223  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5579  hypothetical protein  29.69 
 
 
456 aa  153  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3411  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  31.37 
 
 
460 aa  151  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.574536 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3720  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  31.37 
 
 
460 aa  151  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.481201  normal  0.0318368 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03231  hypothetical protein  30.9 
 
 
464 aa  147  6e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2427  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.02 
 
 
455 aa  141  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.232176  normal  0.116693 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4618  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.76 
 
 
883 aa  142  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2138  hypothetical protein  30.97 
 
 
1751 aa  141  3e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2050  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  26.99 
 
 
482 aa  139  8.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.765527  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4721  FAD dependent oxidoreductase  29.22 
 
 
523 aa  139  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.450266  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5466  hypothetical protein  28.4 
 
 
499 aa  138  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1846  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7141  hypothetical protein  27.35 
 
 
468 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4518  FAD dependent oxidoreductase  27.19 
 
 
485 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.42013 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5992  hypothetical protein  27.27 
 
 
468 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4517  hypothetical protein  26.07 
 
 
466 aa  122  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.198903 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0771  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.86 
 
 
481 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13756 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4369  hypothetical protein  24.26 
 
 
458 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.144671 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6060  hypothetical protein  24.66 
 
 
454 aa  105  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0311  putative FAD-dependent oxidoreductase protein  25.06 
 
 
478 aa  94.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0280  FAD dependent oxidoreductase  24.34 
 
 
478 aa  94.4  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5540  hypothetical protein  21.47 
 
 
506 aa  88.6  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.621882  normal  0.230055 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5543  hypothetical protein  24.2 
 
 
490 aa  80.5  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1329  hypothetical protein  20.2 
 
 
494 aa  68.9  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.230961  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1824  hypothetical protein  20.16 
 
 
500 aa  65.1  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1859  hypothetical protein  20.16 
 
 
500 aa  65.1  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0276  FAD dependent oxidoreductase  27.71 
 
 
479 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4122  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  22.96 
 
 
608 aa  61.2  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4223  hypothetical protein  35.44 
 
 
125 aa  57  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.284789  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3524  hypothetical protein  22.87 
 
 
633 aa  57  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.284733  normal  0.8933 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2487  hypothetical protein  28.5 
 
 
477 aa  52  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00182169 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0823  hypothetical protein  27.34 
 
 
651 aa  44.3  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4291  hypothetical protein  31.9 
 
 
483 aa  43.9  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.814822  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3372  hypothetical protein  29.63 
 
 
239 aa  43.5  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>