62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1329 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1329  hypothetical protein  100 
 
 		 494 aa  1026    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.230961  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1859  hypothetical protein  70.37 
 
 		 500 aa  736    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1824  hypothetical protein  70.37 
 
 		 500 aa  736    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0685  hypothetical protein  26.18 
 
 		 472 aa  155  2e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00218471  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5543  hypothetical protein  24.84 
 
 		 490 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5540  hypothetical protein  21.34 
 
 		 506 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.621882  normal  0.230055 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3022  hypothetical protein  24.35 
 
 		 507 aa  115  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0268135  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2487  hypothetical protein  22.36 
 
 		 477 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00182169 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0276  FAD dependent oxidoreductase  26.29 
 
 		 479 aa  73.9  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1687  FAD dependent oxidoreductase  19.31 
 
 		 445 aa  72  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434523  normal  0.201156 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5118  hypothetical protein  21.1 
 
 		 444 aa  70.9  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.917814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4518  FAD dependent oxidoreductase  19.39 
 
 		 485 aa  70.5  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.42013 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1779  hypothetical protein  17.62 
 
 		 474 aa  69.7  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2371  hydroxyacylglutathione hydrolase  21.85 
 
 		 475 aa  68.9  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.447406  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2156  FAD dependent oxidoreductase  20.2 
 
 		 480 aa  68.9  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0763  beta-lactamase domain-containing protein  21.09 
 
 		 455 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1413  hypothetical protein  21.98 
 
 		 466 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.451407  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2576  hypothetical protein  21.98 
 
 		 466 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2664  hypothetical protein  21.98 
 
 		 466 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1636  hypothetical protein  21.98 
 
 		 466 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.117479  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3175  hypothetical protein  21.98 
 
 		 466 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.333375  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0065  hypothetical protein  19.71 
 
 		 473 aa  66.6  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.701081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2523  hypothetical protein  21.98 
 
 		 466 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5466  hypothetical protein  19.87 
 
 		 499 aa  65.5  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1846  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3277  hydroxyacylglutathione hydrolase  21.37 
 
 		 443 aa  65.5  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3948  hypothetical protein  19.96 
 
 		 473 aa  65.5  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2427  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  20.16 
 
 		 455 aa  65.1  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.232176  normal  0.116693 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1184  hypothetical protein  18.76 
 
 		 465 aa  63.9  0.000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1955  hypothetical protein  21.98 
 
 		 470 aa  62  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2138  hypothetical protein  21.07 
 
 		 1751 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0771  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  20.13 
 
 		 481 aa  57.8  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13756 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2356  hypothetical protein  22.14 
 
 		 578 aa  57  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.124336 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3458  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  18.74 
 
 		 453 aa  56.2  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.436975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3130  hypothetical protein  23.59 
 
 		 572 aa  56.6  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16190  hypothetical protein  31 
 
 		 470 aa  55.5  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326397  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3249  hypothetical protein  20.35 
 
 		 467 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1782  hypothetical protein  21.84 
 
 		 536 aa  55.1  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432759 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2381  hypothetical protein  22.01 
 
 		 534 aa  54.7  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000071971  hitchhiker  0.00180659 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3286  hypothetical protein  24.19 
 
 		 466 aa  54.7  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.694377  normal  0.162486 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0499  hypothetical protein  18.94 
 
 		 442 aa  54.3  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03362  putative secreted protein  19.34 
 
 		 471 aa  53.9  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0229987  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1974  conserved hypothetical protein  21.7 
 
 		 534 aa  53.9  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000437192  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1749  hypothetical protein  22.13 
 
 		 534 aa  53.9  0.000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000314791  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01627  hypothetical protein  21.7 
 
 		 534 aa  53.9  0.000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.373231  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01637  conserved protein with FAD/NAD(P)-binding domain  21.7 
 
 		 534 aa  53.9  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.395296  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1963  hypothetical protein  22.13 
 
 		 534 aa  53.9  0.000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000030745 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0206  hypothetical protein  19.44 
 
 		 580 aa  52.8  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3848  hypothetical protein  18.38 
 
 		 469 aa  52.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6552  hypothetical protein  19.35 
 
 		 453 aa  52.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0462223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3118  hypothetical protein  18.75 
 
 		 469 aa  52  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0412381  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4721  FAD dependent oxidoreductase  23.04 
 
 		 523 aa  50.1  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.450266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4618  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  22.69 
 
 		 883 aa  50.1  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0280  FAD dependent oxidoreductase  20.1 
 
 		 478 aa  49.7  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3530  hypothetical protein  19.14 
 
 		 445 aa  49.7  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1700  StAR  18.57 
 
 		 479 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.91604  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1859  FAD(NAD)-dependent oxidoreductase  20.56 
 
 		 623 aa  48.9  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03231  hypothetical protein  19.08 
 
 		 464 aa  48.9  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3137  hypothetical protein  20.12 
 
 		 534 aa  47  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0311  putative FAD-dependent oxidoreductase protein  20 
 
 		 478 aa  46.6  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3875  hypothetical protein  18.89 
 
 		 534 aa  45.8  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.408121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2050  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  21.43 
 
 		 482 aa  45.8  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.765527  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41800  hypothetical protein  23.97 
 
 		 615 aa  44.7  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>