77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5540 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5540  hypothetical protein  100 
 
 		 506 aa  1055    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.621882  normal  0.230055 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1779  hypothetical protein  24.19 
 
 		 474 aa  146  9e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1687  FAD dependent oxidoreductase  25.21 
 
 		 445 aa  137  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434523  normal  0.201156 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1859  hypothetical protein  23.12 
 
 		 500 aa  133  9e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1824  hypothetical protein  23.12 
 
 		 500 aa  133  9e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03362  putative secreted protein  25.25 
 
 		 471 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0229987  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0499  hypothetical protein  24.54 
 
 		 442 aa  123  9e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1329  hypothetical protein  21.34 
 
 		 494 aa  120  6e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.230961  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5118  hypothetical protein  22.29 
 
 		 444 aa  119  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.917814  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0065  hypothetical protein  24.03 
 
 		 473 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.701081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3458  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.41 
 
 		 453 aa  119  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.436975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0763  beta-lactamase domain-containing protein  23.75 
 
 		 455 aa  118  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3530  hypothetical protein  23.94 
 
 		 445 aa  116  7.999999999999999e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3286  hypothetical protein  23.72 
 
 		 466 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.694377  normal  0.162486 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2664  hypothetical protein  22.44 
 
 		 466 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1413  hypothetical protein  22.71 
 
 		 466 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.451407  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2576  hypothetical protein  22.71 
 
 		 466 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3175  hypothetical protein  22.71 
 
 		 466 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.333375  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1636  hypothetical protein  22.71 
 
 		 466 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.117479  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3118  hypothetical protein  23.3 
 
 		 469 aa  114  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0412381  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2523  hypothetical protein  22.71 
 
 		 466 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2371  hydroxyacylglutathione hydrolase  24.6 
 
 		 475 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.447406  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3848  hypothetical protein  22.89 
 
 		 469 aa  113  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3307  hypothetical protein  23.16 
 
 		 471 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1955  hypothetical protein  22.05 
 
 		 470 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3468  hypothetical protein  23.42 
 
 		 467 aa  111  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.343102  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5543  hypothetical protein  23.52 
 
 		 490 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3249  hypothetical protein  23.25 
 
 		 467 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1051  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family  23.25 
 
 		 474 aa  106  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.169159 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6060  hypothetical protein  22.66 
 
 		 454 aa  104  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4721  FAD dependent oxidoreductase  23.59 
 
 		 523 aa  102  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.450266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1700  StAR  23.49 
 
 		 479 aa  100  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.91604  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3948  hypothetical protein  22.52 
 
 		 473 aa  99  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3277  hydroxyacylglutathione hydrolase  23.38 
 
 		 443 aa  99  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2506  hypothetical protein  23.01 
 
 		 462 aa  98.2  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0771  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  22.31 
 
 		 481 aa  97.8  4e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13756 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3022  hypothetical protein  22.29 
 
 		 507 aa  97.4  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0268135  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03231  hypothetical protein  23.11 
 
 		 464 aa  96.7  8e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0759  hypothetical protein  20.62 
 
 		 455 aa  95.9  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.786998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2487  hypothetical protein  22.66 
 
 		 477 aa  94  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00182169 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4618  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.55 
 
 		 883 aa  93.6  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3604  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family  22.61 
 
 		 460 aa  92.4  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0606198  normal  0.410787 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1184  hypothetical protein  22.53 
 
 		 465 aa  91.7  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5579  hypothetical protein  23.41 
 
 		 456 aa  90.9  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2427  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  20.99 
 
 		 455 aa  89.4  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.232176  normal  0.116693 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2138  hypothetical protein  22.96 
 
 		 1751 aa  89  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2156  FAD dependent oxidoreductase  21.47 
 
 		 480 aa  88.6  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5466  hypothetical protein  22.44 
 
 		 499 aa  87.4  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1846  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6552  hypothetical protein  22.04 
 
 		 453 aa  85.1  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0462223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3720  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  21.9 
 
 		 460 aa  83.6  0.000000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.481201  normal  0.0318368 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3411  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  21.9 
 
 		 460 aa  83.6  0.000000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574536 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4518  FAD dependent oxidoreductase  23.73 
 
 		 485 aa  83.6  0.000000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.42013 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0280  FAD dependent oxidoreductase  22.08 
 
 		 478 aa  83.2  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0276  FAD dependent oxidoreductase  23.16 
 
 		 479 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4517  hypothetical protein  20.53 
 
 		 466 aa  80.5  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.198903 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0685  hypothetical protein  22.22 
 
 		 472 aa  78.6  0.0000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00218471  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0311  putative FAD-dependent oxidoreductase protein  20.97 
 
 		 478 aa  77.4  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7141  hypothetical protein  21.72 
 
 		 468 aa  68.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5992  hypothetical protein  20.08 
 
 		 468 aa  68.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16190  hypothetical protein  20.08 
 
 		 470 aa  68.6  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326397  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2050  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  19.84 
 
 		 482 aa  66.6  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.765527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1824  hypothetical protein  23.76 
 
 		 582 aa  63.9  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000311233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6633  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  25.4 
 
 		 468 aa  63.9  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0685536 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2381  hypothetical protein  26.72 
 
 		 534 aa  60.8  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000071971  hitchhiker  0.00180659 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01627  hypothetical protein  26.72 
 
 		 534 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.373231  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3130  hypothetical protein  25.87 
 
 		 572 aa  60.1  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1974  conserved hypothetical protein  26.72 
 
 		 534 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000437192  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01637  conserved protein with FAD/NAD(P)-binding domain  26.72 
 
 		 534 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.395296  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1963  hypothetical protein  25.76 
 
 		 534 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000030745 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1749  hypothetical protein  25.76 
 
 		 534 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000314791  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1782  hypothetical protein  28.81 
 
 		 536 aa  58.2  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432759 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0206  hypothetical protein  26.81 
 
 		 580 aa  53.5  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3137  hypothetical protein  26.07 
 
 		 534 aa  49.7  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3524  hypothetical protein  22.81 
 
 		 633 aa  47.8  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.284733  normal  0.8933 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3875  hypothetical protein  24.79 
 
 		 534 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.408121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2356  hypothetical protein  24.67 
 
 		 578 aa  44.7  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.124336 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0823  hypothetical protein  25.11 
 
 		 651 aa  43.5  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>