74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1051 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1051  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family  100 
 
 		 474 aa  942    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.169159 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1779  hypothetical protein  38.1 
 
 		 474 aa  266  8e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2664  hypothetical protein  37.74 
 
 		 466 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1413  hypothetical protein  37.74 
 
 		 466 aa  258  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.451407  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3175  hypothetical protein  37.74 
 
 		 466 aa  258  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.333375  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2523  hypothetical protein  37.74 
 
 		 466 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2576  hypothetical protein  37.74 
 
 		 466 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1636  hypothetical protein  37.74 
 
 		 466 aa  258  2e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.117479  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1955  hypothetical protein  36.53 
 
 		 470 aa  256  6e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1184  hypothetical protein  37.01 
 
 		 465 aa  253  6e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0763  beta-lactamase domain-containing protein  33.48 
 
 		 455 aa  251  3e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0499  hypothetical protein  34.51 
 
 		 442 aa  241  1e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3530  hypothetical protein  35.1 
 
 		 445 aa  242  1e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03362  putative secreted protein  36.13 
 
 		 471 aa  233  4.0000000000000004e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0229987  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3307  hypothetical protein  35.21 
 
 		 471 aa  231  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1687  FAD dependent oxidoreductase  36.85 
 
 		 445 aa  228  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434523  normal  0.201156 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3458  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.03 
 
 		 453 aa  221  1.9999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.436975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2050  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  34.55 
 
 		 482 aa  218  1e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.765527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3277  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.47 
 
 		 443 aa  218  2e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3468  hypothetical protein  32.83 
 
 		 467 aa  212  9e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.343102  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3286  hypothetical protein  35.5 
 
 		 466 aa  212  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.694377  normal  0.162486 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3848  hypothetical protein  36.13 
 
 		 469 aa  209  8e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3118  hypothetical protein  35.7 
 
 		 469 aa  207  3e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0412381  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3249  hypothetical protein  33.26 
 
 		 467 aa  207  4e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2506  hypothetical protein  36.46 
 
 		 462 aa  205  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5118  hypothetical protein  34.51 
 
 		 444 aa  204  3e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.917814  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16190  hypothetical protein  33.26 
 
 		 470 aa  204  3e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326397  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3720  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  36.04 
 
 		 460 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.481201  normal  0.0318368 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3411  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  36.04 
 
 		 460 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574536 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6060  hypothetical protein  33.73 
 
 		 454 aa  197  4.0000000000000005e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0759  hypothetical protein  32.47 
 
 		 455 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.786998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4518  FAD dependent oxidoreductase  34.6 
 
 		 485 aa  195  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.42013 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0771  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.9 
 
 		 481 aa  193  5e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13756 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0065  hypothetical protein  33.47 
 
 		 473 aa  190  5.999999999999999e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.701081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1700  StAR  30.59 
 
 		 479 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.91604  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3604  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family  35.56 
 
 		 460 aa  187  3e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0606198  normal  0.410787 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2371  hydroxyacylglutathione hydrolase  35.62 
 
 		 475 aa  187  5e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.447406  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2138  hypothetical protein  36.62 
 
 		 1751 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3948  hypothetical protein  32.32 
 
 		 473 aa  182  1e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4618  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.36 
 
 		 883 aa  180  4.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5579  hypothetical protein  31.1 
 
 		 456 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0311  putative FAD-dependent oxidoreductase protein  32.55 
 
 		 478 aa  177  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5466  hypothetical protein  31.95 
 
 		 499 aa  176  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1846  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6633  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  34.51 
 
 		 468 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0685536 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6552  hypothetical protein  31 
 
 		 453 aa  172  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0462223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2427  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.29 
 
 		 455 aa  167  2.9999999999999998e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.232176  normal  0.116693 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03231  hypothetical protein  32.14 
 
 		 464 aa  167  4e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2156  FAD dependent oxidoreductase  30.67 
 
 		 480 aa  167  4e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0280  FAD dependent oxidoreductase  32.31 
 
 		 478 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4721  FAD dependent oxidoreductase  29.19 
 
 		 523 aa  152  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.450266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4517  hypothetical protein  27.88 
 
 		 466 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.198903 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7141  hypothetical protein  26.84 
 
 		 468 aa  126  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5992  hypothetical protein  26.34 
 
 		 468 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4369  hypothetical protein  24.94 
 
 		 458 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.144671 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5540  hypothetical protein  23.25 
 
 		 506 aa  106  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.621882  normal  0.230055 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5543  hypothetical protein  28.45 
 
 		 490 aa  93.2  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2487  hypothetical protein  32.59 
 
 		 477 aa  72.4  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00182169 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3022  hypothetical protein  28.81 
 
 		 507 aa  64.7  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0268135  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0685  hypothetical protein  24.55 
 
 		 472 aa  52.4  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00218471  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13438  hypothetical protein  22.74 
 
 		 533 aa  52  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.729599 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3875  hypothetical protein  25 
 
 		 534 aa  49.7  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.408121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2381  hypothetical protein  24.83 
 
 		 534 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000071971  hitchhiker  0.00180659 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3524  hypothetical protein  27.17 
 
 		 633 aa  48.5  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.284733  normal  0.8933 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1749  hypothetical protein  24.83 
 
 		 534 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000314791  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1963  hypothetical protein  24.83 
 
 		 534 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000030745 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01627  hypothetical protein  24.5 
 
 		 534 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.373231  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01637  conserved protein with FAD/NAD(P)-binding domain  24.5 
 
 		 534 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.395296  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3137  hypothetical protein  24.77 
 
 		 534 aa  48.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1974  conserved hypothetical protein  24.5 
 
 		 534 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000437192  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0276  FAD dependent oxidoreductase  25.99 
 
 		 479 aa  47.4  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1023  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.53 
 
 		 401 aa  44.3  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.411114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1013  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.53 
 
 		 401 aa  44.3  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.421496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0995  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.53 
 
 		 401 aa  44.3  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4223  hypothetical protein  29.55 
 
 		 125 aa  43.9  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.284789  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>