68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0280 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0311  putative FAD-dependent oxidoreductase protein  85.56 
 
 
478 aa  793    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0280  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
478 aa  951    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4518  FAD dependent oxidoreductase  53.56 
 
 
485 aa  476  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.42013 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6060  hypothetical protein  53.27 
 
 
454 aa  440  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0771  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  47.82 
 
 
481 aa  379  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13756 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5466  hypothetical protein  44.47 
 
 
499 aa  366  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1846  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2050  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  37.42 
 
 
482 aa  262  8e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.765527  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4721  FAD dependent oxidoreductase  33.13 
 
 
523 aa  231  3e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.450266  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2371  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.21 
 
 
475 aa  204  3e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.447406  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3286  hypothetical protein  33.85 
 
 
466 aa  204  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.694377  normal  0.162486 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1779  hypothetical protein  33.85 
 
 
474 aa  202  9.999999999999999e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3411  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  33.98 
 
 
460 aa  194  3e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.574536 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3720  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  33.98 
 
 
460 aa  194  3e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.481201  normal  0.0318368 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3604  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family  34.95 
 
 
460 aa  193  6e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0606198  normal  0.410787 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3530  hypothetical protein  30.7 
 
 
445 aa  191  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2506  hypothetical protein  34.64 
 
 
462 aa  187  5e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0763  beta-lactamase domain-containing protein  27.77 
 
 
455 aa  187  5e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3458  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.28 
 
 
453 aa  180  4e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.436975  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0499  hypothetical protein  31.15 
 
 
442 aa  178  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1051  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family  32.53 
 
 
474 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.169159 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1184  hypothetical protein  29.49 
 
 
465 aa  173  5.999999999999999e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3249  hypothetical protein  32.83 
 
 
467 aa  173  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3468  hypothetical protein  31.21 
 
 
467 aa  173  7.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.343102  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3307  hypothetical protein  31.47 
 
 
471 aa  172  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2523  hypothetical protein  30.67 
 
 
466 aa  169  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2576  hypothetical protein  30.67 
 
 
466 aa  168  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1636  hypothetical protein  30.67 
 
 
466 aa  168  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.117479  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3175  hypothetical protein  30.67 
 
 
466 aa  168  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.333375  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1413  hypothetical protein  30.67 
 
 
466 aa  168  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.451407  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2664  hypothetical protein  30.67 
 
 
466 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0759  hypothetical protein  30.65 
 
 
455 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.786998  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3118  hypothetical protein  30.26 
 
 
469 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0412381  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3848  hypothetical protein  30.26 
 
 
469 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5118  hypothetical protein  30.02 
 
 
444 aa  162  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.917814  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1955  hypothetical protein  29.44 
 
 
470 aa  158  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03362  putative secreted protein  29.84 
 
 
471 aa  158  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0229987  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6633  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  33.56 
 
 
468 aa  158  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0685536 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6552  hypothetical protein  30.08 
 
 
453 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0462223  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0065  hypothetical protein  31.62 
 
 
473 aa  154  5e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.701081  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2138  hypothetical protein  34.2 
 
 
1751 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3277  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.89 
 
 
443 aa  151  3e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5579  hypothetical protein  28.88 
 
 
456 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3948  hypothetical protein  29.7 
 
 
473 aa  148  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03231  hypothetical protein  29.34 
 
 
464 aa  146  1e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1687  FAD dependent oxidoreductase  28.63 
 
 
445 aa  144  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434523  normal  0.201156 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1700  StAR  27.41 
 
 
479 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.91604  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16190  hypothetical protein  29.26 
 
 
470 aa  140  6e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326397  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4618  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.51 
 
 
883 aa  138  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2427  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.53 
 
 
455 aa  136  7.000000000000001e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.232176  normal  0.116693 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2156  FAD dependent oxidoreductase  25.74 
 
 
480 aa  111  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7141  hypothetical protein  25.48 
 
 
468 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4517  hypothetical protein  25.41 
 
 
466 aa  104  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.198903 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5992  hypothetical protein  25.7 
 
 
468 aa  99.8  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5540  hypothetical protein  22.52 
 
 
506 aa  87.8  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.621882  normal  0.230055 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5543  hypothetical protein  29.18 
 
 
490 aa  84  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2487  hypothetical protein  35 
 
 
477 aa  82  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00182169 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4369  hypothetical protein  25.49 
 
 
458 aa  73.9  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.144671 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1824  hypothetical protein  25.75 
 
 
500 aa  65.5  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1859  hypothetical protein  25.75 
 
 
500 aa  65.5  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1329  hypothetical protein  20.86 
 
 
494 aa  62.4  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.230961  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3524  hypothetical protein  28.95 
 
 
633 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.284733  normal  0.8933 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3130  hypothetical protein  25.54 
 
 
572 aa  50.8  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4167  flavin-containing monooxygenase  26.81 
 
 
480 aa  50.4  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0685  hypothetical protein  25.54 
 
 
472 aa  48.5  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00218471  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0276  FAD dependent oxidoreductase  25.25 
 
 
479 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4122  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.29 
 
 
608 aa  46.2  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3711  hypothetical protein  28.63 
 
 
654 aa  45.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3022  hypothetical protein  25.52 
 
 
507 aa  45.1  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0268135  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>