72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3458 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3458  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  100 
 
 
453 aa  890    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.436975  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2506  hypothetical protein  46.34 
 
 
462 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0499  hypothetical protein  39.42 
 
 
442 aa  281  2e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3848  hypothetical protein  39.69 
 
 
469 aa  279  6e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3118  hypothetical protein  39.47 
 
 
469 aa  279  6e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0412381  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1184  hypothetical protein  39.09 
 
 
465 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3530  hypothetical protein  38.05 
 
 
445 aa  272  1e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3286  hypothetical protein  38.6 
 
 
466 aa  270  4e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.694377  normal  0.162486 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1779  hypothetical protein  38.66 
 
 
474 aa  263  3e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0763  beta-lactamase domain-containing protein  34.59 
 
 
455 aa  258  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0759  hypothetical protein  39.15 
 
 
455 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.786998  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3604  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family  40.3 
 
 
460 aa  251  2e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0606198  normal  0.410787 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3720  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  40.95 
 
 
460 aa  244  3e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.481201  normal  0.0318368 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3411  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  40.95 
 
 
460 aa  244  3e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.574536 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16190  hypothetical protein  38.7 
 
 
470 aa  240  4e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326397  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1687  FAD dependent oxidoreductase  38.14 
 
 
445 aa  239  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434523  normal  0.201156 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5118  hypothetical protein  35.71 
 
 
444 aa  235  1.0000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.917814  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1955  hypothetical protein  35.82 
 
 
470 aa  231  2e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03362  putative secreted protein  37.09 
 
 
471 aa  231  2e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0229987  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1051  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family  37.03 
 
 
474 aa  229  1e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.169159 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0065  hypothetical protein  37.91 
 
 
473 aa  228  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.701081  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0771  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.32 
 
 
481 aa  221  3e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13756 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1636  hypothetical protein  35.34 
 
 
466 aa  219  7e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.117479  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1413  hypothetical protein  35.34 
 
 
466 aa  219  7e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.451407  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3175  hypothetical protein  35.34 
 
 
466 aa  219  7e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.333375  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2576  hypothetical protein  35.34 
 
 
466 aa  219  7e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2523  hypothetical protein  35.34 
 
 
466 aa  219  7e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2664  hypothetical protein  35.13 
 
 
466 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6633  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  38.6 
 
 
468 aa  218  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0685536 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6552  hypothetical protein  35.18 
 
 
453 aa  216  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0462223  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5579  hypothetical protein  33.48 
 
 
456 aa  212  9e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2050  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  33.69 
 
 
482 aa  206  9e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.765527  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4518  FAD dependent oxidoreductase  32.68 
 
 
485 aa  202  9e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.42013 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2427  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.42 
 
 
455 aa  202  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.232176  normal  0.116693 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3249  hypothetical protein  33.48 
 
 
467 aa  197  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3277  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.77 
 
 
443 aa  195  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6060  hypothetical protein  33.87 
 
 
454 aa  194  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1700  StAR  32.83 
 
 
479 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.91604  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3948  hypothetical protein  33.41 
 
 
473 aa  188  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3468  hypothetical protein  33.26 
 
 
467 aa  184  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.343102  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4618  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.51 
 
 
883 aa  183  6e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3307  hypothetical protein  32.32 
 
 
471 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2371  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.62 
 
 
475 aa  181  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.447406  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0280  FAD dependent oxidoreductase  32.04 
 
 
478 aa  178  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03231  hypothetical protein  30.45 
 
 
464 aa  177  3e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0311  putative FAD-dependent oxidoreductase protein  32.4 
 
 
478 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2156  FAD dependent oxidoreductase  29.55 
 
 
480 aa  171  3e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5466  hypothetical protein  29.49 
 
 
499 aa  168  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1846  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2138  hypothetical protein  36.99 
 
 
1751 aa  168  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4721  FAD dependent oxidoreductase  28.02 
 
 
523 aa  168  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.450266  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7141  hypothetical protein  27.29 
 
 
468 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5540  hypothetical protein  25.61 
 
 
506 aa  123  8e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.621882  normal  0.230055 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4517  hypothetical protein  27.91 
 
 
466 aa  120  6e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.198903 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5992  hypothetical protein  26.57 
 
 
468 aa  119  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4369  hypothetical protein  28.54 
 
 
458 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.144671 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4223  hypothetical protein  40.23 
 
 
125 aa  78.2  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.284789  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1859  hypothetical protein  20.83 
 
 
500 aa  67.8  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1824  hypothetical protein  20.83 
 
 
500 aa  67.8  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5543  hypothetical protein  26.83 
 
 
490 aa  67.4  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1329  hypothetical protein  19.06 
 
 
494 aa  63.2  0.000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.230961  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3372  hypothetical protein  43.24 
 
 
239 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4122  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.7 
 
 
608 aa  58.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3524  hypothetical protein  30.36 
 
 
633 aa  54.7  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.284733  normal  0.8933 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1518  FAD dependent oxidoreductase  23.68 
 
 
642 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0276  FAD dependent oxidoreductase  24.26 
 
 
479 aa  54.7  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1541  FAD dependent oxidoreductase  23.68 
 
 
642 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.394648  normal  0.706524 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2675  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  51.06 
 
 
61 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3022  hypothetical protein  26.38 
 
 
507 aa  44.7  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0268135  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3018  hypothetical protein  27.45 
 
 
603 aa  43.9  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0249937  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5201  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.9 
 
 
381 aa  43.5  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5289  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.9 
 
 
381 aa  43.5  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.655733  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5581  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.57 
 
 
381 aa  43.9  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0864105  normal  0.634678 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>