79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2487 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2487  hypothetical protein  100 
 
 		 477 aa  927    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00182169 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3022  hypothetical protein  31.19 
 
 		 507 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0268135  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5543  hypothetical protein  35.13 
 
 		 490 aa  180  4.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1329  hypothetical protein  22.77 
 
 		 494 aa  142  9.999999999999999e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.230961  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1859  hypothetical protein  22.6 
 
 		 500 aa  132  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1824  hypothetical protein  22.6 
 
 		 500 aa  132  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5540  hypothetical protein  22.7 
 
 		 506 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.621882  normal  0.230055 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0685  hypothetical protein  23.78 
 
 		 472 aa  100  6e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00218471  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2371  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.35 
 
 		 475 aa  89  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.447406  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03362  putative secreted protein  29.26 
 
 		 471 aa  86.7  8e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0229987  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3130  hypothetical protein  24.94 
 
 		 572 aa  85.5  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1687  FAD dependent oxidoreductase  33.75 
 
 		 445 aa  84  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434523  normal  0.201156 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0280  FAD dependent oxidoreductase  36.67 
 
 		 478 aa  84  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0763  beta-lactamase domain-containing protein  24.09 
 
 		 455 aa  83.6  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4618  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.93 
 
 		 883 aa  82.4  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0311  putative FAD-dependent oxidoreductase protein  35.02 
 
 		 478 aa  77  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5579  hypothetical protein  28.57 
 
 		 456 aa  75.5  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0771  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.62 
 
 		 481 aa  75.5  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13756 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1779  hypothetical protein  28.74 
 
 		 474 aa  74.3  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4518  FAD dependent oxidoreductase  30.6 
 
 		 485 aa  72.8  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.42013 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6552  hypothetical protein  28.57 
 
 		 453 aa  72.8  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0462223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0759  hypothetical protein  31.82 
 
 		 455 aa  72.8  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.786998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1051  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family  31.84 
 
 		 474 aa  72.8  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.169159 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4721  FAD dependent oxidoreductase  27.87 
 
 		 523 aa  72  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.450266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3948  hypothetical protein  31.2 
 
 		 473 aa  71.6  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1184  hypothetical protein  32.51 
 
 		 465 aa  69.7  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1700  StAR  30.2 
 
 		 479 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.91604  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0065  hypothetical protein  30 
 
 		 473 aa  68.9  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.701081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3411  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  31.22 
 
 		 460 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574536 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2506  hypothetical protein  32.11 
 
 		 462 aa  67.8  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3720  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  31.22 
 
 		 460 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.481201  normal  0.0318368 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3530  hypothetical protein  28.63 
 
 		 445 aa  67.4  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3468  hypothetical protein  30.04 
 
 		 467 aa  67  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.343102  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1824  hypothetical protein  24.06 
 
 		 582 aa  66.6  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000311233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3604  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family  31.22 
 
 		 460 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0606198  normal  0.410787 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3286  hypothetical protein  30.17 
 
 		 466 aa  65.9  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.694377  normal  0.162486 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3307  hypothetical protein  31.86 
 
 		 471 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6060  hypothetical protein  30.92 
 
 		 454 aa  65.5  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7141  hypothetical protein  25.64 
 
 		 468 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3277  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.24 
 
 		 443 aa  65.1  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5992  hypothetical protein  26.36 
 
 		 468 aa  64.7  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0499  hypothetical protein  27.27 
 
 		 442 aa  63.5  0.000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1955  hypothetical protein  32.07 
 
 		 470 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5466  hypothetical protein  26.53 
 
 		 499 aa  59.7  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1846  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1636  hypothetical protein  27.8 
 
 		 466 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.117479  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2664  hypothetical protein  27.8 
 
 		 466 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3175  hypothetical protein  27.8 
 
 		 466 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.333375  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1413  hypothetical protein  27.8 
 
 		 466 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.451407  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2576  hypothetical protein  27.8 
 
 		 466 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3848  hypothetical protein  28.1 
 
 		 469 aa  59.3  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2523  hypothetical protein  29.83 
 
 		 466 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2050  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  26.01 
 
 		 482 aa  58.9  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.765527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03231  hypothetical protein  31.62 
 
 		 464 aa  59.3  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2138  hypothetical protein  29.83 
 
 		 1751 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3118  hypothetical protein  29.71 
 
 		 469 aa  58.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0412381  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0206  hypothetical protein  22.12 
 
 		 580 aa  57.8  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2156  FAD dependent oxidoreductase  27.54 
 
 		 480 aa  57.8  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1963  hypothetical protein  23.43 
 
 		 534 aa  55.1  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000030745 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1749  hypothetical protein  23.43 
 
 		 534 aa  55.1  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000314791  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0276  FAD dependent oxidoreductase  25.54 
 
 		 479 aa  54.7  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5118  hypothetical protein  31.3 
 
 		 444 aa  54.3  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.917814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6633  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  31.8 
 
 		 468 aa  53.9  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0685536 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2381  hypothetical protein  22.14 
 
 		 534 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000071971  hitchhiker  0.00180659 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3875  hypothetical protein  25.16 
 
 		 534 aa  53.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.408121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3249  hypothetical protein  45.76 
 
 		 467 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16190  hypothetical protein  27.09 
 
 		 470 aa  52  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326397  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01627  hypothetical protein  22.14 
 
 		 534 aa  52  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.373231  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1974  conserved hypothetical protein  22.14 
 
 		 534 aa  52  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000437192  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01637  conserved protein with FAD/NAD(P)-binding domain  22.14 
 
 		 534 aa  52  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.395296  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4517  hypothetical protein  24.36 
 
 		 466 aa  49.7  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.198903 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3137  hypothetical protein  24.26 
 
 		 534 aa  49.7  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1205  hypothetical protein  31.33 
 
 		 593 aa  47.4  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.721959  normal  1 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4291  hypothetical protein  25.86 
 
 		 483 aa  47  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.814822  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3524  hypothetical protein  37.5 
 
 		 633 aa  45.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.284733  normal  0.8933 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0810  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.93 
 
 		 409 aa  44.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1782  hypothetical protein  21.19 
 
 		 536 aa  44.7  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432759 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1163  hypothetical protein  26.7 
 
 		 742 aa  44.7  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3661  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.54 
 
 		 398 aa  44.3  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.165286 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4122  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.84 
 
 		 608 aa  43.9  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>