57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_1824 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1329  hypothetical protein  70.37 
 
 
494 aa  736    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.230961  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1824  hypothetical protein  100 
 
 
500 aa  1044    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1859  hypothetical protein  100 
 
 
500 aa  1044    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0685  hypothetical protein  27.61 
 
 
472 aa  173  6.999999999999999e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00218471  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5540  hypothetical protein  23.12 
 
 
506 aa  133  9e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.621882  normal  0.230055 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5543  hypothetical protein  22.03 
 
 
490 aa  129  9.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2487  hypothetical protein  22.49 
 
 
477 aa  111  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00182169 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3022  hypothetical protein  22.12 
 
 
507 aa  107  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0268135  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1779  hypothetical protein  19.15 
 
 
474 aa  78.6  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1687  FAD dependent oxidoreductase  20.9 
 
 
445 aa  77.4  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434523  normal  0.201156 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0763  beta-lactamase domain-containing protein  22.78 
 
 
455 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0065  hypothetical protein  20.96 
 
 
473 aa  72.8  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.701081  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3277  hydroxyacylglutathione hydrolase  21.53 
 
 
443 aa  71.6  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4518  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 
485 aa  70.1  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.42013 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2371  hydroxyacylglutathione hydrolase  21.5 
 
 
475 aa  69.3  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.447406  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2664  hypothetical protein  21.98 
 
 
466 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3130  hypothetical protein  22.6 
 
 
572 aa  69.3  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1636  hypothetical protein  21.98 
 
 
466 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.117479  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3175  hypothetical protein  21.98 
 
 
466 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.333375  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2576  hypothetical protein  21.98 
 
 
466 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1413  hypothetical protein  21.98 
 
 
466 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.451407  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2523  hypothetical protein  21.98 
 
 
466 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3458  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  20.79 
 
 
453 aa  65.5  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.436975  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1955  hypothetical protein  21.55 
 
 
470 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2156  FAD dependent oxidoreductase  20.16 
 
 
480 aa  65.1  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0276  FAD dependent oxidoreductase  24.79 
 
 
479 aa  63.5  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1859  FAD(NAD)-dependent oxidoreductase  21.81 
 
 
623 aa  62.8  0.00000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0771  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  19.13 
 
 
481 aa  63.2  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13756 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5118  hypothetical protein  19.36 
 
 
444 aa  61.2  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.917814  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0206  hypothetical protein  20.71 
 
 
580 aa  60.5  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3948  hypothetical protein  21.53 
 
 
473 aa  60.5  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2427  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  19.03 
 
 
455 aa  59.7  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.232176  normal  0.116693 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1184  hypothetical protein  18.02 
 
 
465 aa  59.3  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2356  hypothetical protein  20.47 
 
 
578 aa  58.9  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.124336 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2050  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  18.87 
 
 
482 aa  58.9  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.765527  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5466  hypothetical protein  18.98 
 
 
499 aa  58.2  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1846  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3286  hypothetical protein  19.76 
 
 
466 aa  58.5  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.694377  normal  0.162486 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0311  putative FAD-dependent oxidoreductase protein  17.96 
 
 
478 aa  57.4  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2138  hypothetical protein  21.98 
 
 
1751 aa  57.4  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0499  hypothetical protein  18.56 
 
 
442 aa  55.8  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0280  FAD dependent oxidoreductase  24.76 
 
 
478 aa  55.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16190  hypothetical protein  20.59 
 
 
470 aa  55.1  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326397  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3468  hypothetical protein  19.06 
 
 
467 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.343102  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4517  hypothetical protein  19.39 
 
 
466 aa  49.7  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.198903 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03231  hypothetical protein  20.65 
 
 
464 aa  48.5  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4618  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  20.09 
 
 
883 aa  48.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3875  hypothetical protein  21.45 
 
 
534 aa  47.4  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.408121  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3137  hypothetical protein  21.45 
 
 
534 aa  47  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0759  hypothetical protein  18.55 
 
 
455 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.786998  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01637  conserved protein with FAD/NAD(P)-binding domain  19.47 
 
 
534 aa  46.6  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.395296  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01627  hypothetical protein  19.47 
 
 
534 aa  46.6  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.373231  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2381  hypothetical protein  19.81 
 
 
534 aa  46.2  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000071971  hitchhiker  0.00180659 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1974  conserved hypothetical protein  19.47 
 
 
534 aa  46.6  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000437192  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1824  hypothetical protein  21.59 
 
 
582 aa  45.8  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000311233  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1700  StAR  21.34 
 
 
479 aa  43.9  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.91604  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1749  hypothetical protein  19.39 
 
 
534 aa  43.9  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000314791  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1963  hypothetical protein  19.39 
 
 
534 aa  43.9  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000030745 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>