54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4369 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_4369  hypothetical protein  100 
 
 
458 aa  925    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.144671 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7141  hypothetical protein  43.68 
 
 
468 aa  333  5e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5992  hypothetical protein  44.25 
 
 
468 aa  323  5e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4517  hypothetical protein  44.16 
 
 
466 aa  322  8e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.198903 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5118  hypothetical protein  27.39 
 
 
444 aa  144  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.917814  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0763  beta-lactamase domain-containing protein  25.27 
 
 
455 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3530  hypothetical protein  26.89 
 
 
445 aa  133  6e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3848  hypothetical protein  27.54 
 
 
469 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3118  hypothetical protein  28.41 
 
 
469 aa  130  3e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0412381  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0759  hypothetical protein  27.15 
 
 
455 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.786998  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0499  hypothetical protein  26.16 
 
 
442 aa  120  7e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3286  hypothetical protein  27.27 
 
 
466 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.694377  normal  0.162486 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3948  hypothetical protein  25.05 
 
 
473 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2156  FAD dependent oxidoreductase  24.26 
 
 
480 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3249  hypothetical protein  26.33 
 
 
467 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0065  hypothetical protein  28.91 
 
 
473 aa  107  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.701081  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1779  hypothetical protein  25.53 
 
 
474 aa  107  6e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1184  hypothetical protein  26.54 
 
 
465 aa  105  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1051  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family  24.94 
 
 
474 aa  105  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.169159 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3720  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  27.99 
 
 
460 aa  105  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.481201  normal  0.0318368 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3411  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  27.99 
 
 
460 aa  105  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.574536 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3458  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.54 
 
 
453 aa  103  8e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.436975  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6633  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  27.9 
 
 
468 aa  102  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0685536 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4518  FAD dependent oxidoreductase  26.48 
 
 
485 aa  102  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.42013 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3604  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family  26.91 
 
 
460 aa  101  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0606198  normal  0.410787 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3468  hypothetical protein  25.64 
 
 
467 aa  99  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.343102  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3277  hydroxyacylglutathione hydrolase  26.14 
 
 
443 aa  97.1  6e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03231  hypothetical protein  25.54 
 
 
464 aa  96.7  8e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2371  hydroxyacylglutathione hydrolase  25.27 
 
 
475 aa  94.7  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.447406  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2506  hypothetical protein  26.45 
 
 
462 aa  92.4  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3307  hypothetical protein  26.79 
 
 
471 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5579  hypothetical protein  27.38 
 
 
456 aa  92.4  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1700  StAR  25.96 
 
 
479 aa  90.5  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.91604  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6060  hypothetical protein  24.91 
 
 
454 aa  87.8  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6552  hypothetical protein  26.24 
 
 
453 aa  87.4  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0462223  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03362  putative secreted protein  24.63 
 
 
471 aa  86.3  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0229987  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1687  FAD dependent oxidoreductase  25.93 
 
 
445 aa  85.1  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434523  normal  0.201156 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4721  FAD dependent oxidoreductase  24.47 
 
 
523 aa  85.1  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.450266  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1955  hypothetical protein  25.24 
 
 
470 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0771  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.63 
 
 
481 aa  84.3  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13756 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1636  hypothetical protein  23.79 
 
 
466 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.117479  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2523  hypothetical protein  23.79 
 
 
466 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2576  hypothetical protein  23.79 
 
 
466 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3175  hypothetical protein  23.79 
 
 
466 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.333375  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1413  hypothetical protein  23.79 
 
 
466 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.451407  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2664  hypothetical protein  23.79 
 
 
466 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4618  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.72 
 
 
883 aa  80.1  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2138  hypothetical protein  24.29 
 
 
1751 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5466  hypothetical protein  21.78 
 
 
499 aa  78.2  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1846  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2427  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.49 
 
 
455 aa  77  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.232176  normal  0.116693 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16190  hypothetical protein  23.81 
 
 
470 aa  75.1  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326397  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0311  putative FAD-dependent oxidoreductase protein  25.31 
 
 
478 aa  71.2  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0280  FAD dependent oxidoreductase  24.59 
 
 
478 aa  69.7  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2050  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  21.78 
 
 
482 aa  68.2  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.765527  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>