68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5466 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5466  hypothetical protein  100 
 
 		 499 aa  1004    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1846  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4518  FAD dependent oxidoreductase  47.91 
 
 		 485 aa  399  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.42013 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0311  putative FAD-dependent oxidoreductase protein  43.86 
 
 		 478 aa  353  5.9999999999999994e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0280  FAD dependent oxidoreductase  44.65 
 
 		 478 aa  350  4e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6060  hypothetical protein  41.38 
 
 		 454 aa  338  9.999999999999999e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0771  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.04 
 
 		 481 aa  331  2e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13756 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2050  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  32.42 
 
 		 482 aa  232  1e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.765527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3286  hypothetical protein  30.56 
 
 		 466 aa  192  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.694377  normal  0.162486 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4721  FAD dependent oxidoreductase  28.97 
 
 		 523 aa  189  9e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.450266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0763  beta-lactamase domain-containing protein  29.25 
 
 		 455 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03362  putative secreted protein  30.66 
 
 		 471 aa  182  2e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0229987  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1051  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family  31.95 
 
 		 474 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.169159 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2371  hydroxyacylglutathione hydrolase  31.22 
 
 		 475 aa  173  6.999999999999999e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.447406  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0499  hypothetical protein  29.07 
 
 		 442 aa  169  8e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0065  hypothetical protein  30.88 
 
 		 473 aa  169  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.701081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3530  hypothetical protein  29.35 
 
 		 445 aa  167  5.9999999999999996e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5118  hypothetical protein  29.21 
 
 		 444 aa  166  8e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.917814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2664  hypothetical protein  30.5 
 
 		 466 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3175  hypothetical protein  30.5 
 
 		 466 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.333375  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1413  hypothetical protein  30.5 
 
 		 466 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.451407  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2576  hypothetical protein  30.5 
 
 		 466 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2523  hypothetical protein  30.5 
 
 		 466 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1636  hypothetical protein  30.5 
 
 		 466 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.117479  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2506  hypothetical protein  30.39 
 
 		 462 aa  163  6e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1955  hypothetical protein  30.52 
 
 		 470 aa  163  7e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3458  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.49 
 
 		 453 aa  159  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.436975  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16190  hypothetical protein  30.61 
 
 		 470 aa  158  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326397  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3307  hypothetical protein  29.09 
 
 		 471 aa  157  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3277  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.25 
 
 		 443 aa  156  8e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3720  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  32.2 
 
 		 460 aa  155  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.481201  normal  0.0318368 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3411  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  32.2 
 
 		 460 aa  155  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574536 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1779  hypothetical protein  29.24 
 
 		 474 aa  155  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3468  hypothetical protein  28.82 
 
 		 467 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.343102  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6552  hypothetical protein  29.72 
 
 		 453 aa  152  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0462223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1687  FAD dependent oxidoreductase  29.27 
 
 		 445 aa  152  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434523  normal  0.201156 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3604  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family  30.09 
 
 		 460 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0606198  normal  0.410787 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6633  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  33.69 
 
 		 468 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0685536 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3118  hypothetical protein  29.21 
 
 		 469 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0412381  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1184  hypothetical protein  29.61 
 
 		 465 aa  147  6e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3848  hypothetical protein  29 
 
 		 469 aa  146  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5579  hypothetical protein  29 
 
 		 456 aa  145  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2427  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.52 
 
 		 455 aa  144  4e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.232176  normal  0.116693 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3249  hypothetical protein  28.63 
 
 		 467 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3948  hypothetical protein  29.23 
 
 		 473 aa  142  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4618  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.31 
 
 		 883 aa  141  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2156  FAD dependent oxidoreductase  28.4 
 
 		 480 aa  138  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0759  hypothetical protein  27.27 
 
 		 455 aa  137  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.786998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03231  hypothetical protein  28.27 
 
 		 464 aa  132  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2138  hypothetical protein  31.93 
 
 		 1751 aa  130  6e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4517  hypothetical protein  26.06 
 
 		 466 aa  123  6e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.198903 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1700  StAR  26.79 
 
 		 479 aa  114  6e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.91604  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7141  hypothetical protein  26.13 
 
 		 468 aa  113  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5992  hypothetical protein  25.76 
 
 		 468 aa  107  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5540  hypothetical protein  22.44 
 
 		 506 aa  87.4  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.621882  normal  0.230055 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4369  hypothetical protein  21.78 
 
 		 458 aa  78.2  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.144671 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5543  hypothetical protein  26.35 
 
 		 490 aa  71.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1329  hypothetical protein  19.87 
 
 		 494 aa  65.5  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.230961  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1859  hypothetical protein  18.98 
 
 		 500 aa  58.2  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1824  hypothetical protein  18.98 
 
 		 500 aa  58.2  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4223  hypothetical protein  34.58 
 
 		 125 aa  57.4  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.284789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3022  hypothetical protein  23.85 
 
 		 507 aa  55.8  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0268135  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4291  hypothetical protein  26.09 
 
 		 483 aa  53.1  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.814822  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2487  hypothetical protein  28.64 
 
 		 477 aa  51.2  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00182169 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3524  hypothetical protein  28.41 
 
 		 633 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.284733  normal  0.8933 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2071  FAD(NAD)-dependent oxidoreductase  25.2 
 
 		 616 aa  47.4  0.0006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0685  hypothetical protein  20.77 
 
 		 472 aa  44.7  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00218471  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5301  hypothetical protein  38.6 
 
 		 303 aa  44.3  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.730903  normal  0.0168693 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0276  FAD dependent oxidoreductase  25.69 
 
 		 479 aa  43.9  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>