74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3022 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3022  hypothetical protein  100 
 
 
507 aa  1040    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0268135  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2487  hypothetical protein  31.47 
 
 
477 aa  179  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00182169 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5543  hypothetical protein  31.11 
 
 
490 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1329  hypothetical protein  24.35 
 
 
494 aa  115  3e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.230961  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0685  hypothetical protein  26.26 
 
 
472 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00218471  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1824  hypothetical protein  22.12 
 
 
500 aa  107  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1859  hypothetical protein  22.12 
 
 
500 aa  107  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5540  hypothetical protein  22.29 
 
 
506 aa  97.4  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.621882  normal  0.230055 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3277  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.77 
 
 
443 aa  95.1  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03362  putative secreted protein  25.35 
 
 
471 aa  90.5  7e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0229987  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5118  hypothetical protein  25.05 
 
 
444 aa  83.2  0.000000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.917814  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1779  hypothetical protein  24.66 
 
 
474 aa  77.4  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1687  FAD dependent oxidoreductase  27.54 
 
 
445 aa  75.1  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434523  normal  0.201156 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0763  beta-lactamase domain-containing protein  24.02 
 
 
455 aa  75.1  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3948  hypothetical protein  28.27 
 
 
473 aa  71.2  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4517  hypothetical protein  26.75 
 
 
466 aa  71.2  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.198903 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0771  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.28 
 
 
481 aa  70.5  0.00000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13756 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3530  hypothetical protein  27.05 
 
 
445 aa  70.5  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6552  hypothetical protein  28.4 
 
 
453 aa  70.1  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0462223  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3118  hypothetical protein  27.8 
 
 
469 aa  69.7  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0412381  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3848  hypothetical protein  27.73 
 
 
469 aa  68.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3249  hypothetical protein  28.16 
 
 
467 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5579  hypothetical protein  28.87 
 
 
456 aa  67  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0065  hypothetical protein  23.95 
 
 
473 aa  67  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.701081  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1051  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family  28.81 
 
 
474 aa  64.7  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.169159 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3307  hypothetical protein  29.38 
 
 
471 aa  63.5  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4291  hypothetical protein  27.67 
 
 
483 aa  62.8  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.814822  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0759  hypothetical protein  27 
 
 
455 aa  62.4  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.786998  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1782  hypothetical protein  24.17 
 
 
536 aa  62.4  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00432759 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3468  hypothetical protein  27.35 
 
 
467 aa  60.8  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.343102  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2050  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  23.79 
 
 
482 aa  58.5  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.765527  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2523  hypothetical protein  26.4 
 
 
466 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2138  hypothetical protein  26.5 
 
 
1751 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2506  hypothetical protein  30 
 
 
462 aa  58.5  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3175  hypothetical protein  26.4 
 
 
466 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.333375  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2664  hypothetical protein  26.4 
 
 
466 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1413  hypothetical protein  26.4 
 
 
466 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.451407  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2576  hypothetical protein  26.4 
 
 
466 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1636  hypothetical protein  26.4 
 
 
466 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.117479  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3286  hypothetical protein  26.22 
 
 
466 aa  57.8  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.694377  normal  0.162486 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1963  hypothetical protein  24.03 
 
 
534 aa  57.4  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000030745 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1749  hypothetical protein  24.03 
 
 
534 aa  57.4  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000314791  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03231  hypothetical protein  23.97 
 
 
464 aa  56.6  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3137  hypothetical protein  25.84 
 
 
534 aa  55.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3875  hypothetical protein  25.17 
 
 
534 aa  55.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.408121  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5466  hypothetical protein  23.85 
 
 
499 aa  55.8  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1846  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1955  hypothetical protein  26.5 
 
 
470 aa  55.1  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0499  hypothetical protein  23.56 
 
 
442 aa  55.1  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2381  hypothetical protein  23.64 
 
 
534 aa  54.7  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000071971  hitchhiker  0.00180659 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2371  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.45 
 
 
475 aa  54.3  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.447406  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41800  hypothetical protein  22.47 
 
 
615 aa  53.9  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3411  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  27.32 
 
 
460 aa  53.9  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.574536 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3720  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  27.32 
 
 
460 aa  53.9  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.481201  normal  0.0318368 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01637  conserved protein with FAD/NAD(P)-binding domain  22.96 
 
 
534 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.395296  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1974  conserved hypothetical protein  22.96 
 
 
534 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000437192  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01627  hypothetical protein  22.96 
 
 
534 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.373231  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1458  putative lipoprotein  26.97 
 
 
624 aa  53.1  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.342191  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1824  hypothetical protein  24.75 
 
 
582 aa  51.6  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000311233  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0617  hypothetical protein  23.79 
 
 
624 aa  51.2  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.108776  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3604  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family  26.11 
 
 
460 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0606198  normal  0.410787 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1859  FAD(NAD)-dependent oxidoreductase  19.51 
 
 
623 aa  50.4  0.00007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1184  hypothetical protein  28.19 
 
 
465 aa  50.4  0.00008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2744  hypothetical protein  25.47 
 
 
580 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0706789  normal  0.0306402 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4721  FAD dependent oxidoreductase  24.8 
 
 
523 aa  48.9  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.450266  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6633  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  28.93 
 
 
468 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0685536 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2071  FAD(NAD)-dependent oxidoreductase  23.35 
 
 
616 aa  47.8  0.0005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5992  hypothetical protein  24.63 
 
 
468 aa  47.4  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0457  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.82 
 
 
421 aa  47  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.772046 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1700  StAR  25 
 
 
479 aa  47  0.0009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.91604  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2959  hypothetical protein  25.78 
 
 
551 aa  46.2  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0119375  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4518  FAD dependent oxidoreductase  26.18 
 
 
485 aa  46.6  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.42013 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1163  hypothetical protein  20.58 
 
 
742 aa  45.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7141  hypothetical protein  23.12 
 
 
468 aa  45.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3130  hypothetical protein  23.72 
 
 
572 aa  45.1  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>