32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3018 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_3018  hypothetical protein  100 
 
 
603 aa  1226    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0249937  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1050  hypothetical protein  61.82 
 
 
618 aa  745    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.526264  normal  0.107352 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4655  hypothetical protein  41.9 
 
 
770 aa  453  1.0000000000000001e-126  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.134449  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4373  hypothetical protein  36.35 
 
 
633 aa  449  1e-125  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.32896e-21 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1859  FAD(NAD)-dependent oxidoreductase  30.81 
 
 
623 aa  325  2e-87  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2381  hypothetical protein  37.66 
 
 
584 aa  324  4e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1458  putative lipoprotein  34.42 
 
 
624 aa  318  1e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.342191  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4347  hypothetical protein  35.25 
 
 
675 aa  302  1e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2071  FAD(NAD)-dependent oxidoreductase  30.29 
 
 
616 aa  278  2e-73  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3711  hypothetical protein  33.28 
 
 
654 aa  277  3e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0676  hypothetical protein  31.76 
 
 
659 aa  268  2.9999999999999995e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.758616  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0823  hypothetical protein  31.55 
 
 
651 aa  259  9e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6222  hypothetical protein  34.34 
 
 
619 aa  256  1.0000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.690917  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3910  hypothetical protein  31.4 
 
 
673 aa  254  3e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3473  hypothetical protein  32.5 
 
 
638 aa  248  3e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02280  predicted dinucleotide-binding enzyme  32.79 
 
 
867 aa  244  3.9999999999999997e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0929  hypothetical protein  31.43 
 
 
692 aa  239  1e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0568347  normal  0.0205131 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03600  hypothetical protein  31.34 
 
 
651 aa  216  7e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41800  hypothetical protein  28.59 
 
 
615 aa  213  5.999999999999999e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17770  hypothetical protein  31.34 
 
 
644 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.413089  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0617  hypothetical protein  30.86 
 
 
624 aa  192  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.108776  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2744  hypothetical protein  30.85 
 
 
580 aa  177  6e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0706789  normal  0.0306402 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11200  hypothetical protein  40.67 
 
 
593 aa  171  4e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2959  hypothetical protein  27.15 
 
 
551 aa  159  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0119375  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1205  hypothetical protein  28.63 
 
 
593 aa  158  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.721959  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1163  hypothetical protein  30.35 
 
 
742 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11418  hypothetical protein  22.29 
 
 
580 aa  89  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.227142  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2537  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  30.37 
 
 
1072 aa  80.9  0.00000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4291  hypothetical protein  28.68 
 
 
483 aa  47.4  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.814822  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3458  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.48 
 
 
453 aa  46.2  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.436975  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1779  hypothetical protein  27.38 
 
 
474 aa  44.3  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0499  hypothetical protein  29.46 
 
 
442 aa  44.3  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>