27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3473 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_3473  hypothetical protein  100 
 
 
638 aa  1235    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0929  hypothetical protein  55.1 
 
 
692 aa  595  1e-169  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0568347  normal  0.0205131 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2381  hypothetical protein  44.94 
 
 
584 aa  436  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6222  hypothetical protein  45.95 
 
 
619 aa  432  1e-119  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.690917  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4347  hypothetical protein  43.78 
 
 
675 aa  428  1e-118  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3711  hypothetical protein  42.7 
 
 
654 aa  423  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3910  hypothetical protein  42.36 
 
 
673 aa  415  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02280  predicted dinucleotide-binding enzyme  37.67 
 
 
867 aa  286  5.999999999999999e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3018  hypothetical protein  31.9 
 
 
603 aa  254  3e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0249937  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1050  hypothetical protein  33.76 
 
 
618 aa  253  8.000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.526264  normal  0.107352 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4373  hypothetical protein  26.4 
 
 
633 aa  232  2e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.32896e-21 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0823  hypothetical protein  32.43 
 
 
651 aa  209  1e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0676  hypothetical protein  32.97 
 
 
659 aa  205  2e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.758616  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4655  hypothetical protein  39.71 
 
 
770 aa  190  5.999999999999999e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.134449  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17770  hypothetical protein  33.09 
 
 
644 aa  179  1e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.413089  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11200  hypothetical protein  33.07 
 
 
593 aa  172  2e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03600  hypothetical protein  30.47 
 
 
651 aa  168  2.9999999999999998e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1859  FAD(NAD)-dependent oxidoreductase  24.17 
 
 
623 aa  167  5e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1458  putative lipoprotein  26.23 
 
 
624 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.342191  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2071  FAD(NAD)-dependent oxidoreductase  26.96 
 
 
616 aa  149  2.0000000000000003e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0617  hypothetical protein  28.92 
 
 
624 aa  130  8.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.108776  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2744  hypothetical protein  26.32 
 
 
580 aa  125  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0706789  normal  0.0306402 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2959  hypothetical protein  28.12 
 
 
551 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0119375  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41800  hypothetical protein  23.16 
 
 
615 aa  111  5e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11418  hypothetical protein  20.78 
 
 
580 aa  107  9e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.227142  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1163  hypothetical protein  27.2 
 
 
742 aa  102  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1205  hypothetical protein  24.52 
 
 
593 aa  95.5  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.721959  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>