28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4347 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4347  hypothetical protein  100 
 
 
675 aa  1317    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6222  hypothetical protein  48.24 
 
 
619 aa  469  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.690917  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2381  hypothetical protein  45.85 
 
 
584 aa  449  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3910  hypothetical protein  42.94 
 
 
673 aa  428  1e-118  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3711  hypothetical protein  41.5 
 
 
654 aa  419  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3473  hypothetical protein  43.56 
 
 
638 aa  419  1e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0929  hypothetical protein  42.6 
 
 
692 aa  415  1e-114  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0568347  normal  0.0205131 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1050  hypothetical protein  35.87 
 
 
618 aa  320  6e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.526264  normal  0.107352 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02280  predicted dinucleotide-binding enzyme  38.1 
 
 
867 aa  312  1e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3018  hypothetical protein  35.24 
 
 
603 aa  311  2.9999999999999997e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0249937  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4655  hypothetical protein  33.96 
 
 
770 aa  281  4e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.134449  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4373  hypothetical protein  29.79 
 
 
633 aa  266  8e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.32896e-21 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0676  hypothetical protein  36.02 
 
 
659 aa  265  3e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.758616  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0823  hypothetical protein  34.76 
 
 
651 aa  241  2.9999999999999997e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03600  hypothetical protein  35.25 
 
 
651 aa  239  1e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17770  hypothetical protein  32.5 
 
 
644 aa  225  2e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.413089  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2071  FAD(NAD)-dependent oxidoreductase  28.57 
 
 
616 aa  215  1.9999999999999998e-54  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1859  FAD(NAD)-dependent oxidoreductase  26.65 
 
 
623 aa  186  9e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11200  hypothetical protein  37.42 
 
 
593 aa  162  2e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1458  putative lipoprotein  26.22 
 
 
624 aa  162  3e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.342191  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41800  hypothetical protein  26.29 
 
 
615 aa  135  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0617  hypothetical protein  28.2 
 
 
624 aa  120  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.108776  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2744  hypothetical protein  25.17 
 
 
580 aa  117  8.999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0706789  normal  0.0306402 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1205  hypothetical protein  26.93 
 
 
593 aa  111  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.721959  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1163  hypothetical protein  26.34 
 
 
742 aa  104  5e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2959  hypothetical protein  24.92 
 
 
551 aa  103  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0119375  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11418  hypothetical protein  19.55 
 
 
580 aa  81.3  0.00000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.227142  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2050  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  35.04 
 
 
482 aa  48.5  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.765527  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>