30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3875 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3137  hypothetical protein  98.69 
 
 		 534 aa  1072    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3875  hypothetical protein  100 
 
 		 534 aa  1083    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.408121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1963  hypothetical protein  52.87 
 
 		 534 aa  561  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000030745 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1749  hypothetical protein  52.87 
 
 		 534 aa  561  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000314791  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1974  conserved hypothetical protein  52.69 
 
 		 534 aa  560  1e-158  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000437192  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01637  conserved protein with FAD/NAD(P)-binding domain  52.69 
 
 		 534 aa  560  1e-158  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.395296  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01627  hypothetical protein  52.69 
 
 		 534 aa  560  1e-158  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.373231  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2381  hypothetical protein  52.5 
 
 		 534 aa  555  1e-157  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000071971  hitchhiker  0.00180659 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1782  hypothetical protein  52.78 
 
 		 536 aa  553  1e-156  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432759 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0206  hypothetical protein  25.89 
 
 		 580 aa  159  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1824  hypothetical protein  26.85 
 
 		 582 aa  157  7e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000311233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3130  hypothetical protein  24.89 
 
 		 572 aa  145  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2356  hypothetical protein  25 
 
 		 578 aa  144  4e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.124336 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1868  FAD dependent oxidoreductase  44.29 
 
 		 85 aa  68.6  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.189334  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5543  hypothetical protein  25.45 
 
 		 490 aa  61.6  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3022  hypothetical protein  25.17 
 
 		 507 aa  55.5  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0268135  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3530  hypothetical protein  26.85 
 
 		 445 aa  54.3  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1051  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family  25 
 
 		 474 aa  49.7  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.169159 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0499  hypothetical protein  24.77 
 
 		 442 aa  47.8  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1859  hypothetical protein  21.45 
 
 		 500 aa  47.4  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1824  hypothetical protein  21.45 
 
 		 500 aa  47.4  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3848  hypothetical protein  26.98 
 
 		 469 aa  46.6  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5540  hypothetical protein  24.79 
 
 		 506 aa  46.2  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.621882  normal  0.230055 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1329  hypothetical protein  18.89 
 
 		 494 aa  45.8  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.230961  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3277  hydroxyacylglutathione hydrolase  22.17 
 
 		 443 aa  44.7  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03362  putative secreted protein  28.05 
 
 		 471 aa  44.7  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0229987  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0771  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.48 
 
 		 481 aa  44.7  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13756 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1779  hypothetical protein  26.46 
 
 		 474 aa  44.3  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3118  hypothetical protein  25.12 
 
 		 469 aa  43.9  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0412381  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2487  hypothetical protein  25.09 
 
 		 477 aa  43.5  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00182169 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>