More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3410 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3410  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  100 
 
 
305 aa  604  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254425  normal  0.629744 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3675  esterase/lipase/thioesterase  97.7 
 
 
305 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0185  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  47.28 
 
 
326 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.767036  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1023  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.16 
 
 
313 aa  144  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.205112 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1839  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.66 
 
 
311 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.166294  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2768  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.06 
 
 
308 aa  137  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.718585 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1713  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.03 
 
 
329 aa  135  8e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.386293  normal  0.298888 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2623  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.93 
 
 
325 aa  135  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.04826  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2931  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.36 
 
 
316 aa  135  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.360942  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3653  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.48 
 
 
308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1072  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.21 
 
 
301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1991  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.69 
 
 
320 aa  133  3e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3180  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.89 
 
 
324 aa  132  5e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.407678  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3924  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.19 
 
 
326 aa  130  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.163224  normal  0.0505631 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0443  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.98 
 
 
371 aa  130  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0772  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.28 
 
 
312 aa  129  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000370345 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11428  lipase lipH  35.48 
 
 
319 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.13371e-22  normal  0.199346 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3222  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.33 
 
 
316 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29245  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5462  esterase/lipase/thioesterase  36.99 
 
 
311 aa  129  8.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536989  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3090  esterase/lipase/thioesterase  35.34 
 
 
312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.110672 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2782  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.91 
 
 
320 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3757  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.92 
 
 
311 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.315687 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0305  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.59 
 
 
310 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02616  lipase signal peptide protein  33.55 
 
 
339 aa  125  9e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.83944 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4031  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.78 
 
 
312 aa  125  9e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.834602  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4552  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.08 
 
 
307 aa  124  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0574937 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71110  putative lipolytic enzyme  38.94 
 
 
331 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0952  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.1 
 
 
318 aa  124  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1856  hypothetical protein  33.47 
 
 
321 aa  123  3e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3028  esterase/lipase/thioesterase  33.86 
 
 
314 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0380453  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0587  lipase  31.88 
 
 
337 aa  123  3e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1940  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.5 
 
 
325 aa  123  4e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.270718  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1851  hypothetical protein  33.47 
 
 
321 aa  123  4e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1487  putative lipase/esterase  33.45 
 
 
305 aa  123  4e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0809512  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0542  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.88 
 
 
337 aa  123  4e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5453  putative exported lipase/esterase  35.36 
 
 
319 aa  123  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131781  normal  0.198573 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2828  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.62 
 
 
306 aa  122  5e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0689271 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0403  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.45 
 
 
336 aa  123  5e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2672  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.36 
 
 
309 aa  122  7e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.795558  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2316  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.04 
 
 
321 aa  122  9e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2185  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.56 
 
 
312 aa  121  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.208041 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3606  putative esterase/lipase  32.57 
 
 
317 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0140226  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2512  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.88 
 
 
317 aa  122  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.119667  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3998  esterase/lipase/thioesterase  31.82 
 
 
337 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000526107  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6169  putative lipolytic enzyme  38.05 
 
 
331 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2703  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.22 
 
 
316 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00278676  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2420  Alpha/beta hydrolase fold-3  33.23 
 
 
314 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.40186  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0314  Alpha/beta hydrolase fold-3  37.1 
 
 
310 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0217857  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3446  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.12 
 
 
339 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0324  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.1 
 
 
310 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381561  normal  0.441011 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1186  Alpha/beta hydrolase fold-3  34.8 
 
 
311 aa  119  6e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.102278  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36320  esterase/lipase  35 
 
 
353 aa  119  7e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2006  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.67 
 
 
352 aa  119  7e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.368207  normal  0.502337 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0880  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.76 
 
 
324 aa  119  9e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.691733  hitchhiker  0.0000246401 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3375  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  30.31 
 
 
350 aa  119  9e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.354679  normal  0.126247 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3154  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.6 
 
 
292 aa  118  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0890  putative lipase  31.51 
 
 
310 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.120136  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4942  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.1 
 
 
314 aa  118  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1213  lipolytic protein  38.03 
 
 
309 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583626  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5478  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.34 
 
 
317 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.157645 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2844  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.49 
 
 
337 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.446939  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3416  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.12 
 
 
359 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.733003  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3121  esterase/lipase/thioesterase  32.93 
 
 
321 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1958  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.47 
 
 
339 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0704762  normal  0.359976 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3812  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.47 
 
 
339 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.422077  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1441  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.43 
 
 
317 aa  117  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3113  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.55 
 
 
337 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.723098  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1766  lipase  30.8 
 
 
339 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0387  Alpha/beta hydrolase fold-3  35.43 
 
 
306 aa  116  3.9999999999999997e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0996  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.31 
 
 
321 aa  116  5e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1090  putative lipase/esterase  33.54 
 
 
328 aa  116  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.644515 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2661  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.17 
 
 
325 aa  116  5e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2010  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.03 
 
 
335 aa  116  6e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1345  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  33.76 
 
 
349 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1872  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.35 
 
 
321 aa  115  7.999999999999999e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1386  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.07 
 
 
326 aa  115  8.999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372479  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3098  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.47 
 
 
338 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387961  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2080  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.1 
 
 
339 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3735  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.74 
 
 
310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0759445 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0942  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.14 
 
 
312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.911706  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0370  lipolytic protein  36.28 
 
 
305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4456  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.31 
 
 
318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.477354  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1944  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.34 
 
 
321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0801  hypothetical protein  30.34 
 
 
304 aa  114  3e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4976  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.6 
 
 
318 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.378694  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2377  Alpha/beta hydrolase fold-3  39.91 
 
 
300 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2418  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.91 
 
 
300 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.382013  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2424  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.91 
 
 
300 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.0082744  normal  0.188139 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2542  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.24 
 
 
304 aa  113  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.311533  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2094  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.33 
 
 
339 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.317288  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2875  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.72 
 
 
310 aa  113  4.0000000000000004e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.406722  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2012  putative acetyl hydrolace  35.59 
 
 
325 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.23753  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5215  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.59 
 
 
311 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.85138  normal  0.647883 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2852  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.68 
 
 
324 aa  113  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.255078 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1654  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.67 
 
 
356 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0299965  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3830  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.16 
 
 
311 aa  112  5e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4223  putative lipase/esterase  34.93 
 
 
320 aa  112  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3486  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.45 
 
 
304 aa  112  6e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3867  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.25 
 
 
310 aa  112  6e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.695714  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6777  lipolytic protein  32.21 
 
 
316 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>