50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1160 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1160  hypothetical protein  100 
 
 		 66 aa  129  9e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.595805 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1068  hypothetical protein  93.94 
 
 		 66 aa  124  5e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.676  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1224  hypothetical protein  80.3 
 
 		 66 aa  105  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000343082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1092  hypothetical protein  54.39 
 
 		 63 aa  64.3  0.0000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1987  hypothetical protein  54.17 
 
 		 62 aa  59.3  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.186751  normal  0.0674172 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1585  hypothetical protein  54 
 
 		 61 aa  58.2  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.60479  unclonable  0.000000160377 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0443  hypothetical protein  56.25 
 
 		 61 aa  57.8  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.270929  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3381  hypothetical protein  49.12 
 
 		 61 aa  57  0.00000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2196  hypothetical protein  56.25 
 
 		 62 aa  57  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1881  hypothetical protein  45.76 
 
 		 62 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.418167  normal  0.891396 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2976  hypothetical protein  46.94 
 
 		 61 aa  53.9  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.707976 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0662  hypothetical protein  49.12 
 
 		 63 aa  53.5  0.0000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.743687  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07580  hypothetical protein  58.14 
 
 		 61 aa  51.6  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5669  hypothetical protein  52 
 
 		 61 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.319752  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65260  hypothetical protein  52 
 
 		 61 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2599  hypothetical protein  39.66 
 
 		 62 aa  50.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.483175  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2663  hypothetical protein  47.27 
 
 		 61 aa  48.9  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2009  Protein of unknown function DUF2065  40.74 
 
 		 62 aa  49.3  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0115757  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1099  hypothetical protein  47.06 
 
 		 59 aa  48.5  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0639  hypothetical protein  55.81 
 
 		 61 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00779796 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2298  hypothetical protein  44 
 
 		 62 aa  48.1  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.126182  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1179  hypothetical protein  45.1 
 
 		 59 aa  47.4  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.473482 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1603  hypothetical protein  47.62 
 
 		 63 aa  47.4  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.101159  normal  0.305668 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1741  hypothetical protein  44.23 
 
 		 63 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02634  hypothetical protein  43.1 
 
 		 61 aa  46.6  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1714  hypothetical protein  44.23 
 
 		 63 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.394812  normal  0.203355 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2040  hypothetical protein  39.66 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2532  hypothetical protein  47.62 
 
 		 63 aa  45.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00934487  hitchhiker  0.000016546 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5104  hypothetical protein  43.14 
 
 		 63 aa  45.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.103511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2218  hypothetical protein  43.18 
 
 		 63 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.400436  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00090  hypothetical protein  51.28 
 
 		 62 aa  45.1  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1575  hypothetical protein  42.37 
 
 		 61 aa  44.3  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0901  hypothetical protein  47.83 
 
 		 63 aa  44.7  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.28384  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0216  hypothetical protein  41.38 
 
 		 61 aa  43.9  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00584  hypothetical protein  45.28 
 
 		 60 aa  43.9  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002263  protein YjeT  46.15 
 
 		 61 aa  43.5  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.011306  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3350  hypothetical protein  37.93 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.699781  normal  0.141895 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0359  hypothetical protein  40.43 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.246304  hitchhiker  0.00315014 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1827  hypothetical protein  42.55 
 
 		 63 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.222462 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1720  hypothetical protein  39.66 
 
 		 61 aa  42  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2773  hypothetical protein  31.67 
 
 		 61 aa  41.6  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1785  hypothetical protein  39.66 
 
 		 91 aa  41.6  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6276  hypothetical protein  42.55 
 
 		 63 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.579358  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0508  hypothetical protein  38.18 
 
 		 90 aa  41.6  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000452311  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0496  hypothetical protein  38.89 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1803  hypothetical protein  42.55 
 
 		 63 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206591  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2460  hypothetical protein  36.84 
 
 		 61 aa  41.2  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.122059 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2762  hypothetical protein  33.33 
 
 		 68 aa  40.8  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00943153  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4003  hypothetical protein  36.21 
 
 		 66 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.381158  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6095  hypothetical protein  34.48 
 
 		 68 aa  40  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>