20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0639 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0639  hypothetical protein  100 
 
 		 61 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00779796 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65260  hypothetical protein  73.77 
 
 		 61 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5669  hypothetical protein  73.77 
 
 		 61 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.319752  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07580  hypothetical protein  81.97 
 
 		 61 aa  77.8  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2663  hypothetical protein  52.46 
 
 		 61 aa  68.9  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1068  hypothetical protein  55.56 
 
 		 66 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1092  hypothetical protein  42.59 
 
 		 63 aa  54.3  0.0000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1987  hypothetical protein  54 
 
 		 62 aa  53.9  0.0000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.186751  normal  0.0674172 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1224  hypothetical protein  51.85 
 
 		 66 aa  52.4  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000343082  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1160  hypothetical protein  54.35 
 
 		 66 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.595805 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3381  hypothetical protein  41.67 
 
 		 61 aa  50.4  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2009  Protein of unknown function DUF2065  43.4 
 
 		 62 aa  47  0.00009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0115757  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0443  hypothetical protein  48 
 
 		 61 aa  47  0.00009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.270929  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0496  hypothetical protein  43.64 
 
 		 66 aa  46.2  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00584  hypothetical protein  41.18 
 
 		 60 aa  45.1  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0662  hypothetical protein  49.02 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.743687  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1585  hypothetical protein  46 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.60479  unclonable  0.000000160377 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2298  hypothetical protein  46.81 
 
 		 62 aa  42.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.126182  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2762  hypothetical protein  38.33 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00943153  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2196  hypothetical protein  51.16 
 
 		 62 aa  40.4  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>