42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2298 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2298  hypothetical protein  100 
 
 		 62 aa  122  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.126182  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2599  hypothetical protein  61.02 
 
 		 62 aa  79.7  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.483175  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1881  hypothetical protein  62.96 
 
 		 62 aa  75.9  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.418167  normal  0.891396 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2196  hypothetical protein  66.67 
 
 		 62 aa  74.3  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1099  hypothetical protein  61.54 
 
 		 59 aa  65.1  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1179  hypothetical protein  61.54 
 
 		 59 aa  65.1  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.473482 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3381  hypothetical protein  46.43 
 
 		 61 aa  60.5  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1987  hypothetical protein  60.42 
 
 		 62 aa  60.8  0.000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.186751  normal  0.0674172 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2976  hypothetical protein  52.08 
 
 		 61 aa  58.9  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.707976 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00090  hypothetical protein  40.35 
 
 		 62 aa  56.2  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002263  protein YjeT  40 
 
 		 61 aa  55.8  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.011306  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2762  hypothetical protein  47.27 
 
 		 68 aa  55.5  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00943153  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1585  hypothetical protein  46.94 
 
 		 61 aa  54.7  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.60479  unclonable  0.000000160377 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2859  hypothetical protein  63.64 
 
 		 62 aa  52.4  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07580  hypothetical protein  52.27 
 
 		 61 aa  52.8  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0443  hypothetical protein  45.83 
 
 		 61 aa  50.1  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.270929  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65260  hypothetical protein  41.38 
 
 		 61 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1092  hypothetical protein  40 
 
 		 63 aa  49.7  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1224  hypothetical protein  40 
 
 		 66 aa  49.7  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000343082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5669  hypothetical protein  41.38 
 
 		 61 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.319752  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2773  hypothetical protein  36.67 
 
 		 61 aa  48.9  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0662  hypothetical protein  37.7 
 
 		 63 aa  48.5  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.743687  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1160  hypothetical protein  47.83 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.595805 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0496  hypothetical protein  47.17 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1720  hypothetical protein  48.15 
 
 		 61 aa  47.8  0.00006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1785  hypothetical protein  47.27 
 
 		 91 aa  47  0.00009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0901  hypothetical protein  48.89 
 
 		 63 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.28384  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1068  hypothetical protein  42 
 
 		 66 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2009  Protein of unknown function DUF2065  44.07 
 
 		 62 aa  46.2  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0115757  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0539  hypothetical protein  52.27 
 
 		 66 aa  46.2  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.174202  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00584  hypothetical protein  46.15 
 
 		 60 aa  45.1  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2663  hypothetical protein  44 
 
 		 61 aa  44.7  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1741  hypothetical protein  41.51 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1714  hypothetical protein  41.51 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.394812  normal  0.203355 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0639  hypothetical protein  47.73 
 
 		 61 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00779796 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5104  hypothetical protein  42.31 
 
 		 63 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.103511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0216  hypothetical protein  37.29 
 
 		 61 aa  42.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0508  hypothetical protein  36.21 
 
 		 90 aa  41.6  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000452311  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1827  hypothetical protein  43.75 
 
 		 63 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.222462 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6276  hypothetical protein  43.75 
 
 		 63 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.579358  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1803  hypothetical protein  43.75 
 
 		 63 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206591  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3938  hypothetical protein  35.59 
 
 		 62 aa  40.4  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>