26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1099 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1099  hypothetical protein  100 
 
 
59 aa  115  3e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1179  hypothetical protein  98.31 
 
 
59 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.473482 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2196  hypothetical protein  74.42 
 
 
62 aa  65.1  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2298  hypothetical protein  61.54 
 
 
62 aa  65.1  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.126182  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2599  hypothetical protein  56.86 
 
 
62 aa  57.4  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.483175  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1881  hypothetical protein  58.33 
 
 
62 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.418167  normal  0.891396 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3381  hypothetical protein  43.1 
 
 
61 aa  55.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1585  hypothetical protein  45.83 
 
 
61 aa  54.3  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.60479  unclonable  0.000000160377 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2976  hypothetical protein  53.66 
 
 
61 aa  52.8  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.707976 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1987  hypothetical protein  53.33 
 
 
62 aa  50.4  0.000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.186751  normal  0.0674172 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1092  hypothetical protein  40.38 
 
 
63 aa  48.5  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1160  hypothetical protein  47.06 
 
 
66 aa  48.9  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.595805 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1224  hypothetical protein  45.65 
 
 
66 aa  48.5  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000343082  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2009  Protein of unknown function DUF2065  38.33 
 
 
62 aa  47.4  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0115757  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0443  hypothetical protein  50 
 
 
61 aa  47.4  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.270929  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1068  hypothetical protein  45.1 
 
 
66 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.676  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2859  hypothetical protein  61.29 
 
 
62 aa  45.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00090  hypothetical protein  35.09 
 
 
62 aa  45.4  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002263  protein YjeT  33.33 
 
 
61 aa  44.3  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.011306  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2773  hypothetical protein  41.46 
 
 
61 aa  43.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07580  hypothetical protein  47.73 
 
 
61 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2762  hypothetical protein  42.31 
 
 
68 aa  42.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00943153  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0662  hypothetical protein  40.82 
 
 
63 aa  42  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.743687  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2663  hypothetical protein  37.5 
 
 
61 aa  42  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02634  hypothetical protein  47.62 
 
 
61 aa  40.8  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0605  hypothetical protein  41.46 
 
 
62 aa  40.4  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.223312 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>