49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1092 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_1092  hypothetical protein  100 
 
 
63 aa  120  5e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1224  hypothetical protein  56.6 
 
 
66 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000343082  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1068  hypothetical protein  54.39 
 
 
66 aa  63.5  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.676  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1160  hypothetical protein  52.83 
 
 
66 aa  60.5  0.000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.595805 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3381  hypothetical protein  45.61 
 
 
61 aa  58.2  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0662  hypothetical protein  48.15 
 
 
63 aa  57.8  0.00000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.743687  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2196  hypothetical protein  52.94 
 
 
62 aa  56.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2663  hypothetical protein  38.6 
 
 
61 aa  55.1  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0746  hypothetical protein  46.3 
 
 
66 aa  53.5  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000197115  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00584  hypothetical protein  42.37 
 
 
60 aa  53.5  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0680  hypothetical protein  40.32 
 
 
62 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000282056  hitchhiker  0.000229174 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3267  hypothetical protein  40.32 
 
 
62 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000144009  hitchhiker  0.0000321766 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0694  hypothetical protein  42.59 
 
 
62 aa  51.6  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000619978  hitchhiker  0.0000301023 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3938  hypothetical protein  38.71 
 
 
62 aa  51.6  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0443  hypothetical protein  47.92 
 
 
61 aa  51.2  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.270929  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07580  hypothetical protein  51.16 
 
 
61 aa  50.8  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2976  hypothetical protein  49.15 
 
 
61 aa  50.4  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.707976 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0508  hypothetical protein  42.59 
 
 
90 aa  50.1  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000452311  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2298  hypothetical protein  40 
 
 
62 aa  49.7  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.126182  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1585  hypothetical protein  46 
 
 
61 aa  48.9  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.60479  unclonable  0.000000160377 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65260  hypothetical protein  43.14 
 
 
61 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1099  hypothetical protein  40.38 
 
 
59 aa  48.5  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3358  hypothetical protein  40.35 
 
 
62 aa  48.5  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000675107  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1881  hypothetical protein  41.51 
 
 
62 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.418167  normal  0.891396 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5669  hypothetical protein  43.14 
 
 
61 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.319752  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0639  hypothetical protein  46.51 
 
 
61 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00779796 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1987  hypothetical protein  43.75 
 
 
62 aa  47.8  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.186751  normal  0.0674172 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1179  hypothetical protein  40.38 
 
 
59 aa  47.4  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.473482 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0216  hypothetical protein  37.93 
 
 
61 aa  47  0.00008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1603  hypothetical protein  45.45 
 
 
63 aa  47  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.101159  normal  0.305668 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2599  hypothetical protein  35.59 
 
 
62 aa  46.6  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.483175  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3593  hypothetical protein  33.87 
 
 
62 aa  45.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000773085  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4220  hypothetical protein  32.26 
 
 
62 aa  45.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000695961  hitchhiker  0.000271078 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2532  hypothetical protein  43.18 
 
 
63 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00934487  hitchhiker  0.000016546 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2218  hypothetical protein  38.64 
 
 
63 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.400436  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00090  hypothetical protein  32.26 
 
 
62 aa  43.9  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3292  hypothetical protein  32.26 
 
 
62 aa  43.9  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000341896  hitchhiker  0.00104761 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5104  hypothetical protein  42 
 
 
63 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.103511  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0749  hypothetical protein  35.19 
 
 
56 aa  43.5  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000984241  normal  0.0216774 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1714  hypothetical protein  42 
 
 
63 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.394812  normal  0.203355 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1741  hypothetical protein  42 
 
 
63 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1827  hypothetical protein  39.58 
 
 
63 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.222462 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2460  hypothetical protein  34.55 
 
 
61 aa  41.6  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.122059 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1803  hypothetical protein  39.58 
 
 
63 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206591  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6276  hypothetical protein  39.58 
 
 
63 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.579358  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002263  protein YjeT  28.81 
 
 
61 aa  40.8  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.011306  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2628  hypothetical protein  41.67 
 
 
65 aa  40.4  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.92924  unclonable  0.00000000000355687 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2762  hypothetical protein  30.51 
 
 
68 aa  40.8  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00943153  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1662  hypothetical protein  30.91 
 
 
62 aa  40.4  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.754821  normal  0.135565 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>