41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2976 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2976  hypothetical protein  100 
 
 		 61 aa  117  7e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.707976 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3381  hypothetical protein  70.18 
 
 		 61 aa  84.3  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0443  hypothetical protein  68 
 
 		 61 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.270929  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1585  hypothetical protein  60 
 
 		 61 aa  73.9  0.0000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.60479  unclonable  0.000000160377 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1224  hypothetical protein  49.18 
 
 		 66 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000343082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1068  hypothetical protein  50.82 
 
 		 66 aa  63.9  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1881  hypothetical protein  50 
 
 		 62 aa  63.5  0.0000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.418167  normal  0.891396 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1092  hypothetical protein  49.15 
 
 		 63 aa  60.8  0.000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2599  hypothetical protein  51.79 
 
 		 62 aa  60.5  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.483175  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2298  hypothetical protein  46.43 
 
 		 62 aa  60.1  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.126182  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1160  hypothetical protein  49.06 
 
 		 66 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.595805 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1987  hypothetical protein  54 
 
 		 62 aa  60.1  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.186751  normal  0.0674172 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1099  hypothetical protein  47.17 
 
 		 59 aa  56.2  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2196  hypothetical protein  50.98 
 
 		 62 aa  56.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5669  hypothetical protein  50.98 
 
 		 61 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.319752  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1179  hypothetical protein  45.28 
 
 		 59 aa  55.1  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.473482 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65260  hypothetical protein  50.98 
 
 		 61 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0605  hypothetical protein  62.5 
 
 		 62 aa  54.7  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.223312 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1741  hypothetical protein  48 
 
 		 63 aa  52.8  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5104  hypothetical protein  47.06 
 
 		 63 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.103511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1714  hypothetical protein  48 
 
 		 63 aa  52.8  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.394812  normal  0.203355 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1827  hypothetical protein  47.83 
 
 		 63 aa  51.2  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.222462 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07580  hypothetical protein  46 
 
 		 61 aa  50.8  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1803  hypothetical protein  47.83 
 
 		 63 aa  50.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206591  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6276  hypothetical protein  47.83 
 
 		 63 aa  50.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.579358  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1603  hypothetical protein  47.83 
 
 		 63 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.101159  normal  0.305668 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2859  hypothetical protein  57.58 
 
 		 62 aa  49.3  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2218  hypothetical protein  41.67 
 
 		 63 aa  47.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.400436  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2532  hypothetical protein  45.65 
 
 		 63 aa  47.4  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00934487  hitchhiker  0.000016546 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002263  protein YjeT  34.43 
 
 		 61 aa  47  0.00009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.011306  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00090  hypothetical protein  32.79 
 
 		 62 aa  46.6  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0662  hypothetical protein  43.64 
 
 		 63 aa  44.7  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.743687  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2762  hypothetical protein  34.43 
 
 		 68 aa  43.9  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00943153  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1097  hypothetical protein  46.15 
 
 		 50 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.807731  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1825  hypothetical protein  46.15 
 
 		 50 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0216  hypothetical protein  38.18 
 
 		 61 aa  43.5  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2663  hypothetical protein  37.7 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00584  hypothetical protein  38.6 
 
 		 60 aa  42.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2009  Protein of unknown function DUF2065  30.51 
 
 		 62 aa  42.4  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0115757  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2773  hypothetical protein  33.93 
 
 		 61 aa  41.6  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0508  hypothetical protein  35.09 
 
 		 90 aa  40  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000452311  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>