28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_A1825 on replicon NC_008785
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA1336  hypothetical protein  100 
 
 
63 aa  100  6e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0651834  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2180  hypothetical protein  100 
 
 
63 aa  100  6e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0071  hypothetical protein  100 
 
 
63 aa  100  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.947924  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2243  hypothetical protein  98 
 
 
63 aa  99.4  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.74575  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1097  hypothetical protein  100 
 
 
50 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.807731  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1825  hypothetical protein  100 
 
 
50 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2218  hypothetical protein  95.83 
 
 
63 aa  94  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.400436  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1603  hypothetical protein  82.61 
 
 
63 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.101159  normal  0.305668 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1714  hypothetical protein  95 
 
 
63 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.394812  normal  0.203355 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1741  hypothetical protein  95 
 
 
63 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2532  hypothetical protein  78.26 
 
 
63 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00934487  hitchhiker  0.000016546 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5104  hypothetical protein  94.87 
 
 
63 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.103511  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1827  hypothetical protein  100 
 
 
63 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.222462 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1803  hypothetical protein  97.14 
 
 
63 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206591  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6276  hypothetical protein  97.14 
 
 
63 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.579358  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1411  hypothetical protein  90.32 
 
 
63 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.447003  hitchhiker  0.0000125565 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3381  hypothetical protein  46.94 
 
 
61 aa  48.1  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1068  hypothetical protein  42.86 
 
 
66 aa  47  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.676  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1224  hypothetical protein  42.55 
 
 
66 aa  45.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000343082  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00090  hypothetical protein  37.5 
 
 
62 aa  43.9  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0443  hypothetical protein  43.59 
 
 
61 aa  43.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.270929  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1160  hypothetical protein  40.48 
 
 
66 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.595805 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1092  hypothetical protein  36.36 
 
 
63 aa  42  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2976  hypothetical protein  48.57 
 
 
61 aa  42  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.707976 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002263  protein YjeT  32.65 
 
 
61 aa  40.8  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.011306  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2663  hypothetical protein  36.73 
 
 
61 aa  40.4  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2460  hypothetical protein  41.3 
 
 
61 aa  40  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.122059 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00584  hypothetical protein  41.3 
 
 
60 aa  40  0.01  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>