48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0443 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0443  hypothetical protein  100 
 
 
61 aa  119  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.270929  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3381  hypothetical protein  61.67 
 
 
61 aa  77.8  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2976  hypothetical protein  67.35 
 
 
61 aa  73.2  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.707976 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1987  hypothetical protein  62 
 
 
62 aa  65.9  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.186751  normal  0.0674172 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1068  hypothetical protein  52.54 
 
 
66 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.676  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5669  hypothetical protein  50.82 
 
 
61 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.319752  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1224  hypothetical protein  56.14 
 
 
66 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000343082  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65260  hypothetical protein  50.82 
 
 
61 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1585  hypothetical protein  52 
 
 
61 aa  61.6  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.60479  unclonable  0.000000160377 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1160  hypothetical protein  54.9 
 
 
66 aa  60.5  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.595805 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2599  hypothetical protein  52.73 
 
 
62 aa  58.2  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.483175  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1092  hypothetical protein  45.61 
 
 
63 aa  58.5  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2663  hypothetical protein  44.26 
 
 
61 aa  57.4  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07580  hypothetical protein  50 
 
 
61 aa  54.3  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1603  hypothetical protein  51.11 
 
 
63 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.101159  normal  0.305668 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1881  hypothetical protein  44.83 
 
 
62 aa  53.5  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.418167  normal  0.891396 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0662  hypothetical protein  50.88 
 
 
63 aa  53.5  0.0000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.743687  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2196  hypothetical protein  53.49 
 
 
62 aa  52.4  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2298  hypothetical protein  43.64 
 
 
62 aa  52.4  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.126182  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2532  hypothetical protein  48.89 
 
 
63 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00934487  hitchhiker  0.000016546 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5104  hypothetical protein  47.92 
 
 
63 aa  51.6  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.103511  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1714  hypothetical protein  48.94 
 
 
63 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.394812  normal  0.203355 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1741  hypothetical protein  48.94 
 
 
63 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1827  hypothetical protein  48.84 
 
 
63 aa  50.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.222462 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1099  hypothetical protein  48.94 
 
 
59 aa  49.7  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1803  hypothetical protein  48.84 
 
 
63 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206591  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6276  hypothetical protein  48.84 
 
 
63 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.579358  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1179  hypothetical protein  44.44 
 
 
59 aa  48.5  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.473482 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0216  hypothetical protein  41.38 
 
 
61 aa  48.5  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00584  hypothetical protein  41.07 
 
 
60 aa  47.8  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2218  hypothetical protein  42.55 
 
 
63 aa  47  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.400436  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0639  hypothetical protein  48 
 
 
61 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00779796 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2762  hypothetical protein  37.29 
 
 
68 aa  43.9  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00943153  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1575  hypothetical protein  40.68 
 
 
61 aa  43.9  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162376  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1097  hypothetical protein  43.59 
 
 
50 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.807731  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1825  hypothetical protein  43.59 
 
 
50 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2009  Protein of unknown function DUF2065  35.19 
 
 
62 aa  43.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0115757  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002263  protein YjeT  32.14 
 
 
61 aa  43.5  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.011306  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00090  hypothetical protein  32.14 
 
 
62 aa  43.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2859  hypothetical protein  56.52 
 
 
62 aa  42.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0605  hypothetical protein  53.33 
 
 
62 aa  42.4  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.223312 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1411  hypothetical protein  51.61 
 
 
63 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.447003  hitchhiker  0.0000125565 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1662  hypothetical protein  36.84 
 
 
62 aa  41.2  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.754821  normal  0.135565 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0508  hypothetical protein  34.48 
 
 
90 aa  41.2  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000452311  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2243  hypothetical protein  40.54 
 
 
63 aa  40.8  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.74575  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2180  hypothetical protein  40.54 
 
 
63 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0071  hypothetical protein  40.54 
 
 
63 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.947924  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1336  hypothetical protein  40.54 
 
 
63 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0651834  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>