28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_07580 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_07580  hypothetical protein  100 
 
 		 61 aa  116  7.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65260  hypothetical protein  73.77 
 
 		 61 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5669  hypothetical protein  73.77 
 
 		 61 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.319752  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0639  hypothetical protein  78 
 
 		 61 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00779796 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2663  hypothetical protein  52.46 
 
 		 61 aa  71.6  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1224  hypothetical protein  55.56 
 
 		 66 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000343082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1987  hypothetical protein  58 
 
 		 62 aa  61.2  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.186751  normal  0.0674172 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1068  hypothetical protein  57.41 
 
 		 66 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1092  hypothetical protein  46.3 
 
 		 63 aa  57  0.00000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1160  hypothetical protein  56.52 
 
 		 66 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.595805 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3381  hypothetical protein  40.68 
 
 		 61 aa  55.5  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0443  hypothetical protein  50 
 
 		 61 aa  54.7  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.270929  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2298  hypothetical protein  50 
 
 		 62 aa  53.5  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.126182  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1585  hypothetical protein  52 
 
 		 61 aa  52  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.60479  unclonable  0.000000160377 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2196  hypothetical protein  58.14 
 
 		 62 aa  51.2  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2976  hypothetical protein  44.9 
 
 		 61 aa  48.9  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.707976 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0662  hypothetical protein  47.27 
 
 		 63 aa  49.3  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.743687  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1179  hypothetical protein  47.17 
 
 		 59 aa  48.1  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.473482 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1099  hypothetical protein  47.17 
 
 		 59 aa  48.1  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0901  hypothetical protein  52.46 
 
 		 63 aa  47  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.28384  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1881  hypothetical protein  41.67 
 
 		 62 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.418167  normal  0.891396 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2009  Protein of unknown function DUF2065  39.62 
 
 		 62 aa  45.8  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0115757  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2859  hypothetical protein  51.52 
 
 		 62 aa  44.3  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00584  hypothetical protein  41.18 
 
 		 60 aa  43.5  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0496  hypothetical protein  40 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2762  hypothetical protein  38.33 
 
 		 68 aa  41.6  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00943153  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2599  hypothetical protein  38.98 
 
 		 62 aa  41.6  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.483175  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0216  hypothetical protein  40 
 
 		 61 aa  40.8  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>