37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0901 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0901  hypothetical protein  100 
 
 		 63 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.28384  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0662  hypothetical protein  53.97 
 
 		 63 aa  66.2  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.743687  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2298  hypothetical protein  52.83 
 
 		 62 aa  55.5  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.126182  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1068  hypothetical protein  50.82 
 
 		 66 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.676  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1160  hypothetical protein  52.83 
 
 		 66 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.595805 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07580  hypothetical protein  54 
 
 		 61 aa  52  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1224  hypothetical protein  49.12 
 
 		 66 aa  50.4  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000343082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65260  hypothetical protein  44.26 
 
 		 61 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1987  hypothetical protein  50 
 
 		 62 aa  50.4  0.000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.186751  normal  0.0674172 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1092  hypothetical protein  42.37 
 
 		 63 aa  50.1  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5669  hypothetical protein  44.26 
 
 		 61 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.319752  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1575  hypothetical protein  40 
 
 		 61 aa  48.1  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6095  hypothetical protein  41.67 
 
 		 68 aa  47.8  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2009  Protein of unknown function DUF2065  40.38 
 
 		 62 aa  47.8  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0115757  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4003  hypothetical protein  44.83 
 
 		 66 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.381158  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0443  hypothetical protein  48 
 
 		 61 aa  47.4  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.270929  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2196  hypothetical protein  50 
 
 		 62 aa  47.4  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3350  hypothetical protein  41.67 
 
 		 66 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.699781  normal  0.141895 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2040  hypothetical protein  41.67 
 
 		 66 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1747  hypothetical protein  41.67 
 
 		 61 aa  46.2  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1785  hypothetical protein  50 
 
 		 91 aa  46.6  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1881  hypothetical protein  46 
 
 		 62 aa  46.2  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.418167  normal  0.891396 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1720  hypothetical protein  50 
 
 		 61 aa  45.8  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0639  hypothetical protein  50 
 
 		 61 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00779796 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2663  hypothetical protein  36.07 
 
 		 61 aa  44.7  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02634  hypothetical protein  40.68 
 
 		 61 aa  44.7  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3381  hypothetical protein  39.29 
 
 		 61 aa  44.3  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2460  hypothetical protein  40.68 
 
 		 61 aa  44.3  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.122059 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2976  hypothetical protein  42.55 
 
 		 61 aa  42.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.707976 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3260  hypothetical protein  36.67 
 
 		 66 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0517932  normal  0.319323 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00584  hypothetical protein  41.07 
 
 		 60 aa  41.6  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0496  hypothetical protein  42.59 
 
 		 66 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3014  hypothetical protein  43.33 
 
 		 61 aa  41.2  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.348047  normal  0.110035 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2599  hypothetical protein  44 
 
 		 62 aa  41.2  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.483175  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1179  hypothetical protein  36.36 
 
 		 59 aa  40.8  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.473482 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1796  hypothetical protein  36.67 
 
 		 61 aa  40  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1351  hypothetical protein  38.71 
 
 		 77 aa  40  0.01  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.731742  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>