27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1881 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1881  hypothetical protein  100 
 
 		 62 aa  120  8e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.418167  normal  0.891396 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2599  hypothetical protein  80.65 
 
 		 62 aa  97.8  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.483175  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2298  hypothetical protein  62.96 
 
 		 62 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.126182  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2196  hypothetical protein  62.75 
 
 		 62 aa  70.1  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1987  hypothetical protein  62.5 
 
 		 62 aa  62.8  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.186751  normal  0.0674172 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1179  hypothetical protein  60.42 
 
 		 59 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.473482 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1224  hypothetical protein  46.43 
 
 		 66 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000343082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3381  hypothetical protein  46.43 
 
 		 61 aa  57  0.00000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2976  hypothetical protein  52.08 
 
 		 61 aa  57  0.00000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.707976 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1068  hypothetical protein  45.76 
 
 		 66 aa  57  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1099  hypothetical protein  58.33 
 
 		 59 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1585  hypothetical protein  44.9 
 
 		 61 aa  53.9  0.0000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.60479  unclonable  0.000000160377 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002263  protein YjeT  38.33 
 
 		 61 aa  52.4  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.011306  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1160  hypothetical protein  44.23 
 
 		 66 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.595805 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2773  hypothetical protein  38.98 
 
 		 61 aa  50.4  0.000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2762  hypothetical protein  41.67 
 
 		 68 aa  49.7  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00943153  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00090  hypothetical protein  33.87 
 
 		 62 aa  49.3  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2859  hypothetical protein  60.61 
 
 		 62 aa  48.9  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0662  hypothetical protein  44.83 
 
 		 63 aa  48.9  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.743687  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0443  hypothetical protein  48.94 
 
 		 61 aa  48.9  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.270929  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1092  hypothetical protein  41.51 
 
 		 63 aa  48.5  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07580  hypothetical protein  44 
 
 		 61 aa  43.9  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02634  hypothetical protein  41.67 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2663  hypothetical protein  38.3 
 
 		 61 aa  41.2  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2009  Protein of unknown function DUF2065  35.29 
 
 		 62 aa  40.8  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0115757  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1714  hypothetical protein  41.51 
 
 		 63 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.394812  normal  0.203355 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1741  hypothetical protein  41.51 
 
 		 63 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>