54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2773 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2773  hypothetical protein  100 
 
 		 61 aa  120  9e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002263  protein YjeT  81.67 
 
 		 61 aa  98.6  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.011306  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00090  hypothetical protein  78.33 
 
 		 62 aa  96.7  9e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2762  hypothetical protein  70 
 
 		 68 aa  86.3  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00943153  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0496  hypothetical protein  51.67 
 
 		 66 aa  65.5  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3358  hypothetical protein  55.1 
 
 		 62 aa  61.6  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000675107  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00584  hypothetical protein  56.52 
 
 		 60 aa  60.5  0.000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0508  hypothetical protein  52 
 
 		 90 aa  59.7  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000452311  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0694  hypothetical protein  54.9 
 
 		 62 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000619978  hitchhiker  0.0000301023 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0359  hypothetical protein  55.56 
 
 		 65 aa  58.5  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.246304  hitchhiker  0.00315014 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0746  hypothetical protein  52.94 
 
 		 66 aa  58.2  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000197115  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3938  hypothetical protein  52.94 
 
 		 62 aa  57.8  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0216  hypothetical protein  47.27 
 
 		 61 aa  57  0.00000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0680  hypothetical protein  52 
 
 		 62 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000282056  hitchhiker  0.000229174 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3267  hypothetical protein  52 
 
 		 62 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000144009  hitchhiker  0.0000321766 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0539  hypothetical protein  51.11 
 
 		 66 aa  54.3  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.174202  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4220  hypothetical protein  41.51 
 
 		 62 aa  51.6  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000695961  hitchhiker  0.000271078 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3593  hypothetical protein  43.4 
 
 		 62 aa  51.6  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000773085  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3292  hypothetical protein  46 
 
 		 62 aa  51.6  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000341896  hitchhiker  0.00104761 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0435  hypothetical protein  48.33 
 
 		 67 aa  51.2  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.409321  unclonable  0.0000000247595 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0749  hypothetical protein  46 
 
 		 56 aa  50.8  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000984241  normal  0.0216774 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1881  hypothetical protein  38.98 
 
 		 62 aa  50.4  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.418167  normal  0.891396 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2599  hypothetical protein  37.93 
 
 		 62 aa  48.9  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.483175  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2298  hypothetical protein  36.67 
 
 		 62 aa  48.9  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.126182  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3717  hypothetical protein  50 
 
 		 66 aa  48.1  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0761314  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0704  hypothetical protein  46.34 
 
 		 69 aa  47  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000186245  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0734  hypothetical protein  46.34 
 
 		 64 aa  47.4  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00001969  hitchhiker  0.0032638 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3650  hypothetical protein  46.34 
 
 		 62 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000159809  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3915  Protein of unknown function DUF2065  48.33 
 
 		 66 aa  46.2  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0695  hypothetical protein  48.84 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3794  hypothetical protein  48.84 
 
 		 84 aa  45.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1179  hypothetical protein  43.9 
 
 		 59 aa  45.4  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.473482 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3649  hypothetical protein  48.84 
 
 		 102 aa  45.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1585  hypothetical protein  39.13 
 
 		 61 aa  44.3  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.60479  unclonable  0.000000160377 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0725  hypothetical protein  43.9 
 
 		 62 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00541071  hitchhiker  0.0000273453 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4726  hypothetical protein  46.67 
 
 		 65 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4783  hypothetical protein  46.67 
 
 		 65 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.107526  normal  0.312124 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4643  hypothetical protein  46.67 
 
 		 65 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4762  hypothetical protein  46.67 
 
 		 65 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04005  hypothetical protein  42.22 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0232137  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1099  hypothetical protein  41.46 
 
 		 59 aa  43.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5692  hypothetical protein  42.22 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.271125  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3817  conserved hypothetical protein  42.22 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4707  hypothetical protein  42.22 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4647  hypothetical protein  42.22 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.179741 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3837  hypothetical protein  42.22 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000140578 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04043  conserved inner membrane protein  42.22 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0161313  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4735  hypothetical protein  42.22 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4418  hypothetical protein  42.22 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2009  Protein of unknown function DUF2065  39.62 
 
 		 62 aa  42.4  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0115757  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3381  hypothetical protein  34.43 
 
 		 61 aa  41.6  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1068  hypothetical protein  30 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1741  hypothetical protein  32.69 
 
 		 63 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1714  hypothetical protein  32.69 
 
 		 63 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.394812  normal  0.203355 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>