40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0216 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0216  hypothetical protein  100 
 
 		 61 aa  120  5e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00584  hypothetical protein  68.97 
 
 		 60 aa  82.8  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002263  protein YjeT  56.36 
 
 		 61 aa  68.2  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.011306  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0508  hypothetical protein  60.78 
 
 		 90 aa  67  0.00000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000452311  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00090  hypothetical protein  54.55 
 
 		 62 aa  66.2  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3938  hypothetical protein  57.14 
 
 		 62 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0746  hypothetical protein  59.62 
 
 		 66 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000197115  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0694  hypothetical protein  57.14 
 
 		 62 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000619978  hitchhiker  0.0000301023 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3267  hypothetical protein  57.14 
 
 		 62 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000144009  hitchhiker  0.0000321766 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0680  hypothetical protein  57.14 
 
 		 62 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000282056  hitchhiker  0.000229174 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3358  hypothetical protein  58.49 
 
 		 62 aa  62.8  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000675107  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3292  hypothetical protein  54.72 
 
 		 62 aa  60.8  0.000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000341896  hitchhiker  0.00104761 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2762  hypothetical protein  52.73 
 
 		 68 aa  60.5  0.000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00943153  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3593  hypothetical protein  50.98 
 
 		 62 aa  58.2  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000773085  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0749  hypothetical protein  54 
 
 		 56 aa  57.4  0.00000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000984241  normal  0.0216774 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4220  hypothetical protein  48.15 
 
 		 62 aa  57  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000695961  hitchhiker  0.000271078 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2773  hypothetical protein  47.27 
 
 		 61 aa  57  0.00000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0496  hypothetical protein  43.86 
 
 		 66 aa  50.8  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0734  hypothetical protein  52.38 
 
 		 64 aa  50.4  0.000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00001969  hitchhiker  0.0032638 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0704  hypothetical protein  52.38 
 
 		 69 aa  50.4  0.000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000186245  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3650  hypothetical protein  52.38 
 
 		 62 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000159809  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1585  hypothetical protein  50 
 
 		 61 aa  48.5  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.60479  unclonable  0.000000160377 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0443  hypothetical protein  47.83 
 
 		 61 aa  48.1  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.270929  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1092  hypothetical protein  37.93 
 
 		 63 aa  47  0.00008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0725  hypothetical protein  50 
 
 		 62 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00541071  hitchhiker  0.0000273453 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5104  hypothetical protein  40.82 
 
 		 63 aa  45.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.103511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1741  hypothetical protein  42.55 
 
 		 63 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1827  hypothetical protein  43.18 
 
 		 63 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.222462 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1714  hypothetical protein  42.55 
 
 		 63 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.394812  normal  0.203355 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1068  hypothetical protein  43.1 
 
 		 66 aa  45.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0359  hypothetical protein  50 
 
 		 65 aa  43.9  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.246304  hitchhiker  0.00315014 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1160  hypothetical protein  43.14 
 
 		 66 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.595805 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1803  hypothetical protein  43.18 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206591  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6276  hypothetical protein  43.18 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.579358  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2976  hypothetical protein  41.3 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.707976 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0539  hypothetical protein  45.45 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.174202  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2663  hypothetical protein  39.34 
 
 		 61 aa  42.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2298  hypothetical protein  37.29 
 
 		 62 aa  42.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.126182  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02634  hypothetical protein  28.07 
 
 		 61 aa  41.2  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1224  hypothetical protein  39.29 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000343082  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>