30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2663 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2663  hypothetical protein  100 
 
 		 61 aa  123  8.000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5669  hypothetical protein  49.18 
 
 		 61 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.319752  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65260  hypothetical protein  49.18 
 
 		 61 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07580  hypothetical protein  52 
 
 		 61 aa  60.5  0.000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0639  hypothetical protein  52 
 
 		 61 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00779796 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1092  hypothetical protein  38.6 
 
 		 63 aa  55.1  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1987  hypothetical protein  44 
 
 		 62 aa  50.8  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.186751  normal  0.0674172 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3381  hypothetical protein  35 
 
 		 61 aa  48.5  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1068  hypothetical protein  47.27 
 
 		 66 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.676  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1224  hypothetical protein  45.45 
 
 		 66 aa  47.4  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000343082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0662  hypothetical protein  41.38 
 
 		 63 aa  47  0.00009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.743687  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1160  hypothetical protein  48.94 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.595805 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0443  hypothetical protein  40 
 
 		 61 aa  45.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.270929  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00584  hypothetical protein  39.29 
 
 		 60 aa  45.4  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2298  hypothetical protein  44 
 
 		 62 aa  44.7  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.126182  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002263  protein YjeT  42.59 
 
 		 61 aa  44.7  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.011306  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2009  Protein of unknown function DUF2065  38.78 
 
 		 62 aa  43.5  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0115757  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00090  hypothetical protein  40.74 
 
 		 62 aa  42.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0216  hypothetical protein  39.34 
 
 		 61 aa  42.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2196  hypothetical protein  48.78 
 
 		 62 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1179  hypothetical protein  37.5 
 
 		 59 aa  42  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.473482 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0746  hypothetical protein  34 
 
 		 66 aa  42  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000197115  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1099  hypothetical protein  37.5 
 
 		 59 aa  42  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1881  hypothetical protein  38.3 
 
 		 62 aa  41.2  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.418167  normal  0.891396 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3938  hypothetical protein  38.46 
 
 		 62 aa  41.2  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3358  hypothetical protein  39.62 
 
 		 62 aa  40.8  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000675107  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0680  hypothetical protein  38.46 
 
 		 62 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000282056  hitchhiker  0.000229174 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3267  hypothetical protein  38.46 
 
 		 62 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000144009  hitchhiker  0.0000321766 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1603  hypothetical protein  35.56 
 
 		 63 aa  40.8  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.101159  normal  0.305668 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0694  hypothetical protein  38.46 
 
 		 62 aa  40.4  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000619978  hitchhiker  0.0000301023 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>