20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5669 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5669  hypothetical protein  100 
 
 
61 aa  121  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.319752  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65260  hypothetical protein  98.36 
 
 
61 aa  120  5e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07580  hypothetical protein  74 
 
 
61 aa  75.5  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0639  hypothetical protein  74 
 
 
61 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00779796 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2663  hypothetical protein  49.18 
 
 
61 aa  64.7  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1224  hypothetical protein  50 
 
 
66 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000343082  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1068  hypothetical protein  51.85 
 
 
66 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.676  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0443  hypothetical protein  50 
 
 
61 aa  53.9  0.0000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.270929  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1987  hypothetical protein  50 
 
 
62 aa  52.4  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.186751  normal  0.0674172 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3381  hypothetical protein  41.51 
 
 
61 aa  52.8  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1160  hypothetical protein  52.17 
 
 
66 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.595805 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2298  hypothetical protein  41.38 
 
 
62 aa  49.3  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.126182  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1092  hypothetical protein  43.14 
 
 
63 aa  48.9  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1585  hypothetical protein  50 
 
 
61 aa  47.8  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.60479  unclonable  0.000000160377 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2976  hypothetical protein  48.84 
 
 
61 aa  47.8  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.707976 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2009  Protein of unknown function DUF2065  39.22 
 
 
62 aa  47.4  0.00007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0115757  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0662  hypothetical protein  46.3 
 
 
63 aa  47.4  0.00008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.743687  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00584  hypothetical protein  40.38 
 
 
60 aa  43.9  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0901  hypothetical protein  44.26 
 
 
63 aa  40  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.28384  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2196  hypothetical protein  48.84 
 
 
62 aa  40  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>