31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1987 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1987  hypothetical protein  100 
 
 		 62 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.186751  normal  0.0674172 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2599  hypothetical protein  59.32 
 
 		 62 aa  70.5  0.000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.483175  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3381  hypothetical protein  51.67 
 
 		 61 aa  68.2  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1881  hypothetical protein  60.34 
 
 		 62 aa  67  0.00000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.418167  normal  0.891396 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0443  hypothetical protein  62 
 
 		 61 aa  65.5  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.270929  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2298  hypothetical protein  58.82 
 
 		 62 aa  62  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.126182  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1068  hypothetical protein  52.73 
 
 		 66 aa  62  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.676  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07580  hypothetical protein  58 
 
 		 61 aa  60.5  0.000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1160  hypothetical protein  52.94 
 
 		 66 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.595805 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1224  hypothetical protein  52.83 
 
 		 66 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000343082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2859  hypothetical protein  71.74 
 
 		 62 aa  58.9  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2196  hypothetical protein  60.42 
 
 		 62 aa  58.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2976  hypothetical protein  53.06 
 
 		 61 aa  57.4  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.707976 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1585  hypothetical protein  50 
 
 		 61 aa  57  0.00000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.60479  unclonable  0.000000160377 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1099  hypothetical protein  47.37 
 
 		 59 aa  54.3  0.0000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2663  hypothetical protein  45.28 
 
 		 61 aa  54.3  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5669  hypothetical protein  49.12 
 
 		 61 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.319752  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1179  hypothetical protein  47.37 
 
 		 59 aa  53.9  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.473482 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65260  hypothetical protein  49.12 
 
 		 61 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0639  hypothetical protein  54 
 
 		 61 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00779796 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1092  hypothetical protein  38.98 
 
 		 63 aa  50.8  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0662  hypothetical protein  51.85 
 
 		 63 aa  46.6  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.743687  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2762  hypothetical protein  39.34 
 
 		 68 aa  43.9  0.0008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00943153  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0605  hypothetical protein  50 
 
 		 62 aa  43.9  0.0008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.223312 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0694  hypothetical protein  37.04 
 
 		 62 aa  41.6  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000619978  hitchhiker  0.0000301023 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0508  hypothetical protein  36.67 
 
 		 90 aa  42  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000452311  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002263  protein YjeT  27.87 
 
 		 61 aa  41.6  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.011306  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0680  hypothetical protein  37.04 
 
 		 62 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000282056  hitchhiker  0.000229174 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3267  hypothetical protein  37.04 
 
 		 62 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000144009  hitchhiker  0.0000321766 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00090  hypothetical protein  27.87 
 
 		 62 aa  41.2  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3938  hypothetical protein  37.04 
 
 		 62 aa  40.8  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>