27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2859 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2859  hypothetical protein  100 
 
 		 62 aa  119  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1987  hypothetical protein  72 
 
 		 62 aa  79  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.186751  normal  0.0674172 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2599  hypothetical protein  60 
 
 		 62 aa  72.8  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.483175  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3381  hypothetical protein  55 
 
 		 61 aa  68.2  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1881  hypothetical protein  57.89 
 
 		 62 aa  68.2  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.418167  normal  0.891396 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2298  hypothetical protein  54.72 
 
 		 62 aa  66.2  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.126182  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2976  hypothetical protein  57.14 
 
 		 61 aa  64.3  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.707976 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1068  hypothetical protein  47.37 
 
 		 66 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0443  hypothetical protein  56 
 
 		 61 aa  59.3  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.270929  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1224  hypothetical protein  51.85 
 
 		 66 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000343082  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1160  hypothetical protein  47.17 
 
 		 66 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.595805 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2196  hypothetical protein  54.17 
 
 		 62 aa  57.4  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1585  hypothetical protein  46 
 
 		 61 aa  54.3  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.60479  unclonable  0.000000160377 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1099  hypothetical protein  52.17 
 
 		 59 aa  53.1  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65260  hypothetical protein  45.28 
 
 		 61 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07580  hypothetical protein  50 
 
 		 61 aa  53.5  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1179  hypothetical protein  52.17 
 
 		 59 aa  52.8  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.473482 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5669  hypothetical protein  45.28 
 
 		 61 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.319752  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0662  hypothetical protein  48.39 
 
 		 63 aa  52  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.743687  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1092  hypothetical protein  41.82 
 
 		 63 aa  51.2  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2663  hypothetical protein  35 
 
 		 61 aa  45.4  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0605  hypothetical protein  51.28 
 
 		 62 aa  44.3  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.223312 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00584  hypothetical protein  35.59 
 
 		 60 aa  43.5  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0639  hypothetical protein  44.19 
 
 		 61 aa  41.6  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00779796 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2009  Protein of unknown function DUF2065  35.09 
 
 		 62 aa  41.2  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0115757  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0901  hypothetical protein  44.68 
 
 		 63 aa  40  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.28384  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0508  hypothetical protein  37.5 
 
 		 90 aa  40  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000452311  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>