31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2196 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2196  hypothetical protein  100 
 
 		 62 aa  117  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2298  hypothetical protein  62.9 
 
 		 62 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.126182  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1881  hypothetical protein  58.06 
 
 		 62 aa  73.6  0.0000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.418167  normal  0.891396 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2599  hypothetical protein  62.07 
 
 		 62 aa  72.4  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.483175  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1179  hypothetical protein  67.92 
 
 		 59 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.473482 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1099  hypothetical protein  66.04 
 
 		 59 aa  67.4  0.00000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3381  hypothetical protein  50 
 
 		 61 aa  63.2  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1224  hypothetical protein  57.41 
 
 		 66 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000343082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1068  hypothetical protein  54.24 
 
 		 66 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1092  hypothetical protein  50 
 
 		 63 aa  61.2  0.000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1160  hypothetical protein  54.9 
 
 		 66 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.595805 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1987  hypothetical protein  60.42 
 
 		 62 aa  59.3  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.186751  normal  0.0674172 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1585  hypothetical protein  58.14 
 
 		 61 aa  57.4  0.00000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.60479  unclonable  0.000000160377 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2976  hypothetical protein  54.76 
 
 		 61 aa  55.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.707976 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0443  hypothetical protein  53.49 
 
 		 61 aa  52.4  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.270929  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00090  hypothetical protein  44.44 
 
 		 62 aa  51.2  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07580  hypothetical protein  58.14 
 
 		 61 aa  50.8  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2663  hypothetical protein  44.83 
 
 		 61 aa  49.7  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002263  protein YjeT  42.31 
 
 		 61 aa  49.7  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.011306  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0662  hypothetical protein  48.08 
 
 		 63 aa  48.1  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.743687  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65260  hypothetical protein  50.98 
 
 		 61 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5669  hypothetical protein  50.98 
 
 		 61 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.319752  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2762  hypothetical protein  37.93 
 
 		 68 aa  45.4  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00943153  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0605  hypothetical protein  55 
 
 		 62 aa  45.1  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.223312 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0901  hypothetical protein  48.84 
 
 		 63 aa  43.9  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.28384  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2773  hypothetical protein  32.2 
 
 		 61 aa  42.4  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2009  Protein of unknown function DUF2065  39.22 
 
 		 62 aa  42.7  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0115757  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2859  hypothetical protein  51.52 
 
 		 62 aa  42  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02634  hypothetical protein  38.89 
 
 		 61 aa  41.2  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3267  hypothetical protein  37.93 
 
 		 62 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000144009  hitchhiker  0.0000321766 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0680  hypothetical protein  37.93 
 
 		 62 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000282056  hitchhiker  0.000229174 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>