24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1179 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1179  hypothetical protein  100 
 
 		 59 aa  114  3.9999999999999997e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.473482 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1099  hypothetical protein  98.31 
 
 		 59 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2196  hypothetical protein  71.74 
 
 		 62 aa  67  0.00000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2298  hypothetical protein  61.54 
 
 		 62 aa  65.1  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.126182  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2599  hypothetical protein  58.82 
 
 		 62 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.483175  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1881  hypothetical protein  60.42 
 
 		 62 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.418167  normal  0.891396 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3381  hypothetical protein  41.38 
 
 		 61 aa  55.1  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1585  hypothetical protein  43.75 
 
 		 61 aa  52.8  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.60479  unclonable  0.000000160377 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2976  hypothetical protein  51.22 
 
 		 61 aa  51.6  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.707976 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1987  hypothetical protein  53.33 
 
 		 62 aa  50.1  0.000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.186751  normal  0.0674172 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2009  Protein of unknown function DUF2065  38.33 
 
 		 62 aa  47.8  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0115757  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1092  hypothetical protein  40.38 
 
 		 63 aa  47.4  0.00006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1160  hypothetical protein  45.1 
 
 		 66 aa  47.8  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.595805 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00090  hypothetical protein  36.84 
 
 		 62 aa  47.4  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1224  hypothetical protein  43.48 
 
 		 66 aa  47.4  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000343082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002263  protein YjeT  35.09 
 
 		 61 aa  46.6  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.011306  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1068  hypothetical protein  43.14 
 
 		 66 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0443  hypothetical protein  47.73 
 
 		 61 aa  46.2  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.270929  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2773  hypothetical protein  43.9 
 
 		 61 aa  45.4  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2859  hypothetical protein  61.29 
 
 		 62 aa  45.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2762  hypothetical protein  44.23 
 
 		 68 aa  44.3  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00943153  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07580  hypothetical protein  47.73 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2663  hypothetical protein  37.5 
 
 		 61 aa  42  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0662  hypothetical protein  38.78 
 
 		 63 aa  40.4  0.008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.743687  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>