29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0662 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0662  hypothetical protein  100 
 
 		 63 aa  121  4e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.743687  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1092  hypothetical protein  48.15 
 
 		 63 aa  57.8  0.00000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1068  hypothetical protein  52.83 
 
 		 66 aa  52.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.676  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1224  hypothetical protein  49.06 
 
 		 66 aa  52.4  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000343082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0901  hypothetical protein  51.06 
 
 		 63 aa  52  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.28384  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1160  hypothetical protein  51.02 
 
 		 66 aa  50.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.595805 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3381  hypothetical protein  46.55 
 
 		 61 aa  50.1  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1881  hypothetical protein  44.83 
 
 		 62 aa  48.9  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.418167  normal  0.891396 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2298  hypothetical protein  37.7 
 
 		 62 aa  48.5  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.126182  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2460  hypothetical protein  40.98 
 
 		 61 aa  48.5  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.122059 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65260  hypothetical protein  46.3 
 
 		 61 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5669  hypothetical protein  46.3 
 
 		 61 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.319752  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2663  hypothetical protein  41.38 
 
 		 61 aa  47  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1987  hypothetical protein  52.17 
 
 		 62 aa  47  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.186751  normal  0.0674172 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1585  hypothetical protein  52.08 
 
 		 61 aa  45.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.60479  unclonable  0.000000160377 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2196  hypothetical protein  50 
 
 		 62 aa  44.7  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0443  hypothetical protein  50 
 
 		 61 aa  44.3  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.270929  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07580  hypothetical protein  46.81 
 
 		 61 aa  43.9  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4003  hypothetical protein  41.67 
 
 		 66 aa  44.3  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.381158  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1575  hypothetical protein  40.98 
 
 		 61 aa  43.5  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2040  hypothetical protein  38.33 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1796  hypothetical protein  36.07 
 
 		 61 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3350  hypothetical protein  38.33 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.699781  normal  0.141895 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1099  hypothetical protein  40.82 
 
 		 59 aa  42  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2599  hypothetical protein  39.66 
 
 		 62 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.483175  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1351  hypothetical protein  37.7 
 
 		 77 aa  41.2  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.731742  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1395  hypothetical protein  37.7 
 
 		 61 aa  41.2  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.498528  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1179  hypothetical protein  38.78 
 
 		 59 aa  40.4  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.473482 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3260  hypothetical protein  37.1 
 
 		 66 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0517932  normal  0.319323 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>