28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1575 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1575  hypothetical protein  100 
 
 
61 aa  120  8e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162376  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0082  hypothetical protein  43.1 
 
 
61 aa  52.4  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0469897  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2495  hypothetical protein  44.07 
 
 
68 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3260  hypothetical protein  39.66 
 
 
66 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0517932  normal  0.319323 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3350  hypothetical protein  37.93 
 
 
66 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.699781  normal  0.141895 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2040  hypothetical protein  36.21 
 
 
66 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2347  hypothetical protein  41.38 
 
 
66 aa  47  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00811131  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2726  hypothetical protein  38.98 
 
 
66 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.384883  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4003  hypothetical protein  36.21 
 
 
66 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.381158  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0563  hypothetical protein  41.38 
 
 
67 aa  45.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0507381  normal  0.664237 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02634  hypothetical protein  42.37 
 
 
61 aa  46.2  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1896  hypothetical protein  50 
 
 
62 aa  45.4  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000204833  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6095  hypothetical protein  33.9 
 
 
68 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1796  hypothetical protein  36.07 
 
 
61 aa  45.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1351  hypothetical protein  36.07 
 
 
77 aa  44.7  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.731742  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1395  hypothetical protein  36.07 
 
 
61 aa  44.7  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.498528  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2016  hypothetical protein  37.7 
 
 
61 aa  44.3  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1785  hypothetical protein  40 
 
 
91 aa  44.3  0.0006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1720  hypothetical protein  40 
 
 
61 aa  43.9  0.0007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0211  hypothetical protein  51.72 
 
 
67 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.480417  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1747  hypothetical protein  34.43 
 
 
61 aa  43.9  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2460  hypothetical protein  40.98 
 
 
61 aa  43.5  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.122059 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1662  hypothetical protein  36.67 
 
 
62 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.754821  normal  0.135565 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0662  hypothetical protein  40.98 
 
 
63 aa  43.5  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.743687  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1068  hypothetical protein  40.68 
 
 
66 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.676  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1224  hypothetical protein  42.11 
 
 
66 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000343082  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3381  hypothetical protein  36.21 
 
 
61 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2734  hypothetical protein  39.66 
 
 
64 aa  41.2  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0308195  normal  0.0352874 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>