15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2726 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_2726  hypothetical protein  100 
 
 
66 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.384883  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2347  hypothetical protein  86.36 
 
 
66 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00811131  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3260  hypothetical protein  80.3 
 
 
66 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0517932  normal  0.319323 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6095  hypothetical protein  68.18 
 
 
68 aa  97.8  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4003  hypothetical protein  68.18 
 
 
66 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.381158  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2040  hypothetical protein  65.15 
 
 
66 aa  93.6  7e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3350  hypothetical protein  63.64 
 
 
66 aa  89.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.699781  normal  0.141895 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1796  hypothetical protein  40.68 
 
 
61 aa  54.3  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1395  hypothetical protein  42.37 
 
 
61 aa  53.1  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.498528  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1351  hypothetical protein  42.37 
 
 
77 aa  53.5  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.731742  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1747  hypothetical protein  37.29 
 
 
61 aa  50.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2016  hypothetical protein  40.68 
 
 
61 aa  47.4  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1575  hypothetical protein  38.98 
 
 
61 aa  46.6  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162376  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1662  hypothetical protein  37.29 
 
 
62 aa  45.4  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.754821  normal  0.135565 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2460  hypothetical protein  41.38 
 
 
61 aa  44.7  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.122059 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>